菜豆普通花葉病毒(BCMV)花生條紋株系復(fù)制和翻譯調(diào)控的初步研究
發(fā)布時(shí)間:2021-03-23 14:56
菜豆普通花葉病毒(Bean common mosaic virus,BCMV)為馬鈴薯Y病毒科(Pot yviridae)、馬鈴薯Y病毒屬(Potyvirus)成員,病毒粒體呈線狀,含有1條正義單鏈RNA,5’端沒有帽子結(jié)構(gòu)但帶有病毒基因組結(jié)合蛋白VPg,3’端有poly(A)尾;基因組全長(zhǎng)約10 kb,包含一個(gè)大的開放閱讀框,編碼一個(gè)多聚蛋白,此多聚蛋白經(jīng)蛋白酶切割產(chǎn)生10個(gè)成熟的功能蛋白,其中Nib蛋白具有依賴于RNA的RNA聚合酶(RdRp)活性,負(fù)責(zé)基因組正負(fù)鏈間的復(fù)制。通過RACE技術(shù),克隆來自山東不同地區(qū)花生樣品中的BCMV 5’UTR及3’UTR序列;發(fā)現(xiàn)BCMV的5’UTR及3’UTR序列比較保守,但3’UTR的poly(A)存在長(zhǎng)度差異。通過構(gòu)建螢火蟲熒光素酶(Fluc)的融合載體,分析了BCMV 5’UTR和3’UTR對(duì)不依賴帽子翻譯的調(diào)控作用。(1)BCMV的5’UTR對(duì)翻譯有明顯的正調(diào)控作用,表明其具備IRES活性;突變分析顯示其調(diào)控翻譯的核心區(qū)域位于5’末端的第一個(gè)大莖環(huán)。(2)3’UTR對(duì)5’UTR的翻譯正調(diào)控起抑制作用,可能原因是3’UTR和5’UTR間存...
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:65 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
BCMV的基因組結(jié)構(gòu)
德鎮(zhèn)(JN)四個(gè)地區(qū)采集的花生發(fā)病部位的植物總 RNA(圖2),利用 RT-PCR檢測(cè) BCMV,所用引物為 PS-9619-F和 Q0(附表 1)。RT-PCR產(chǎn)物的電泳結(jié)果顯示,花生條紋病疑似癥狀的花生總 RNA中可以檢測(cè)到對(duì)應(yīng)的 BCMV片段,PCR產(chǎn)物長(zhǎng)度約為 500 bp(圖 3),與目的擴(kuò)增片段的大小相符(圖 3)并經(jīng)過測(cè)序確認(rèn)。圖 2不同地區(qū)花生病樣的總 RNAHMW:泰安化馬灣;QJD:泰安邱家店;JN:濟(jì)南萬德鎮(zhèn);QD:青島萊西Fig.2 Total RNA of peanut samples from differentiability locationsHMW:Huamawan,Taian;QJD:Qiujiadian Taian;JN:Wande Jinan;QD:Laixi Qingdao.圖 3 BCMV的 RT-PCR 檢測(cè)HMW:泰安化馬灣;QJD:泰安邱家店;JN:濟(jì)南萬德鎮(zhèn);QD:青島萊西Fig.3 Detection of BCMV by RT-PCRM:DL5000 DNA Marker;HMW:Huamawan,Taian;QJD:Qiujiadian Taian;JN:Wande Jinan;QD:Laixi Qingdao
0,花生條紋病疑似癥狀的花生總 RNA中可以檢測(cè)約為 500 bp(圖 3),與目的擴(kuò)增片段的大小相符圖 2不同地區(qū)花生病樣的總 RNAW:泰安化馬灣;QJD:泰安邱家店;JN:濟(jì)南萬德鎮(zhèn);QD:青島Fig.2 Total RNA of peanut samples from differentiability locations:Huamawan,Taian;QJD:Qiujiadian Taian;JN:Wande Jinan;QD:Laixi QHMW QJD JN QD
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]煙草番茄斑萎病毒病防治措施[J]. 李四光,何孝兵,楊亞,丁偉. 植物醫(yī)生. 2015(06)
[2]2014年云南番茄、辣椒上番茄斑萎病毒屬病毒與傳毒薊馬的發(fā)生特點(diǎn)[J]. 鄭雪,陳永對(duì),吳闊,張麗珍,蘇曉霞,鄭寬瑜,張潔,董家紅. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2015(03)
[3]番茄斑萎病毒屬病毒非結(jié)構(gòu)蛋白NSs的生物信息學(xué)分析[J]. 鄭寬瑜,董家紅,蘇曉霞,方琦,鄭雪,張仲凱. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(02)
[4]6種殺蟲劑對(duì)煙田番茄斑萎病毒屬病毒傳毒薊馬的藥效試驗(yàn)[J]. 張潔,陳永對(duì),吳闊,劉春明,肖俊華,鄭雪,董家紅,李宏光. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(04)
[5]植物中依賴RNA的RNA聚合酶6(RDR6)研究進(jìn)展[J]. 吳冰月,陳華濤,許曉明,崔瑾,陳新. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2013(S1)
[6]昆明番茄斑萎病毒不同分離物N基因遺傳多樣性分析[J]. 尹躍艷,董家紅,徐興陽(yáng),端永明,張仲凱. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2013(01)
[7]北京地區(qū)發(fā)現(xiàn)番茄斑萎病毒[J]. 李飛,吳青君,徐寶云,謝文,王少麗,張友軍. 植物保護(hù). 2012(06)
[8]番茄斑萎病毒TSWV的鑒定及抗病種質(zhì)的篩選[J]. 邱樹亮,王孝宣,杜永臣,高建昌,國(guó)艷梅,朱德蔚,胡鴻,李寶聚,石延霞. 園藝學(xué)報(bào). 2012(06)
[9]西花薊馬傳播番茄斑萎病毒研究進(jìn)展[J]. 楊帆,劉萬學(xué),張國(guó)安,萬方浩. 環(huán)境昆蟲學(xué)報(bào). 2011(02)
[10]寄主植物接種番茄斑萎病毒對(duì)西花薊馬種群的影響[J]. 朱秀娟,張治軍,呂要斌. 昆蟲學(xué)報(bào). 2011(04)
碩士論文
[1]西花薊馬在不同寄主植物上對(duì)番茄斑萎病毒傳播效率的研究[D]. 張玉秀.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]花生條紋病毒分子變異分析和馬鈴薯Y病毒蛋白的表達(dá)純化[D]. 侯珊珊.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
本文編號(hào):3095992
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:65 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
BCMV的基因組結(jié)構(gòu)
德鎮(zhèn)(JN)四個(gè)地區(qū)采集的花生發(fā)病部位的植物總 RNA(圖2),利用 RT-PCR檢測(cè) BCMV,所用引物為 PS-9619-F和 Q0(附表 1)。RT-PCR產(chǎn)物的電泳結(jié)果顯示,花生條紋病疑似癥狀的花生總 RNA中可以檢測(cè)到對(duì)應(yīng)的 BCMV片段,PCR產(chǎn)物長(zhǎng)度約為 500 bp(圖 3),與目的擴(kuò)增片段的大小相符(圖 3)并經(jīng)過測(cè)序確認(rèn)。圖 2不同地區(qū)花生病樣的總 RNAHMW:泰安化馬灣;QJD:泰安邱家店;JN:濟(jì)南萬德鎮(zhèn);QD:青島萊西Fig.2 Total RNA of peanut samples from differentiability locationsHMW:Huamawan,Taian;QJD:Qiujiadian Taian;JN:Wande Jinan;QD:Laixi Qingdao.圖 3 BCMV的 RT-PCR 檢測(cè)HMW:泰安化馬灣;QJD:泰安邱家店;JN:濟(jì)南萬德鎮(zhèn);QD:青島萊西Fig.3 Detection of BCMV by RT-PCRM:DL5000 DNA Marker;HMW:Huamawan,Taian;QJD:Qiujiadian Taian;JN:Wande Jinan;QD:Laixi Qingdao
0,花生條紋病疑似癥狀的花生總 RNA中可以檢測(cè)約為 500 bp(圖 3),與目的擴(kuò)增片段的大小相符圖 2不同地區(qū)花生病樣的總 RNAW:泰安化馬灣;QJD:泰安邱家店;JN:濟(jì)南萬德鎮(zhèn);QD:青島Fig.2 Total RNA of peanut samples from differentiability locations:Huamawan,Taian;QJD:Qiujiadian Taian;JN:Wande Jinan;QD:Laixi QHMW QJD JN QD
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]煙草番茄斑萎病毒病防治措施[J]. 李四光,何孝兵,楊亞,丁偉. 植物醫(yī)生. 2015(06)
[2]2014年云南番茄、辣椒上番茄斑萎病毒屬病毒與傳毒薊馬的發(fā)生特點(diǎn)[J]. 鄭雪,陳永對(duì),吳闊,張麗珍,蘇曉霞,鄭寬瑜,張潔,董家紅. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2015(03)
[3]番茄斑萎病毒屬病毒非結(jié)構(gòu)蛋白NSs的生物信息學(xué)分析[J]. 鄭寬瑜,董家紅,蘇曉霞,方琦,鄭雪,張仲凱. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(02)
[4]6種殺蟲劑對(duì)煙田番茄斑萎病毒屬病毒傳毒薊馬的藥效試驗(yàn)[J]. 張潔,陳永對(duì),吳闊,劉春明,肖俊華,鄭雪,董家紅,李宏光. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(04)
[5]植物中依賴RNA的RNA聚合酶6(RDR6)研究進(jìn)展[J]. 吳冰月,陳華濤,許曉明,崔瑾,陳新. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2013(S1)
[6]昆明番茄斑萎病毒不同分離物N基因遺傳多樣性分析[J]. 尹躍艷,董家紅,徐興陽(yáng),端永明,張仲凱. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2013(01)
[7]北京地區(qū)發(fā)現(xiàn)番茄斑萎病毒[J]. 李飛,吳青君,徐寶云,謝文,王少麗,張友軍. 植物保護(hù). 2012(06)
[8]番茄斑萎病毒TSWV的鑒定及抗病種質(zhì)的篩選[J]. 邱樹亮,王孝宣,杜永臣,高建昌,國(guó)艷梅,朱德蔚,胡鴻,李寶聚,石延霞. 園藝學(xué)報(bào). 2012(06)
[9]西花薊馬傳播番茄斑萎病毒研究進(jìn)展[J]. 楊帆,劉萬學(xué),張國(guó)安,萬方浩. 環(huán)境昆蟲學(xué)報(bào). 2011(02)
[10]寄主植物接種番茄斑萎病毒對(duì)西花薊馬種群的影響[J]. 朱秀娟,張治軍,呂要斌. 昆蟲學(xué)報(bào). 2011(04)
碩士論文
[1]西花薊馬在不同寄主植物上對(duì)番茄斑萎病毒傳播效率的研究[D]. 張玉秀.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]花生條紋病毒分子變異分析和馬鈴薯Y病毒蛋白的表達(dá)純化[D]. 侯珊珊.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
本文編號(hào):3095992
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