基于宏基因組測(cè)序的扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌多樣性研究
發(fā)布時(shí)間:2021-03-08 07:00
【目的】扶桑綿粉蚧是一種重要的入侵害蟲(chóng),也被列為我國(guó)的檢疫性有害生物。內(nèi)共生菌的群落結(jié)構(gòu)及與扶桑綿粉蚧關(guān)系的研究,將為研究扶桑綿粉蚧的入侵生物學(xué)和防治提供新的思路和參考!痉椒ā坷煤昊蚪M測(cè)序技術(shù)對(duì)室內(nèi)飼養(yǎng)扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌的物種組成、豐度和多樣性進(jìn)行了研究!窘Y(jié)果】共鑒定獲得29個(gè)門(mén),47個(gè)綱,105個(gè)目,178個(gè)科,245個(gè)屬,299個(gè)種。變形菌門(mén)、γ-變形菌綱、腸桿菌目、腸桿菌科、伯克氏菌屬、Candidatus分別為各分類(lèi)階元的優(yōu)勢(shì)種群。共預(yù)測(cè)了36505個(gè)基因,其中77.27%的基因分布在200~499 nt的范圍內(nèi);蚣疜EGG注釋表明,扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌代謝相關(guān)基因最多,達(dá)384個(gè),占49.48%;環(huán)境信息處理基因最少,僅8個(gè),占1.03%;代謝相關(guān)基因最多的為氨基酸代謝基因,為64個(gè),占28.19%;蚣疌OG注釋表明,翻譯、核糖體結(jié)構(gòu)和生物發(fā)生的基因最多,其次為氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)和代謝基因,分別占27.64%和12.31%!窘Y(jié)論】初步確定了扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌菌群的群落結(jié)構(gòu)和優(yōu)勢(shì)菌群,并初步分析了這些內(nèi)共生菌的功能基因情況,為進(jìn)一步研究?jī)?nèi)共生菌與扶桑綿粉蚧之間的關(guān)系提供...
【文章來(lái)源】:生物安全學(xué)報(bào). 2020,29(04)
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌基因長(zhǎng)度分布圖
扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌KEGG通道注釋圖
圖2 扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌KEGG通道注釋圖研究發(fā)現(xiàn),在基因KEGG注釋時(shí),扶桑綿粉蚧基因主要為代謝相關(guān)基因和遺傳信息處理基因,代謝相關(guān)功能基因中,又以氨基酸代謝基因?yàn)橹,?shù)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于其他代謝基因。在橘臀紋粉蚧Planococcus citri (Risso)體內(nèi),嵌套菌Candidatus Moranella endobia和Candidatus Tremblaya princeps共同參與了其體內(nèi)的氨基酸代謝(López-Madrigal et al.,2013;Mc Cutcheon&von Dohlen,2011)。然而,同樣的功能在Phenacoccus avenae Borchsenius體內(nèi)卻由Candidatus Tremblaya phenacola一種共生菌完成(López-Madrigal et al.,2014)。為此,可推測(cè)扶桑綿粉蚧通過(guò)刺吸式口器取食富含糖分卻缺乏必需氨基酸的植物韌皮部汁液,內(nèi)共生菌Candidatus Tremblaya為其提供了必需氨基酸等營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)。同時(shí),研究檢測(cè)到Drosophila ananassae內(nèi)共生菌Wolbachia也是扶桑綿粉蚧體內(nèi)的優(yōu)勢(shì)種群之一(相對(duì)豐度1.04%)。Wolbachia廣泛存在于節(jié)肢動(dòng)物中,對(duì)宿主生殖有重要影響。由于內(nèi)共生菌在昆蟲(chóng)體內(nèi)的生存環(huán)境相對(duì)穩(wěn)定,與自由生活的親緣菌相比,基因組更小,其中環(huán)境信息處理可由其寄主提供(López-Madrigal et al.,2015)。因此,扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌基因注釋時(shí)環(huán)境信息處理基因所占比例也很小,僅占1.03%。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]昆蟲(chóng)體內(nèi)微生物多樣性的影響因素研究進(jìn)展[J]. 魏曉瑩,郭晨亮,褚棟. 生物安全學(xué)報(bào). 2019(03)
[2]基于16S rDNA序列的小貫小綠葉蟬共生細(xì)菌多樣性研究[J]. 毛迎新,譚榮榮,王友平,陳勛,王紅娟,黃丹娟,龔自明. 植物保護(hù). 2018(03)
[3]共生菌Tremblaya princeps在扶桑綿粉蚧個(gè)體發(fā)育中的動(dòng)態(tài)變化[J]. 黃芳,趙春玲,呂要斌. 昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2015(10)
[4]昆蟲(chóng)內(nèi)共生菌及其功能研究進(jìn)展[J]. 楊義婷,郭建洋,龍楚云,劉懷,萬(wàn)方浩. 昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2014(01)
[5]首次發(fā)現(xiàn)扶桑綿粉蚧體內(nèi)存在沃爾巴克氏體[J]. 唐遠(yuǎn),王超,陸永躍. 環(huán)境昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2013(01)
[6]基于形態(tài)特征和線(xiàn)粒體COI基因探討扶桑綿粉蚧物種的有效性并記述一體色變異型扶桑綿粉蚧[J]. 陳哲,張姜,傅杭飛,許爭(zhēng)爭(zhēng),鄧?yán)ふ?張加勇. 生物多樣性. 2012(04)
[7]棉花上扶桑綿粉蚧廣州種群生物學(xué)特性觀察[J]. 關(guān)鑫,陸永躍,曾玲. 中國(guó)棉花. 2011(08)
[8]扶桑綿粉蚧生物學(xué)特性研究[J]. 朱藝勇,黃芳,呂要斌. 昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2011(02)
[9]入侵害蟲(chóng)扶桑綿粉蚧生物學(xué)、危害及防治技術(shù)[J]. 王琳,楊曉朱. 環(huán)境昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2010(04)
本文編號(hào):3070623
【文章來(lái)源】:生物安全學(xué)報(bào). 2020,29(04)
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌基因長(zhǎng)度分布圖
扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌KEGG通道注釋圖
圖2 扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌KEGG通道注釋圖研究發(fā)現(xiàn),在基因KEGG注釋時(shí),扶桑綿粉蚧基因主要為代謝相關(guān)基因和遺傳信息處理基因,代謝相關(guān)功能基因中,又以氨基酸代謝基因?yàn)橹,?shù)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于其他代謝基因。在橘臀紋粉蚧Planococcus citri (Risso)體內(nèi),嵌套菌Candidatus Moranella endobia和Candidatus Tremblaya princeps共同參與了其體內(nèi)的氨基酸代謝(López-Madrigal et al.,2013;Mc Cutcheon&von Dohlen,2011)。然而,同樣的功能在Phenacoccus avenae Borchsenius體內(nèi)卻由Candidatus Tremblaya phenacola一種共生菌完成(López-Madrigal et al.,2014)。為此,可推測(cè)扶桑綿粉蚧通過(guò)刺吸式口器取食富含糖分卻缺乏必需氨基酸的植物韌皮部汁液,內(nèi)共生菌Candidatus Tremblaya為其提供了必需氨基酸等營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)。同時(shí),研究檢測(cè)到Drosophila ananassae內(nèi)共生菌Wolbachia也是扶桑綿粉蚧體內(nèi)的優(yōu)勢(shì)種群之一(相對(duì)豐度1.04%)。Wolbachia廣泛存在于節(jié)肢動(dòng)物中,對(duì)宿主生殖有重要影響。由于內(nèi)共生菌在昆蟲(chóng)體內(nèi)的生存環(huán)境相對(duì)穩(wěn)定,與自由生活的親緣菌相比,基因組更小,其中環(huán)境信息處理可由其寄主提供(López-Madrigal et al.,2015)。因此,扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌基因注釋時(shí)環(huán)境信息處理基因所占比例也很小,僅占1.03%。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]昆蟲(chóng)體內(nèi)微生物多樣性的影響因素研究進(jìn)展[J]. 魏曉瑩,郭晨亮,褚棟. 生物安全學(xué)報(bào). 2019(03)
[2]基于16S rDNA序列的小貫小綠葉蟬共生細(xì)菌多樣性研究[J]. 毛迎新,譚榮榮,王友平,陳勛,王紅娟,黃丹娟,龔自明. 植物保護(hù). 2018(03)
[3]共生菌Tremblaya princeps在扶桑綿粉蚧個(gè)體發(fā)育中的動(dòng)態(tài)變化[J]. 黃芳,趙春玲,呂要斌. 昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2015(10)
[4]昆蟲(chóng)內(nèi)共生菌及其功能研究進(jìn)展[J]. 楊義婷,郭建洋,龍楚云,劉懷,萬(wàn)方浩. 昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2014(01)
[5]首次發(fā)現(xiàn)扶桑綿粉蚧體內(nèi)存在沃爾巴克氏體[J]. 唐遠(yuǎn),王超,陸永躍. 環(huán)境昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2013(01)
[6]基于形態(tài)特征和線(xiàn)粒體COI基因探討扶桑綿粉蚧物種的有效性并記述一體色變異型扶桑綿粉蚧[J]. 陳哲,張姜,傅杭飛,許爭(zhēng)爭(zhēng),鄧?yán)ふ?張加勇. 生物多樣性. 2012(04)
[7]棉花上扶桑綿粉蚧廣州種群生物學(xué)特性觀察[J]. 關(guān)鑫,陸永躍,曾玲. 中國(guó)棉花. 2011(08)
[8]扶桑綿粉蚧生物學(xué)特性研究[J]. 朱藝勇,黃芳,呂要斌. 昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2011(02)
[9]入侵害蟲(chóng)扶桑綿粉蚧生物學(xué)、危害及防治技術(shù)[J]. 王琳,楊曉朱. 環(huán)境昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2010(04)
本文編號(hào):3070623
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