長鏈非編碼 RNA（Long non-coding RNA,lncRNA）是一類長度大于 200 nt的非編碼RNA,具有重要的調(diào)控作用。近年來,從轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)lncRNA的計(jì)算流程日趨成熟,越來越多的1ncRNA被發(fā)現(xiàn)和鑒定。本研究采用前期建立的生物信息學(xué)分析流程,根據(jù)1ncRNA特點(diǎn),分別以灰飛虱（Laoddelphax striatellusFallen）及扶桑綿粉蚧（Phenacoccus solenopsis Tinsley）基因組為參考,預(yù)測(cè)得到灰飛虱和扶桑綿粉蚧的lncRNA基因;分析了兩種昆蟲的lncRNA基因的特點(diǎn),比較了其在不同組織中的表達(dá)情況;利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR對(duì)灰飛虱帶毒和不帶毒樣本進(jìn)行了差異表達(dá)驗(yàn)證。主要研究結(jié)果如下:1.LncRNA的挖掘以及在灰飛虱帶毒組織中的表達(dá)分析實(shí)驗(yàn)共采用38個(gè)灰飛虱轉(zhuǎn)錄組,其中包括實(shí)驗(yàn)室之前測(cè)定并報(bào)道的4個(gè)灰飛虱轉(zhuǎn)錄組和從NCBISRA數(shù)據(jù)庫下載的34個(gè)灰飛虱轉(zhuǎn)錄組,包括感染與未感染水稻條紋病毒（rice stripe virus,RSV）的不同灰飛虱組織、感染與未感染沃爾巴克氏體的灰飛虱、不同溫度處理的樣本。據(jù)lncRNA... 

【文章來源】：浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：58 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖２．１灰飛虱ＩｎｅＲＮＡ特征分析??Ｆｉｇｕｒｅ?２．１?Ｔｈｅ?ｃｈａｒａｃｔｅｒｓ?ｏｆ?ＩｎｃＲＮＡｓ?ｉｎ?ＳＢＰＨ??（Ａ）每個(gè)ＩｎｅＲＮＡ、蛋白編碼基因的轉(zhuǎn)錄本對(duì)應(yīng)的外顯子數(shù)量；（Ｂ）ｌｎｃＲＮＡ、??

＇ｚ?Ｚ＇、Ｚ??圖２．２未感染和感染病毒灰飛虱組織的ＩｎｃＫＮＡ表達(dá)聚類分析??Ｆｉｇｕｒｅ?２．２．?Ｃｌｕｓｔｅｒ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ＩｎｃＲＮＡ?ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ?ｉｎ?ｖｉｒｕｌｉｆｅｒｏｕｓ?ａｎｄ?ｎｏｎ－??ｖｉｒｕｌｉｆｅｒｏｕｓ?

?３００??Ｐｏｓｉｔｉｏｎ?ａｌｏｎｇ?ｒｅａｄｓ??圖３．２樣品ＲＲＡ８９０６２測(cè)序錯(cuò)誤率分布圖??Ｆｉｇｕｒｅ?３．２?Ｓａｍｐｌｅ?ＲＲＡ８９０６２?ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ?ｅｒｒｏｒ?ｒａｔｅ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ??２５??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]水稻灰飛虱的研究進(jìn)展[J]. 孫志廣,王寶祥,陳庭木,徐波,邢運(yùn)高,代慧敏,徐大勇.  北方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2018(05)
[2]水稻條紋葉枯病毒對(duì)灰飛虱生物學(xué)特性及若干生理生化特性的影響[J]. 賀康,郭金夢(mèng),李飛,林克劍,王桂榮.  應(yīng)用昆蟲學(xué)報(bào). 2018 (01)
[3]扶桑綿粉蚧轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 胡俊杰,孟翔,周佳濱,楊陸興,劉善海,李潤釗.  昆蟲學(xué)報(bào). 2017(01)
[4]昆蟲長鏈非編碼RNA的研究進(jìn)展[J]. 肖花美,李美珍,李飛.  應(yīng)用昆蟲學(xué)報(bào). 2017 (01)
[5]長鏈非編碼RNA（lncRNA）及其在昆蟲學(xué)研究中的進(jìn)展[J]. 朱斌,梁沛,高希武.  昆蟲學(xué)報(bào). 2016(11)
[6]扶桑綿粉蚧研究狀況的文獻(xiàn)計(jì)量分析[J]. 翟欣.  環(huán)境昆蟲學(xué)報(bào). 2015(03)
[7]應(yīng)用免疫熒光技術(shù)研究水稻條紋病毒（RSV）侵染介體灰飛虱卵巢的過程[J]. 吳維,毛倩卓,陳紅燕,陳倩,劉啟飛,李凡,魏太云.  農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2012(12)
[8]中國水稻條紋葉枯病研究進(jìn)展[J]. 周益軍,李碩,程兆榜,周彤,范永堅(jiān).  江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2012(05)
[9]扶桑綿粉蚧部分行為學(xué)的初步研究[J]. 魏婷,劉慧,歐高財(cái),肖鐵光,黃玲,陳常銘.  作物研究. 2010(04)
[10]實(shí)時(shí)熒光定量PCR的發(fā)展和數(shù)據(jù)分析[J]. 紀(jì)冬,辛紹杰.  生物技術(shù)通訊. 2009(04)

博士論文
[1]五種昆蟲非編碼RNA基因發(fā)現(xiàn)及miR-14的功能研究[D]. 肖花美.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015

碩士論文
[1]扶桑綿粉蚧脂質(zhì)合成相關(guān)基因的特性和功能研究[D]. 李曉龍.浙江農(nóng)林大學(xué) 2016



本文編號(hào)：3076050