基于宏基因組測序的扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌多樣性研究
發(fā)布時間:2021-03-08 07:00
【目的】扶桑綿粉蚧是一種重要的入侵害蟲,也被列為我國的檢疫性有害生物。內(nèi)共生菌的群落結(jié)構(gòu)及與扶桑綿粉蚧關(guān)系的研究,將為研究扶桑綿粉蚧的入侵生物學(xué)和防治提供新的思路和參考!痉椒ā坷煤昊蚪M測序技術(shù)對室內(nèi)飼養(yǎng)扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌的物種組成、豐度和多樣性進(jìn)行了研究!窘Y(jié)果】共鑒定獲得29個門,47個綱,105個目,178個科,245個屬,299個種。變形菌門、γ-變形菌綱、腸桿菌目、腸桿菌科、伯克氏菌屬、Candidatus分別為各分類階元的優(yōu)勢種群。共預(yù)測了36505個基因,其中77.27%的基因分布在200~499 nt的范圍內(nèi);蚣疜EGG注釋表明,扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌代謝相關(guān)基因最多,達(dá)384個,占49.48%;環(huán)境信息處理基因最少,僅8個,占1.03%;代謝相關(guān)基因最多的為氨基酸代謝基因,為64個,占28.19%。基因集COG注釋表明,翻譯、核糖體結(jié)構(gòu)和生物發(fā)生的基因最多,其次為氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)和代謝基因,分別占27.64%和12.31%!窘Y(jié)論】初步確定了扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌菌群的群落結(jié)構(gòu)和優(yōu)勢菌群,并初步分析了這些內(nèi)共生菌的功能基因情況,為進(jìn)一步研究內(nèi)共生菌與扶桑綿粉蚧之間的關(guān)系提供...
【文章來源】:生物安全學(xué)報. 2020,29(04)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌基因長度分布圖
扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌KEGG通道注釋圖
圖2 扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌KEGG通道注釋圖研究發(fā)現(xiàn),在基因KEGG注釋時,扶桑綿粉蚧基因主要為代謝相關(guān)基因和遺傳信息處理基因,代謝相關(guān)功能基因中,又以氨基酸代謝基因?yàn)橹鳎瑪?shù)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于其他代謝基因。在橘臀紋粉蚧Planococcus citri (Risso)體內(nèi),嵌套菌Candidatus Moranella endobia和Candidatus Tremblaya princeps共同參與了其體內(nèi)的氨基酸代謝(López-Madrigal et al.,2013;Mc Cutcheon&von Dohlen,2011)。然而,同樣的功能在Phenacoccus avenae Borchsenius體內(nèi)卻由Candidatus Tremblaya phenacola一種共生菌完成(López-Madrigal et al.,2014)。為此,可推測扶桑綿粉蚧通過刺吸式口器取食富含糖分卻缺乏必需氨基酸的植物韌皮部汁液,內(nèi)共生菌Candidatus Tremblaya為其提供了必需氨基酸等營養(yǎng)物質(zhì)。同時,研究檢測到Drosophila ananassae內(nèi)共生菌Wolbachia也是扶桑綿粉蚧體內(nèi)的優(yōu)勢種群之一(相對豐度1.04%)。Wolbachia廣泛存在于節(jié)肢動物中,對宿主生殖有重要影響。由于內(nèi)共生菌在昆蟲體內(nèi)的生存環(huán)境相對穩(wěn)定,與自由生活的親緣菌相比,基因組更小,其中環(huán)境信息處理可由其寄主提供(López-Madrigal et al.,2015)。因此,扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌基因注釋時環(huán)境信息處理基因所占比例也很小,僅占1.03%。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]昆蟲體內(nèi)微生物多樣性的影響因素研究進(jìn)展[J]. 魏曉瑩,郭晨亮,褚棟. 生物安全學(xué)報. 2019(03)
[2]基于16S rDNA序列的小貫小綠葉蟬共生細(xì)菌多樣性研究[J]. 毛迎新,譚榮榮,王友平,陳勛,王紅娟,黃丹娟,龔自明. 植物保護(hù). 2018(03)
[3]共生菌Tremblaya princeps在扶桑綿粉蚧個體發(fā)育中的動態(tài)變化[J]. 黃芳,趙春玲,呂要斌. 昆蟲學(xué)報. 2015(10)
[4]昆蟲內(nèi)共生菌及其功能研究進(jìn)展[J]. 楊義婷,郭建洋,龍楚云,劉懷,萬方浩. 昆蟲學(xué)報. 2014(01)
[5]首次發(fā)現(xiàn)扶桑綿粉蚧體內(nèi)存在沃爾巴克氏體[J]. 唐遠(yuǎn),王超,陸永躍. 環(huán)境昆蟲學(xué)報. 2013(01)
[6]基于形態(tài)特征和線粒體COI基因探討扶桑綿粉蚧物種的有效性并記述一體色變異型扶桑綿粉蚧[J]. 陳哲,張姜,傅杭飛,許爭爭,鄧?yán)ふ?張加勇. 生物多樣性. 2012(04)
[7]棉花上扶桑綿粉蚧廣州種群生物學(xué)特性觀察[J]. 關(guān)鑫,陸永躍,曾玲. 中國棉花. 2011(08)
[8]扶桑綿粉蚧生物學(xué)特性研究[J]. 朱藝勇,黃芳,呂要斌. 昆蟲學(xué)報. 2011(02)
[9]入侵害蟲扶桑綿粉蚧生物學(xué)、危害及防治技術(shù)[J]. 王琳,楊曉朱. 環(huán)境昆蟲學(xué)報. 2010(04)
本文編號:3070623
【文章來源】:生物安全學(xué)報. 2020,29(04)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌基因長度分布圖
扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌KEGG通道注釋圖
圖2 扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌KEGG通道注釋圖研究發(fā)現(xiàn),在基因KEGG注釋時,扶桑綿粉蚧基因主要為代謝相關(guān)基因和遺傳信息處理基因,代謝相關(guān)功能基因中,又以氨基酸代謝基因?yàn)橹鳎瑪?shù)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于其他代謝基因。在橘臀紋粉蚧Planococcus citri (Risso)體內(nèi),嵌套菌Candidatus Moranella endobia和Candidatus Tremblaya princeps共同參與了其體內(nèi)的氨基酸代謝(López-Madrigal et al.,2013;Mc Cutcheon&von Dohlen,2011)。然而,同樣的功能在Phenacoccus avenae Borchsenius體內(nèi)卻由Candidatus Tremblaya phenacola一種共生菌完成(López-Madrigal et al.,2014)。為此,可推測扶桑綿粉蚧通過刺吸式口器取食富含糖分卻缺乏必需氨基酸的植物韌皮部汁液,內(nèi)共生菌Candidatus Tremblaya為其提供了必需氨基酸等營養(yǎng)物質(zhì)。同時,研究檢測到Drosophila ananassae內(nèi)共生菌Wolbachia也是扶桑綿粉蚧體內(nèi)的優(yōu)勢種群之一(相對豐度1.04%)。Wolbachia廣泛存在于節(jié)肢動物中,對宿主生殖有重要影響。由于內(nèi)共生菌在昆蟲體內(nèi)的生存環(huán)境相對穩(wěn)定,與自由生活的親緣菌相比,基因組更小,其中環(huán)境信息處理可由其寄主提供(López-Madrigal et al.,2015)。因此,扶桑綿粉蚧內(nèi)共生菌基因注釋時環(huán)境信息處理基因所占比例也很小,僅占1.03%。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]昆蟲體內(nèi)微生物多樣性的影響因素研究進(jìn)展[J]. 魏曉瑩,郭晨亮,褚棟. 生物安全學(xué)報. 2019(03)
[2]基于16S rDNA序列的小貫小綠葉蟬共生細(xì)菌多樣性研究[J]. 毛迎新,譚榮榮,王友平,陳勛,王紅娟,黃丹娟,龔自明. 植物保護(hù). 2018(03)
[3]共生菌Tremblaya princeps在扶桑綿粉蚧個體發(fā)育中的動態(tài)變化[J]. 黃芳,趙春玲,呂要斌. 昆蟲學(xué)報. 2015(10)
[4]昆蟲內(nèi)共生菌及其功能研究進(jìn)展[J]. 楊義婷,郭建洋,龍楚云,劉懷,萬方浩. 昆蟲學(xué)報. 2014(01)
[5]首次發(fā)現(xiàn)扶桑綿粉蚧體內(nèi)存在沃爾巴克氏體[J]. 唐遠(yuǎn),王超,陸永躍. 環(huán)境昆蟲學(xué)報. 2013(01)
[6]基于形態(tài)特征和線粒體COI基因探討扶桑綿粉蚧物種的有效性并記述一體色變異型扶桑綿粉蚧[J]. 陳哲,張姜,傅杭飛,許爭爭,鄧?yán)ふ?張加勇. 生物多樣性. 2012(04)
[7]棉花上扶桑綿粉蚧廣州種群生物學(xué)特性觀察[J]. 關(guān)鑫,陸永躍,曾玲. 中國棉花. 2011(08)
[8]扶桑綿粉蚧生物學(xué)特性研究[J]. 朱藝勇,黃芳,呂要斌. 昆蟲學(xué)報. 2011(02)
[9]入侵害蟲扶桑綿粉蚧生物學(xué)、危害及防治技術(shù)[J]. 王琳,楊曉朱. 環(huán)境昆蟲學(xué)報. 2010(04)
本文編號:3070623
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