番木瓜環(huán)斑病毒西瓜株系的致病機制與弱毒突變體應(yīng)用
發(fā)布時間:2021-02-25 11:20
番木瓜環(huán)斑病毒(Papaya ringspot virus,PRSV)屬于馬鈴薯Y病毒屬(Potyvirus),根據(jù)寄主范圍可以分為P(PRSV-P)和W(PRSV-W)兩個株系。PRSV-W主要侵染西葫蘆、甜瓜等葫蘆科作物,可引起葉片卷曲、畸形、花葉和泡斑,植株矮化等癥狀,造成果實畸形或在表面形成水漬狀環(huán)斑,降低了產(chǎn)量和品質(zhì),嚴重時甚至絕產(chǎn)。目前PRSV在中國、波蘭、印度、巴西等地均有發(fā)生,是危害葫蘆科作物生產(chǎn)的重要病毒。本研究獲得并分析了PRSV山東分離物(PRSV-SD)的全基因組序列,構(gòu)建了PRSV-SD全長侵染性cDNA克隆,篩選出PRSV弱毒突變體并驗證了其交叉保護效果。從山東濟南采集到葉片表現(xiàn)畸形、花葉,果實表面環(huán)斑的西葫蘆樣品,經(jīng)檢測其中含PRSV。通過RT-PCR分段擴增其全基因組片段并進行序列測定,結(jié)果表明,除了3′-端poly(A)尾以外,PRSV-SD基因組全長10337核苷酸(nt),5′-和3′-NCR分別為90 nt和206 nt,開放閱讀框編碼3346個氨基酸。PRSV-SD與另外18個PRSV分離物的全基因組核苷酸一致率為82.0%8
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:83 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
植物RNA病毒侵染性克隆的兩種方法比較(NagyováandSubr,2007)
京市六一儀器廠 DYY-8C 型)、凝膠成像儀(SageCreation)、手持式長波紫外燈(UVPmodelB100A)、離心機(Eppendorf5417R)、水浴鍋(寧波江南儀器廠 SDC-6)、恒溫搖床(Honour HNY-2102C)、超微量分光光度計(Analytikjena Scandrop)、超凈工作臺(蘇凈安泰 SW-CJ-1BU)、酶聯(lián)免疫測定儀(BioRadModel550)、高壓滅菌鍋(Yamato SM830)、全自動化學(xué)發(fā)光儀(ChampChemi)等。2.2 實驗方法2.2.1 序列測定與分析2.2.1.1 擴增策略與引物設(shè)計比對 GneBank 中多個 PRSV 分離物的核苷酸序列,選取保守區(qū)段設(shè)計引物,分4段擴增5′-端以外的基因組序列。然后根據(jù)已得到的近5′-端序列設(shè)計5′-RACE引物。擴增策略按照圖 2-1 進行,相鄰片段之間有 200bp 左右的重疊。
圖 2-2 PRSV 山東分離物全長 cDNA 克隆構(gòu)建策略Fig. 2-2 Strategy for constructing the full-length cDNA clone of PRS表 2-2 構(gòu)建 PRSV 山東分離物全長 cDNA 克隆所用引物ble 2-2 Primers used in constructing the full-length cDNA clone of PR Nucleotide sequence (5′ to 3′)AAAAAAAATAAAACATCTCAACACAACAC CCGATTCTTAGTGCAATTCCCT TCATACAGAGAAGGGTATCCAAGAA CTCTCATTCCAAGAGGCTCGAATAG F TGCACTAAGAATCGGCCCCGGGAATTCTAAGAGG TGTTTTATTTTTTTTCTCTCCAAATGAAATGAACTTCC
【參考文獻】:
期刊論文
[1]番木瓜環(huán)斑病毒西瓜株系衣殼蛋白的原核表達及抗血清制備[J]. 黃顯德,王玉,田延平,古勤生,李向東. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(12)
[2]番木瓜品種資源對環(huán)斑病毒病抗性綜合評價[J]. 何凡,范鴻雁,華敏,王祥和,何舒,周世強. 中國南方果樹. 2008(04)
[3]番木瓜環(huán)斑病毒海南分離株全基因組序列分析[J]. 盧雅薇,沈文濤,唐清杰,牛艷梅,周鵬. 病毒學(xué)報. 2008(02)
[4]番木瓜環(huán)斑病毒研究進展[J]. 黃江華,黃嘉薇,張建軍,彭仁. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(08)
[5]抗環(huán)斑型花葉病毒病番木瓜新品種選育研究初報[J]. 黃建昌,肖艷,梁關(guān)生,趙春香,李宏彬. 西南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2004(06)
[6]葫蘆科作物病毒名錄[J]. 古勤生,范在豐,李懷方. 中國西瓜甜瓜. 2002(01)
[7]麥二叉蚜傳播玉米矮花葉病毒的機制[J]. 李向東,范在豐,李懷方,裘維蕃. 植物保護學(xué)報. 2002(01)
[8]交叉保護在植物病毒病害防治中作用的概述[J]. 崔伯法,王洪祥,翁法令. 中國生物防治. 1998(02)
[9]華南番木瓜病毒病及環(huán)斑病毒株系的調(diào)查鑒定[J]. 蔡建和,范懷忠. 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 1994(04)
[10]番木瓜環(huán)斑病毒株系間交互保護作用研究[J]. 肖火根,范懷忠. 病毒學(xué)報. 1994(02)
本文編號:3050892
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:83 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
植物RNA病毒侵染性克隆的兩種方法比較(NagyováandSubr,2007)
京市六一儀器廠 DYY-8C 型)、凝膠成像儀(SageCreation)、手持式長波紫外燈(UVPmodelB100A)、離心機(Eppendorf5417R)、水浴鍋(寧波江南儀器廠 SDC-6)、恒溫搖床(Honour HNY-2102C)、超微量分光光度計(Analytikjena Scandrop)、超凈工作臺(蘇凈安泰 SW-CJ-1BU)、酶聯(lián)免疫測定儀(BioRadModel550)、高壓滅菌鍋(Yamato SM830)、全自動化學(xué)發(fā)光儀(ChampChemi)等。2.2 實驗方法2.2.1 序列測定與分析2.2.1.1 擴增策略與引物設(shè)計比對 GneBank 中多個 PRSV 分離物的核苷酸序列,選取保守區(qū)段設(shè)計引物,分4段擴增5′-端以外的基因組序列。然后根據(jù)已得到的近5′-端序列設(shè)計5′-RACE引物。擴增策略按照圖 2-1 進行,相鄰片段之間有 200bp 左右的重疊。
圖 2-2 PRSV 山東分離物全長 cDNA 克隆構(gòu)建策略Fig. 2-2 Strategy for constructing the full-length cDNA clone of PRS表 2-2 構(gòu)建 PRSV 山東分離物全長 cDNA 克隆所用引物ble 2-2 Primers used in constructing the full-length cDNA clone of PR Nucleotide sequence (5′ to 3′)AAAAAAAATAAAACATCTCAACACAACAC CCGATTCTTAGTGCAATTCCCT TCATACAGAGAAGGGTATCCAAGAA CTCTCATTCCAAGAGGCTCGAATAG F TGCACTAAGAATCGGCCCCGGGAATTCTAAGAGG TGTTTTATTTTTTTTCTCTCCAAATGAAATGAACTTCC
【參考文獻】:
期刊論文
[1]番木瓜環(huán)斑病毒西瓜株系衣殼蛋白的原核表達及抗血清制備[J]. 黃顯德,王玉,田延平,古勤生,李向東. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(12)
[2]番木瓜品種資源對環(huán)斑病毒病抗性綜合評價[J]. 何凡,范鴻雁,華敏,王祥和,何舒,周世強. 中國南方果樹. 2008(04)
[3]番木瓜環(huán)斑病毒海南分離株全基因組序列分析[J]. 盧雅薇,沈文濤,唐清杰,牛艷梅,周鵬. 病毒學(xué)報. 2008(02)
[4]番木瓜環(huán)斑病毒研究進展[J]. 黃江華,黃嘉薇,張建軍,彭仁. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(08)
[5]抗環(huán)斑型花葉病毒病番木瓜新品種選育研究初報[J]. 黃建昌,肖艷,梁關(guān)生,趙春香,李宏彬. 西南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2004(06)
[6]葫蘆科作物病毒名錄[J]. 古勤生,范在豐,李懷方. 中國西瓜甜瓜. 2002(01)
[7]麥二叉蚜傳播玉米矮花葉病毒的機制[J]. 李向東,范在豐,李懷方,裘維蕃. 植物保護學(xué)報. 2002(01)
[8]交叉保護在植物病毒病害防治中作用的概述[J]. 崔伯法,王洪祥,翁法令. 中國生物防治. 1998(02)
[9]華南番木瓜病毒病及環(huán)斑病毒株系的調(diào)查鑒定[J]. 蔡建和,范懷忠. 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 1994(04)
[10]番木瓜環(huán)斑病毒株系間交互保護作用研究[J]. 肖火根,范懷忠. 病毒學(xué)報. 1994(02)
本文編號:3050892
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