梨小食心蟲幼蟲中腸消化酶和解毒酶相關(guān)基因挖掘
發(fā)布時間:2021-03-25 21:42
梨小食心蟲Grapholitha molesta(Busck)是一種能危害多種薔薇科果樹嫩梢和果實的世界性害蟲。它具有典型的季節(jié)性轉(zhuǎn)移寄主危害的特點,使得梨小食心蟲常猖獗成災(zāi)。梨小食心蟲的防治過度依賴于化學(xué)農(nóng)藥,使得殺傷天敵、污染環(huán)境、農(nóng)藥殘留和抗性產(chǎn)生等問題日益嚴重,尋求高效無公害的生物防治方法顯得尤為重要。中腸作為昆蟲消化和解毒代謝的主要組織器官,在昆蟲取食和消化不同寄主植物、生長發(fā)育及防御外源有毒物質(zhì)的過程中起著重要作用,探究以中腸消化酶和解毒酶為靶標的生物農(nóng)藥具有重要意義。本研究通過高通量測序技術(shù),對梨小食心蟲幼蟲中腸進行轉(zhuǎn)錄組測序分析,挖掘高表達的消化酶和解毒酶相關(guān)基因,分析了其在不同齡期梨小食心蟲幼蟲中腸中的表達情況,為以后以中腸消化酶和解毒酶為靶標的害蟲生物防治奠定一定的理論基礎(chǔ)。取得的具體研究結(jié)果如下:(1)通過二代測序平臺對梨小食心蟲中腸的轉(zhuǎn)錄組進行高通量測序,共獲得unigenes 96 419條,比對公共數(shù)據(jù)庫,57 300條unigenes被成功注釋。GO分類中,分為三大類生物學(xué)進程、細胞組分和分子功能的55個功能區(qū),其中unigenes比例較大的是細胞進程、細...
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
1.1 梨小食心蟲的研究進展
1.1.1 梨小食心蟲的危害與發(fā)生規(guī)律
1.1.2 梨小食心蟲生長與環(huán)境的關(guān)系
1.1.3 梨小食心蟲的飼養(yǎng)與防治研究
1.2 昆蟲中腸消化酶和解毒酶研究進展
1.2.1 昆蟲中腸消化酶的研究
1.2.2 昆蟲中腸解毒酶的研究
1.3 轉(zhuǎn)錄組測序及其在昆蟲學(xué)研究中的應(yīng)用
1.3.1 轉(zhuǎn)錄組測序的發(fā)展與優(yōu)勢
1.3.2 轉(zhuǎn)錄組測序的原理
1.3.3 轉(zhuǎn)錄組測序在昆蟲中的應(yīng)用
1.4 研究目的與意義
1.5 研究內(nèi)容及技術(shù)路線
第二章 實驗材料和方法
2.1 實驗材料
2.1.1 供試昆蟲
2.1.2 主要儀器
2.1.3 主要試劑
2.2 實驗方法
2.2.1 梨小食心蟲幼蟲中腸轉(zhuǎn)錄組測序及SSR分子標記分析
2.2.2 梨小食心蟲中腸高表達基因分析
2.2.3 梨小食心蟲中腸消化酶、解毒酶相關(guān)基因的表達量檢測
第三章 結(jié)果與分析
3.1 梨小食心蟲幼蟲中腸RNA-Seq及轉(zhuǎn)錄組de novo組裝
3.2 梨小食心蟲幼蟲中腸Unigenes注釋
3.3 梨小食心蟲幼蟲中腸轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
3.3.1 同源性分析
3.3.2 Unigenes的KOG分析
3.3.3 Unigenes的GO分類
3.3.4 Unigenes的KEGG分類
3.4 梨小食心蟲幼蟲中腸SSR分子標記挖掘
3.5 梨小食心蟲幼蟲中腸轉(zhuǎn)錄組高表達分析
3.5.1 高表達基因的GO分類
3.5.2 高表達基因的KEGG通路分析
3.6 梨小食心蟲幼蟲中腸高表達基因篩選
3.6.1 消化酶高表達基因的篩選
3.6.2 解毒酶高表達基因的篩選
3.7 消化酶、解毒酶基因在不同齡期梨小食心蟲幼蟲中腸的表達量
3.7.1 梨小食心蟲中腸RNA的提取
3.7.2 消化酶基因在不同齡期梨小食心蟲幼蟲中腸的表達量
3.7.3 解毒酶基因在不同齡期梨小食心蟲幼蟲中腸的表達量
第四章 結(jié)論
第五章 討論
5.1 梨小食心蟲幼蟲中腸轉(zhuǎn)錄組及SSR分子標記分析
5.2 梨小食心蟲中腸高表達基因分析
5.3 消化酶、解毒酶基因在不同齡期梨小食心蟲幼蟲中腸的表達量
參考文獻
致謝
個人簡歷
【參考文獻】:
期刊論文
[1]米象GST基因的表達及其對磷化氫的應(yīng)答[J]. 葉侃,胡飛,魏兆軍. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(08)
[2]甜菜夜蛾細胞色素P450基因的克隆與分析[J]. 袁遠,高熹,張連根,倪峰,高儼,吳毅歆,喜超,朱家位. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2019(02)
[3]二化螟兩種P450基因CYP4M38和CYP4M39的時空表達分析[J]. 白琪,魯艷輝,鄭許松,呂仲賢. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2018(04)
[4]梨小食心蟲谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶GmolGST6的基因克隆、原核表達和酶學(xué)特征[J]. 李帥,蘇麗,李伯遼,李怡萍,李廣偉,仵均祥. 昆蟲學(xué)報. 2018(04)
[5]綠豆象觸角轉(zhuǎn)錄組及嗅覺相關(guān)基因的分析[J]. 鄭海霞,張耀文,張仙紅,楊美紅. 昆蟲學(xué)報. 2018(02)
[6]兩種農(nóng)藥不同亞致死濃度對梨小食心蟲生長發(fā)育和繁殖的影響[J]. 庾琴,封云濤,杜恩強,郭曉君,郭貴明,張潤祥. 植物保護. 2018(01)
[7]中華蜜蜂幼蟲腸道的高表達基因分析[J]. 解彥玲,王鴻權(quán),張璐,侯志賢,刀晨,江亮亮,熊翠玲,鄭燕珍,徐細建,黃枳腱,郭睿,陳大福. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2017(09)
[8]中華按蚊八個羧肽酶基因的鑒定及其與吸血餐相關(guān)的表達分析(英文)[J]. 史宗畔,支中婧,羅世惠,陳斌,何正波. 昆蟲學(xué)報. 2017(06)
[9]應(yīng)用轉(zhuǎn)錄組測序高通量發(fā)掘東方粘蟲SSR標記[J]. 李微,張蕾,程云霞,羅禮智,江幸福. 植物保護學(xué)報. 2017(03)
[10]中華蜜蜂幼蟲腸道參考轉(zhuǎn)錄組的de novo組裝及SSR分子標記鑒定[J]. 徐細建,郭睿,駱群,熊翠玲,梁勤,張串聯(lián),鄭燕珍,張曌楠,黃枳腱,張璐,李汶東,陳大福. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(06)
博士論文
[1]白假絲酵母菌侵染家蠅幼蟲中腸轉(zhuǎn)錄組及圍食膜蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 王宇.貴州醫(yī)科大學(xué) 2016
[2]桔小實蠅消化和解毒代謝相關(guān)基因鑒定及其對藥劑脅迫的應(yīng)激反應(yīng)[D]. 申光茂.西南大學(xué) 2013
碩士論文
[1]粘蟲細胞色素P450的克隆和特性分析[D]. 劉月慶.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]梨小食心蟲幼蟲中腸胰蛋白酶活性、表達量及與生長發(fā)育的關(guān)系研究[D]. 趙愛平.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017
[3]基于二代測序的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析方法的比較研究[D]. 石浩然.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]稻縱卷葉螟轉(zhuǎn)錄組及幾丁質(zhì)代謝途徑和抗藥性基因鑒定[D]. 余海中.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[5]兩種入侵型煙粉虱隱種中腸轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 葉曉冬.浙江大學(xué) 2014
[6]小菜蛾中腸絲氨酸蛋白酶基因的克隆、轉(zhuǎn)錄及其酶活的研究[D]. 祝妮.浙江大學(xué) 2013
[7]寄主因子對梨小食心蟲的發(fā)生、生長發(fā)育及其產(chǎn)卵選擇性的影響[D]. 楊小凡.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[8]陜西古代果樹史研究[D]. 劉得騰.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2010
本文編號:3100373
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
1.1 梨小食心蟲的研究進展
1.1.1 梨小食心蟲的危害與發(fā)生規(guī)律
1.1.2 梨小食心蟲生長與環(huán)境的關(guān)系
1.1.3 梨小食心蟲的飼養(yǎng)與防治研究
1.2 昆蟲中腸消化酶和解毒酶研究進展
1.2.1 昆蟲中腸消化酶的研究
1.2.2 昆蟲中腸解毒酶的研究
1.3 轉(zhuǎn)錄組測序及其在昆蟲學(xué)研究中的應(yīng)用
1.3.1 轉(zhuǎn)錄組測序的發(fā)展與優(yōu)勢
1.3.2 轉(zhuǎn)錄組測序的原理
1.3.3 轉(zhuǎn)錄組測序在昆蟲中的應(yīng)用
1.4 研究目的與意義
1.5 研究內(nèi)容及技術(shù)路線
第二章 實驗材料和方法
2.1 實驗材料
2.1.1 供試昆蟲
2.1.2 主要儀器
2.1.3 主要試劑
2.2 實驗方法
2.2.1 梨小食心蟲幼蟲中腸轉(zhuǎn)錄組測序及SSR分子標記分析
2.2.2 梨小食心蟲中腸高表達基因分析
2.2.3 梨小食心蟲中腸消化酶、解毒酶相關(guān)基因的表達量檢測
第三章 結(jié)果與分析
3.1 梨小食心蟲幼蟲中腸RNA-Seq及轉(zhuǎn)錄組de novo組裝
3.2 梨小食心蟲幼蟲中腸Unigenes注釋
3.3 梨小食心蟲幼蟲中腸轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
3.3.1 同源性分析
3.3.2 Unigenes的KOG分析
3.3.3 Unigenes的GO分類
3.3.4 Unigenes的KEGG分類
3.4 梨小食心蟲幼蟲中腸SSR分子標記挖掘
3.5 梨小食心蟲幼蟲中腸轉(zhuǎn)錄組高表達分析
3.5.1 高表達基因的GO分類
3.5.2 高表達基因的KEGG通路分析
3.6 梨小食心蟲幼蟲中腸高表達基因篩選
3.6.1 消化酶高表達基因的篩選
3.6.2 解毒酶高表達基因的篩選
3.7 消化酶、解毒酶基因在不同齡期梨小食心蟲幼蟲中腸的表達量
3.7.1 梨小食心蟲中腸RNA的提取
3.7.2 消化酶基因在不同齡期梨小食心蟲幼蟲中腸的表達量
3.7.3 解毒酶基因在不同齡期梨小食心蟲幼蟲中腸的表達量
第四章 結(jié)論
第五章 討論
5.1 梨小食心蟲幼蟲中腸轉(zhuǎn)錄組及SSR分子標記分析
5.2 梨小食心蟲中腸高表達基因分析
5.3 消化酶、解毒酶基因在不同齡期梨小食心蟲幼蟲中腸的表達量
參考文獻
致謝
個人簡歷
【參考文獻】:
期刊論文
[1]米象GST基因的表達及其對磷化氫的應(yīng)答[J]. 葉侃,胡飛,魏兆軍. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(08)
[2]甜菜夜蛾細胞色素P450基因的克隆與分析[J]. 袁遠,高熹,張連根,倪峰,高儼,吳毅歆,喜超,朱家位. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2019(02)
[3]二化螟兩種P450基因CYP4M38和CYP4M39的時空表達分析[J]. 白琪,魯艷輝,鄭許松,呂仲賢. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2018(04)
[4]梨小食心蟲谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶GmolGST6的基因克隆、原核表達和酶學(xué)特征[J]. 李帥,蘇麗,李伯遼,李怡萍,李廣偉,仵均祥. 昆蟲學(xué)報. 2018(04)
[5]綠豆象觸角轉(zhuǎn)錄組及嗅覺相關(guān)基因的分析[J]. 鄭海霞,張耀文,張仙紅,楊美紅. 昆蟲學(xué)報. 2018(02)
[6]兩種農(nóng)藥不同亞致死濃度對梨小食心蟲生長發(fā)育和繁殖的影響[J]. 庾琴,封云濤,杜恩強,郭曉君,郭貴明,張潤祥. 植物保護. 2018(01)
[7]中華蜜蜂幼蟲腸道的高表達基因分析[J]. 解彥玲,王鴻權(quán),張璐,侯志賢,刀晨,江亮亮,熊翠玲,鄭燕珍,徐細建,黃枳腱,郭睿,陳大福. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2017(09)
[8]中華按蚊八個羧肽酶基因的鑒定及其與吸血餐相關(guān)的表達分析(英文)[J]. 史宗畔,支中婧,羅世惠,陳斌,何正波. 昆蟲學(xué)報. 2017(06)
[9]應(yīng)用轉(zhuǎn)錄組測序高通量發(fā)掘東方粘蟲SSR標記[J]. 李微,張蕾,程云霞,羅禮智,江幸福. 植物保護學(xué)報. 2017(03)
[10]中華蜜蜂幼蟲腸道參考轉(zhuǎn)錄組的de novo組裝及SSR分子標記鑒定[J]. 徐細建,郭睿,駱群,熊翠玲,梁勤,張串聯(lián),鄭燕珍,張曌楠,黃枳腱,張璐,李汶東,陳大福. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(06)
博士論文
[1]白假絲酵母菌侵染家蠅幼蟲中腸轉(zhuǎn)錄組及圍食膜蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 王宇.貴州醫(yī)科大學(xué) 2016
[2]桔小實蠅消化和解毒代謝相關(guān)基因鑒定及其對藥劑脅迫的應(yīng)激反應(yīng)[D]. 申光茂.西南大學(xué) 2013
碩士論文
[1]粘蟲細胞色素P450的克隆和特性分析[D]. 劉月慶.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]梨小食心蟲幼蟲中腸胰蛋白酶活性、表達量及與生長發(fā)育的關(guān)系研究[D]. 趙愛平.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017
[3]基于二代測序的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析方法的比較研究[D]. 石浩然.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]稻縱卷葉螟轉(zhuǎn)錄組及幾丁質(zhì)代謝途徑和抗藥性基因鑒定[D]. 余海中.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[5]兩種入侵型煙粉虱隱種中腸轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 葉曉冬.浙江大學(xué) 2014
[6]小菜蛾中腸絲氨酸蛋白酶基因的克隆、轉(zhuǎn)錄及其酶活的研究[D]. 祝妮.浙江大學(xué) 2013
[7]寄主因子對梨小食心蟲的發(fā)生、生長發(fā)育及其產(chǎn)卵選擇性的影響[D]. 楊小凡.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[8]陜西古代果樹史研究[D]. 劉得騰.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2010
本文編號:3100373
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