發(fā)布時(shí)間：2021-03-20 23:00

　　玉米灰斑病是由玉蜀黍尾孢菌（Cerospora zeae-maydis）、玉米尾孢菌（Cerospora zeina）等引起的的一種葉部病害,目前已成為危害西南地區(qū)玉米生產(chǎn)的重要病害,選育、種植抗灰斑病玉米品種是控制玉米灰斑病發(fā)生的重要手段,而抗性品種的選育依賴于對遺傳背景不同的抗性種質(zhì)資源進(jìn)行表型及基因?qū)用娴暮Y選、鑒定與發(fā)掘。近年來,利用全基因組學(xué)的方法鑒定、分離抗病基因已成為分子抗病育種的主要手段,本研究以345份來源于不同生態(tài)環(huán)境,具有不同遺傳背景的玉米自交系及IBM Syn10群體為供試材料,在自然發(fā)病條件下對上述自交系的玉米灰斑病抗性進(jìn)行鑒定;運(yùn)用SNP分子標(biāo)記技術(shù)分析供試材料的遺傳結(jié)構(gòu)及分子特征;利用全基因組掃描的方法對與玉米灰斑病抗性關(guān)聯(lián)的SNP位點(diǎn)進(jìn)行檢測;利用先前構(gòu)建的IBM Syn10群體的bin map遺傳連鎖圖譜對玉米灰斑病抗性QTL進(jìn)行定位。主要研究結(jié)果如下:1.基于56110個(gè)SNP分子標(biāo)記開展的遺傳多樣性研究,共獲得43070個(gè)高質(zhì)量SNP分子標(biāo)記,覆蓋了整個(gè)染色體組。其中1號染色體上分布最多,共計(jì)6724個(gè),占比15.6%,10號染色體上分布最少,共計(jì)3... 

【文章來源】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：92 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

包含6618個(gè)binmarker的IBMSyn10圖譜

低頻等位基因的頻率分布ncy distribution of nucleotides Fig.3-2 Frenquency distribbased on 43070 SNPs of minor allele based on 43 SNP 標(biāo)記的 圖 3-4 43070 個(gè) SNP 標(biāo)記的）含量分布 基因多態(tài)性（GD）含量分布ncy distribution Fig.3-4 Frenquency distributi 43070 SNPs of Gene diversity based on 4302000400060008000100001200014000160000.05-0.1 0.1-0.15 0.15-0.2 0.2-0.25 0.25-0.3 0.3-0.35NmberufoSNPSeGneesirvdyt-0.2 0.2-0.25 0.25-0.3 0.3-0.35 0.35-0.4PIC value

3.2 群體結(jié)構(gòu)分析使用 Structure V2.3.4 軟件，基于 SNP 標(biāo)記數(shù)據(jù)，對 345 份玉米自交系進(jìn)行種質(zhì)結(jié)構(gòu)分析，類群參數(shù)值 K 設(shè)定為 1-10，迭代參數(shù)和 burn-in period 均設(shè)為 10000，每個(gè) K 值運(yùn)行 5 次。群體結(jié)構(gòu)分析見圖 3-6，結(jié)果顯示：當(dāng) K=2 時(shí)，△ K 出現(xiàn)最高峰，表明 345 份自交系首先可以被劃分為 2 個(gè)大的亞群，即熱帶亞熱帶種質(zhì)群與溫帶種質(zhì)群。當(dāng) K=6 時(shí)，△ K 出現(xiàn)第二個(gè)較為明顯的峰值，說明該群體還能夠進(jìn)一步被劃分為 6 個(gè)亞群，根據(jù)自交系的劃群結(jié)果與已知系譜的比較分析，可將其中 4 個(gè)亞群與國內(nèi)雜種優(yōu)勢群相對應(yīng)，包括 BSSS、Reid、PA、PB，另外 2 個(gè)亞群分別為北方種質(zhì)群和熱帶亞熱帶種質(zhì)群。其中 BSSS 群中包含 B73 等代表性自交系，Reid 群中包含有鄭 58 等代表性自交系，PA 群中包含 698-3、綿 723 等代表性自交系，PB 群中包含P138、齊 319 等代表性自交系，北方種質(zhì)群中包含昌 7-2、丹 340 及 Mo17 等代表性自交系、熱帶亞熱帶群中包含 S273、YA8201 等代表性自交系。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]中國玉米灰斑病發(fā)生現(xiàn)狀與未來擴(kuò)散趨勢分析[J]. 趙立萍,王曉鳴,段燦星,龍書生,李曉,李洪連,何月秋,晉齊鳴,武小菲,宋鳳景.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(18)
[2]Genetic characterization and linkage disequilibrium mapping of resistance to gray leaf spot in maize（Zea mays L.）[J]. Liyu Shi,Xiangling Lv,Jianfeng Weng,Hanyong Zhu,Changlin Liu,Zhuanfang Hao,Yu Zhou,Degui Zhang,Mingshun Li,Xiaoke Ci,Xinhai Li,Shihuang Zhang.  The Crop Journal. 2014(Z1)
[3]中國玉米灰斑病病原菌的鑒定及其基本特征研究[J]. 劉慶奎,秦子惠,張小利,江凱,陳茂功,武小菲,何月秋,王桂清,晉齊鳴,王曉鳴.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(19)
[4]利用SSR標(biāo)記研究東北北部常用自交系遺傳多樣性[J]. 蔡泉,曹靖生,史桂榮,張建國,郭曉明,李樹軍,殷躍.  黑龍江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(08)
[5]基于RIL群體的玉米紋枯病抗性QTL分析[J]. 林海建,劉昌林,沈亞歐,蘭海,潘光堂,張志明.  核農(nóng)學(xué)報(bào). 2013(07)
[6]一種新的玉米灰斑病在我國局部地區(qū)發(fā)生[J]. 劉可杰,徐婧,徐秀德.  遼寧農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(03)
[7]PN78599種質(zhì)在我國玉米育種和生產(chǎn)中的應(yīng)用[J]. 王秀鳳,景希強(qiáng),王孝杰,葛立勝,景小鵬,姚永祥,陳瑞林.  玉米科學(xué). 2012(04)
[8]基于40個(gè)核心SSR標(biāo)記揭示的820份中國玉米重要自交系的遺傳多樣性與群體結(jié)構(gòu)[J]. 劉志齋,吳迅,劉海利,李永祥,李清超,王鳳格,石云素,宋燕春,宋偉彬,趙久然,賴錦盛,黎裕,王天宇.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(11)
[9]我國西南地區(qū)玉米育種面臨的挑戰(zhàn)及相應(yīng)對策探討[J]. 潘光堂,楊克誠.  作物學(xué)報(bào). 2012(07)
[10]西南地區(qū)玉米灰斑病菌生物學(xué)特性研究[J]. 崔麗娜,張小飛,鄒成佳,李曉,楊曉蓉,羅懷海.  西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2012(02)

博士論文
[1]玉米重要自交系的遺傳特征鑒定與株型性狀關(guān)聯(lián)分析[D]. 吳迅.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]玉米IBM Syn10群體高分辨率遺傳連鎖圖譜構(gòu)建及穗部相關(guān)性狀QTL/miRNA遺傳解析[D]. 劉紅軍.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]144份玉米自交系紋枯病抗性相關(guān)性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 曾興.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]不同類型玉米種質(zhì)分子特征分析及耐旱相關(guān)性狀的連鎖—連鎖不平衡聯(lián)合作圖[D]. 盧艷麗.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[5]燕麥種質(zhì)資源遺傳多樣性研究[D]. 齊冰潔.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[6]玉米重要自交系遺傳多樣性分析及產(chǎn)量相關(guān)性狀QTL研究[D]. 石云素.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008

碩士論文
[1]玉米耐旱功能標(biāo)記開發(fā)及優(yōu)異單倍型應(yīng)用[D]. 柳思思.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[2]玉米灰斑病抗性基因的QTL初步定位[D]. 李海艷.云南大學(xué) 2012
[3]玉米抗旱性及產(chǎn)量相關(guān)性狀的QTL分析[D]. 王曉鵬.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]玉米品種資源對灰斑病的抗性評價(jià)及灰斑病病原菌的RAPD分析[D]. 申世安.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[5]玉米抗灰斑病種質(zhì)鑒定與QTL定位的初步研究[D]. 曹國輝.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008
[6]墨白964群體5輪混合選擇遺傳變異的分子生物學(xué)研究[D]. 魏昕.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004



本文編號：3091827