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基于TMT技術(shù)篩選汞脅迫下水稻根尖組織差異蛋白及生物信息學(xué)分析

發(fā)布時間:2021-03-18 11:01
  目的:食用稻米是中國典型汞礦區(qū)人群汞暴露的最主要途徑之一,為了從蛋白質(zhì)水平上揭示水稻(Oryza sativa L.)適應(yīng)重金屬汞脅迫的分子機制,探討汞脅迫引起的生理生化響應(yīng)和總汞分布特征,模擬汞礦區(qū)污染稻田環(huán)境,達到發(fā)現(xiàn)脅迫根尖后吸收汞元素相關(guān)顯著差異蛋白的目的,以期為調(diào)控水稻吸收汞的分子生物學(xué)機制研究提供線索,從而降低人群汞暴露風(fēng)險。方法:本研究采用盆栽試驗方法,以拔節(jié)期水稻(金優(yōu)431)為材料,氯化汞脅迫濃度設(shè)置0 mg·kg-1和50 mg·kg-1、150 mg·kg-1、300 mg·kg-1。脅迫30d測定生理生化指標,烘干測總汞含量,之后采用同位素相對標記與絕對定量(Tandem Mass Tag,TMT)技術(shù),篩選水稻根尖部位響應(yīng)重金屬汞脅迫的顯著差異表達蛋白(Fisher’s exact test,p<0.05),對所有差異蛋白進行生物信息學(xué)分析;并應(yīng)用定量蛋白質(zhì)組學(xué)平行反應(yīng)監(jiān)測(parallel reaction monitoring,PRM)技術(shù),鑒定驗證汞脅迫響應(yīng)顯著... 

【文章來源】:貴州醫(yī)科大學(xué)貴州省

【文章頁數(shù)】:84 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于TMT技術(shù)篩選汞脅迫下水稻根尖組織差異蛋白及生物信息學(xué)分析


圖0-1:iTRAQ/TMT蛋白質(zhì)表達差異譜多通道定量分析

總汞,標準工作曲線,標準物質(zhì)


線:吸取新配制的100ng/mL總汞標準溶液0mL、0.05mL、0.1mL、0.2mL、0.3mL、0.5mL、0.6mL,分別置于8mL還原瓶中,按樣品方法進行測定,以總汞含量(ng)為橫坐標,實驗信號強度為縱坐標,繪制標準曲線(圖1-1),得到標準方程為y=0.2174x+0.3152,相關(guān)系數(shù)R2=0.9996圖 1-1 總汞標準工作曲線Fig. 1-1 Standard curve of THg1.2.2.4 標準物質(zhì)測定樣品測定時要進行標準物質(zhì)的測定如表 1-1,生物樣品標準物質(zhì)為柑橘葉(GBW 10020)。選擇與待分析測定的樣品類型相同或者相似的標準物質(zhì),用于驗證植物和土壤樣品前處理方法及分析方法的可靠性。

總汞,水稻植株,水稻,主莖


圖 1-2 水稻組織細分Fig. 1-2 Detailed parts of rice tissues表 1-8 水稻植株各部位中總汞分布統(tǒng)計(μg·kg-1)1-8 Statistics of Total Mercury Distribution in Different Parts of Rice Pla根尖 根 主莖 莖 葉 118.005 366.105 253.952 6.3334 16.986 57.483 308.916 185.216 6.222 10.629 V 144.246 224.371 181.501 1.275 18.314 373.450 747.378 454.322 9.087 49.958 9.957 127.353 63.872 4.739 3.870

【參考文獻】:
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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本文編號:3088210

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