A-to-I RNA編輯調(diào)控禾谷鐮刀菌FgRID1基因的功能研究
發(fā)布時間:2021-03-20 10:44
小麥赤霉病是一種世界范圍內(nèi)廣泛流行的農(nóng)作物病害,不僅會造成小麥產(chǎn)量的降低,更為重要的是,感病的小麥會大量積累真菌毒素,且在后續(xù)加工過程中,很難被去除,因此造成嚴(yán)重的食品安全問題。禾谷鐮刀菌是小麥赤霉病的主要致病菌,其有性子囊孢子作為重要的初侵染源,在小麥赤霉病的發(fā)生過程中起到了至關(guān)重要的作用。對禾谷鐮刀菌的有性發(fā)育開展研究,有助于揭示小麥赤霉病病害循環(huán)的特點,為有效防控提供理論參考。在研究A-to-I的RNA編輯對PUK1-like基因的影響時發(fā)現(xiàn)預(yù)測為RID1同源基因的FGRRES08648也發(fā)生編輯,Rid1編碼一個DNA甲基轉(zhuǎn)移酶,是目前已知的唯一一個直接介導(dǎo)重復(fù)片段誘導(dǎo)點突變(RIP,Repeat-induced point mutation)的蛋白,而RIP機制是一種特異發(fā)生于絲狀真菌有性階段的遺傳機制,可以限制重復(fù)DNA片段在基因組中的積累,有效維護基因組穩(wěn)定性,對絲狀真菌的生長發(fā)育至關(guān)重要。我們在禾谷鐮刀菌中鑒定了RID1的同源基因FgRID1(FGRRES08648)。對RNA-seq數(shù)據(jù)進行分析,發(fā)現(xiàn)FgRID1預(yù)測的內(nèi)含子...
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
粗糙脈孢菌有性生殖發(fā)生過程
圖 1-2.禾谷鐮刀菌有性生殖過程(Hallen et al., 2007)Fig.1-2. Sexual development of Fusarium graminearum in carrot agar cultures: 0, 24,144 h20μm; 48, 72, 96 h Bar =10μm(Hallen et al., 2007)1.3 A to I RNA 編輯特定發(fā)生于禾谷鐮刀菌的有性生殖階段2016 年 Liu 等人在禾谷鐮刀菌有性生殖階段首次發(fā)現(xiàn)并通過 RNA 測序數(shù)據(jù)實 FgPUK1 基因(Perithecium unique kinase 1,F(xiàn)GRRES_01058)的激酶結(jié)構(gòu)域中兩
1 ml 0.5M EDTA(pH 8.0)補水至 500 ml, 滅菌 20 min,室溫保存。16、100mg/ml 氨芐青霉素2g 氨芐青霉素14ml 無水乙醇6ml DDW溶解完全后分裝到 2ml 的離心管中,于-20℃保存。2.1.1.3 儀器超凈實驗工作臺、Bio-RAD PCR 儀、Eppendorf 移液器、凝膠成像系統(tǒng)、電泳設(shè)備、床、離心管、渦旋儀、低溫冰箱、水浴鍋、高壓滅菌鍋、恒溫培養(yǎng)箱等。2.1.2 試驗方法2.1.2.1 引物設(shè)計及片段擴增在禾谷鐮刀菌基因組數(shù)據(jù)庫下載 FgRID1(FGRRES_08648)基因序列及基因上下2000bp 序列。用 Premier Primer 5 設(shè)計引物,各引物的位置如圖,其中 2R、3F 的端加上潮霉素磷酸轉(zhuǎn)移酶基因(hph)同源序列。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]小麥赤霉病發(fā)生特點及防治措施[J]. 劉慶寶. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè). 2015(10)
[2]麥類赤霉病研究進展[J]. 喻大昭. 植物保護. 2009(03)
[3]小麥赤霉病菌源種類和禾谷鐮刀菌的特性及變異研究綜述[J]. 何家泌. 國外農(nóng)學(xué).植物保護. 1992(04)
本文編號:3090870
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
粗糙脈孢菌有性生殖發(fā)生過程
圖 1-2.禾谷鐮刀菌有性生殖過程(Hallen et al., 2007)Fig.1-2. Sexual development of Fusarium graminearum in carrot agar cultures: 0, 24,144 h20μm; 48, 72, 96 h Bar =10μm(Hallen et al., 2007)1.3 A to I RNA 編輯特定發(fā)生于禾谷鐮刀菌的有性生殖階段2016 年 Liu 等人在禾谷鐮刀菌有性生殖階段首次發(fā)現(xiàn)并通過 RNA 測序數(shù)據(jù)實 FgPUK1 基因(Perithecium unique kinase 1,F(xiàn)GRRES_01058)的激酶結(jié)構(gòu)域中兩
1 ml 0.5M EDTA(pH 8.0)補水至 500 ml, 滅菌 20 min,室溫保存。16、100mg/ml 氨芐青霉素2g 氨芐青霉素14ml 無水乙醇6ml DDW溶解完全后分裝到 2ml 的離心管中,于-20℃保存。2.1.1.3 儀器超凈實驗工作臺、Bio-RAD PCR 儀、Eppendorf 移液器、凝膠成像系統(tǒng)、電泳設(shè)備、床、離心管、渦旋儀、低溫冰箱、水浴鍋、高壓滅菌鍋、恒溫培養(yǎng)箱等。2.1.2 試驗方法2.1.2.1 引物設(shè)計及片段擴增在禾谷鐮刀菌基因組數(shù)據(jù)庫下載 FgRID1(FGRRES_08648)基因序列及基因上下2000bp 序列。用 Premier Primer 5 設(shè)計引物,各引物的位置如圖,其中 2R、3F 的端加上潮霉素磷酸轉(zhuǎn)移酶基因(hph)同源序列。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]小麥赤霉病發(fā)生特點及防治措施[J]. 劉慶寶. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè). 2015(10)
[2]麥類赤霉病研究進展[J]. 喻大昭. 植物保護. 2009(03)
[3]小麥赤霉病菌源種類和禾谷鐮刀菌的特性及變異研究綜述[J]. 何家泌. 國外農(nóng)學(xué).植物保護. 1992(04)
本文編號:3090870
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