玉米大斑病病菌對熱帶玉米種質(zhì)CML493的DNA甲基化變異與mRNA表達(dá)分析
發(fā)布時間:2021-03-19 06:58
以熱帶高抗大斑病玉米種質(zhì)CML493幼苗為試驗材料,采用人工接種大斑病病菌處理,采用甲基化敏感擴(kuò)增多態(tài)性(MSAP)技術(shù)和轉(zhuǎn)錄組測序(mRNA-seq)技術(shù),對經(jīng)過接種大斑病病菌處理不同時間的CML493基因組DNA胞嘧啶甲基化進(jìn)行DNA甲基化模式、DNA甲基化水平分析和mRNA表達(dá)分析。結(jié)果表明,接種大斑病病菌6、12 d的甲基化敏感擴(kuò)增多態(tài)性分別為78.21%和76.13%,甲基化敏感擴(kuò)增單態(tài)性分別為21.79%和23.87%。接種大斑病病菌6 d時,總甲基化率上升5.49%,全甲基化率上升14.24%,半甲基化率上升6.11%。接種大斑病病菌12 d時,總甲基化率上升6.40%,全甲基化率上升16.73%,半甲基化率上升5.57%。接種大斑病病菌0、6、12 d共檢測到2 298個共表達(dá)基因,共檢測到1 434個共表達(dá)上調(diào)基因,檢測到769個共表達(dá)下調(diào)基因,上調(diào)基因數(shù)目顯著多于下調(diào)基因數(shù)目。
【文章來源】:玉米科學(xué). 2020,28(06)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
差異表達(dá)基因韋恩圖
差異表達(dá)火山圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]玉米二倍體和單倍體基因組DNA胞嘧啶甲基化差異分析[J]. 李瑩,孫偉峰,袁野,張野,金鑫,祁新. 分子植物育種. 2018(21)
[2]表觀遺傳調(diào)控在哺乳動物體細(xì)胞核移植上的應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 肖鵬,王雪芳,王莎莎,謝雅婷,盧晟盛,梁世忠. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(03)
[3]植物轉(zhuǎn)錄后水平基因沉默:調(diào)控基因表達(dá)的一把雙刃劍[J]. 張新巖,朱穎,吳輝輝,郭紅衛(wèi). 中國科學(xué):生命科學(xué). 2016(06)
[4]植物DNA甲基化與基因表達(dá)的關(guān)聯(lián)性研究進(jìn)展[J]. 趙倩,王巍,孫野青. 生物技術(shù)通報. 2016(04)
[5]植物多倍體化中基因組和基因表達(dá)的變化[J]. 王濤,陳孟龍,劉玲,寧傳麗,蔡斌華,章鎮(zhèn),喬玉山. 植物學(xué)報. 2015(04)
[6]鹽脅迫下棉花基因組基于毛細(xì)管電泳的MSAP分析[J]. 錢曉偉,袁有祿,榮平,朱新宇,劉亞泰,江鵬,劉尚,汪保華. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報. 2014(03)
[7]DNA甲基化與基因表達(dá)調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 史玉杰,李慶賀,劉曉輝. 中國生物工程雜志. 2013(07)
[8]DNA甲基化在植物研究中的應(yīng)用現(xiàn)狀與前景[J]. 郭廣平,袁金玲,吳曉麗,顧小平. 植物遺傳資源學(xué)報. 2011(03)
[9]nr數(shù)據(jù)庫分析及其本地化[J]. 鄧泱泱,荔建琦,吳松鋒,朱云平,陳耀文,賀福初. 計算機工程. 2006(05)
本文編號:3089177
【文章來源】:玉米科學(xué). 2020,28(06)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
差異表達(dá)基因韋恩圖
差異表達(dá)火山圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]玉米二倍體和單倍體基因組DNA胞嘧啶甲基化差異分析[J]. 李瑩,孫偉峰,袁野,張野,金鑫,祁新. 分子植物育種. 2018(21)
[2]表觀遺傳調(diào)控在哺乳動物體細(xì)胞核移植上的應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 肖鵬,王雪芳,王莎莎,謝雅婷,盧晟盛,梁世忠. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(03)
[3]植物轉(zhuǎn)錄后水平基因沉默:調(diào)控基因表達(dá)的一把雙刃劍[J]. 張新巖,朱穎,吳輝輝,郭紅衛(wèi). 中國科學(xué):生命科學(xué). 2016(06)
[4]植物DNA甲基化與基因表達(dá)的關(guān)聯(lián)性研究進(jìn)展[J]. 趙倩,王巍,孫野青. 生物技術(shù)通報. 2016(04)
[5]植物多倍體化中基因組和基因表達(dá)的變化[J]. 王濤,陳孟龍,劉玲,寧傳麗,蔡斌華,章鎮(zhèn),喬玉山. 植物學(xué)報. 2015(04)
[6]鹽脅迫下棉花基因組基于毛細(xì)管電泳的MSAP分析[J]. 錢曉偉,袁有祿,榮平,朱新宇,劉亞泰,江鵬,劉尚,汪保華. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報. 2014(03)
[7]DNA甲基化與基因表達(dá)調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 史玉杰,李慶賀,劉曉輝. 中國生物工程雜志. 2013(07)
[8]DNA甲基化在植物研究中的應(yīng)用現(xiàn)狀與前景[J]. 郭廣平,袁金玲,吳曉麗,顧小平. 植物遺傳資源學(xué)報. 2011(03)
[9]nr數(shù)據(jù)庫分析及其本地化[J]. 鄧泱泱,荔建琦,吳松鋒,朱云平,陳耀文,賀福初. 計算機工程. 2006(05)
本文編號:3089177
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/dzwbhlw/3089177.html
最近更新
教材專著