柑橘黃龍病菌408和PAP蛋白基因的克隆及表達(dá)應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2021-02-09 02:29
柑橘黃龍病(Citrus Huanglongbing,HLB)嚴(yán)重威脅世界柑橘產(chǎn)業(yè)的發(fā)展,對(duì)其造成巨大經(jīng)濟(jì)損失。HLB具有一定的潛伏期,從病原菌感染到引起黃化癥狀需要一定的時(shí)間,因此建立一種高效、靈敏、快速的檢測(cè)方法,應(yīng)用于柑橘產(chǎn)業(yè)的健康發(fā)展非常必要。細(xì)菌分泌蛋白是細(xì)菌產(chǎn)生的一種效應(yīng)因子,在細(xì)菌的致病過(guò)程中起重要作用。本研究從柑橘黃龍病菌亞洲株系基因組中分析了病原菌分泌蛋白系統(tǒng)及相關(guān)分泌蛋白的10個(gè)基因,通過(guò)熒光定量RT-PCR(RT-qPCR)方法,篩選獲得RNA含量較高的2個(gè)蛋白基因。開(kāi)展了分泌蛋白基因表達(dá)量和亞細(xì)胞定位研究,為研究該蛋白參與的HLB致病機(jī)理奠定基礎(chǔ);同時(shí)對(duì)這2個(gè)分泌蛋白基因進(jìn)行原核表達(dá),免疫小鼠制備了特異抗血清,為408和PAP蛋白功能研究和開(kāi)發(fā)HLB的蛋白檢測(cè)產(chǎn)品提供基礎(chǔ)。具體結(jié)果如下:(1)以海南瓊中、瓊海感染HLB的綠橙為材料,提取總DNA和RNA,制備DNA和cDNA。根據(jù)柑橘黃龍病菌亞洲株系基因組中分析的病原菌分泌蛋白系統(tǒng)及相關(guān)分泌蛋白的6個(gè)基因,設(shè)計(jì)熒光定量PCR(RT-qPCR)引物,對(duì)HLB樣品的6個(gè)基因mRNA表達(dá)量進(jìn)行定量檢測(cè)。結(jié)果表明:瓊海和...
【文章來(lái)源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:66 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖3綠橙樣品總RAN的提取??
圖2綠橙樣品總DNA的提he?extract?total?DNA?from?Grer;?1:瓊海綠橙總DNA提取;2l?DNA?from?Green?Orange?of?QOrane?ofionzhon
3.?1.2高分泌蛋白基因4促和以/7的定量篩選??熒光定量PCR結(jié)果分析表明瓊海和瓊中6種分泌蛋白基因和內(nèi)參基因16SrRNA??的擴(kuò)增曲線(圖4)均為單峰,表明擴(kuò)增片段唯一,沒(méi)有非特異性擴(kuò)增產(chǎn)生。qRT-PCR??的擴(kuò)增結(jié)果表明,6個(gè)基因均擴(kuò)增較弱,其中4洲和烈/3基因有擴(kuò)增曲線,Ct值在??15?35之間,其余基因沒(méi)有明顯的擴(kuò)增曲線或擴(kuò)增較弱,Ct超過(guò)35?(Ct?>35,表示??很低的擴(kuò)增量或擴(kuò)增不特異)。進(jìn)-步的分析表明,在瓊海樣品中仰基因的表達(dá)水??平比別戶(hù)基因表達(dá)水平高2.43;在瓊中樣品中,4洲基因的表達(dá)水平比烈戶(hù)基因表??達(dá)水平高9.45比瓊海樣品中4財(cái)基因的表達(dá)水平還要高(圖5)。綜合RT-qPCR的結(jié)??果分析,我們從6種柑橘黃龍病菌分泌蛋白基因中篩選出2個(gè)相對(duì)含量較高的基因,??即祁<9和州尸。??Dissociation?Curve??619?-j?A??e|?1??-81?T?r——T?—T?!?T?T?—T?-?r?-?T-?-T-—T?r? ̄T'一I?1?1?T?T?1??55?57?59?61?63?65?67?69?71?73?75?77?79?81?83?85?87?89?91?93?95??Temperature?(X/)??圖4?6種分泌蛋白基因和內(nèi)參16S?rRNA基因焚光定
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]亞洲柑橘木虱的生物學(xué)研究進(jìn)展及防治[J]. 余繼華,黃振東,張敏榮,張寧,李萍,盧璐,楊曉. 植物檢疫. 2018(05)
[2]柑橘黃龍病檢測(cè)技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 萬(wàn)爽,肖婉鈺,黃江華. 仲愷農(nóng)業(yè)工程學(xué)院學(xué)報(bào). 2018(01)
[3]革蘭陰性菌分泌系統(tǒng)及其分泌產(chǎn)物研究進(jìn)展[J]. 余樂(lè)正,柳鳳娟,鄢南南,程旭,李益洲,郭延芝. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2017(08)
[4]柑橘黃龍病研究概況[J]. 陳凱男,李充璧. 浙江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(07)
[5]細(xì)菌Ⅶ型分泌系統(tǒng)的研究進(jìn)展[J]. 于俊媛,姜北,張驍鵬,黎庶,胡曉梅. 微生物與感染. 2015(02)
[6]血清學(xué)方法在幾種豬病毒抗體檢測(cè)中的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 陳亮,于克江,張鵬宇,王志強(qiáng),李洪彬,劉力威. 農(nóng)業(yè)開(kāi)發(fā)與裝備. 2015(02)
[7]柑橘黃龍病LAMP快速檢測(cè)方法的建立及應(yīng)用[J]. 黃麗,蘇華楠,唐科志,黃愛(ài)軍,周常勇,李中安. 果樹(shù)學(xué)報(bào). 2012(06)
[8]幾種微生物表達(dá)系統(tǒng)的比較[J]. 陳明,陳文靜. 安徽農(nóng)學(xué)通報(bào)(上半月刊). 2011(03)
[9]動(dòng)物抗血清及其制備技術(shù)要點(diǎn)與應(yīng)用進(jìn)展[J]. 王占偉,邵國(guó)青,陳笑娟. 江西農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2009(07)
[10]柑橘黃龍病的傳播途徑及鑒定方法[J]. 莫元妹. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(05)
碩士論文
[1]洋蔥果膠甲酯酶基因AcPME的克隆、原核表達(dá)及亞細(xì)胞定位[D]. 孫亞玲.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]柑橘黃龍病PCR檢測(cè)引物比較及其外膜蛋白抗體的研制[D]. 高玉霞.贛南師范學(xué)院 2015
[3]柑橘黃龍病Serralysin蛋白的表達(dá)純化及兩種重要病原的分子檢測(cè)[D]. 侯衛(wèi)真.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號(hào):3024896
【文章來(lái)源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:66 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖3綠橙樣品總RAN的提取??
圖2綠橙樣品總DNA的提he?extract?total?DNA?from?Grer;?1:瓊海綠橙總DNA提取;2l?DNA?from?Green?Orange?of?QOrane?ofionzhon
3.?1.2高分泌蛋白基因4促和以/7的定量篩選??熒光定量PCR結(jié)果分析表明瓊海和瓊中6種分泌蛋白基因和內(nèi)參基因16SrRNA??的擴(kuò)增曲線(圖4)均為單峰,表明擴(kuò)增片段唯一,沒(méi)有非特異性擴(kuò)增產(chǎn)生。qRT-PCR??的擴(kuò)增結(jié)果表明,6個(gè)基因均擴(kuò)增較弱,其中4洲和烈/3基因有擴(kuò)增曲線,Ct值在??15?35之間,其余基因沒(méi)有明顯的擴(kuò)增曲線或擴(kuò)增較弱,Ct超過(guò)35?(Ct?>35,表示??很低的擴(kuò)增量或擴(kuò)增不特異)。進(jìn)-步的分析表明,在瓊海樣品中仰基因的表達(dá)水??平比別戶(hù)基因表達(dá)水平高2.43;在瓊中樣品中,4洲基因的表達(dá)水平比烈戶(hù)基因表??達(dá)水平高9.45比瓊海樣品中4財(cái)基因的表達(dá)水平還要高(圖5)。綜合RT-qPCR的結(jié)??果分析,我們從6種柑橘黃龍病菌分泌蛋白基因中篩選出2個(gè)相對(duì)含量較高的基因,??即祁<9和州尸。??Dissociation?Curve??619?-j?A??e|?1??-81?T?r——T?—T?!?T?T?—T?-?r?-?T-?-T-—T?r? ̄T'一I?1?1?T?T?1??55?57?59?61?63?65?67?69?71?73?75?77?79?81?83?85?87?89?91?93?95??Temperature?(X/)??圖4?6種分泌蛋白基因和內(nèi)參16S?rRNA基因焚光定
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]亞洲柑橘木虱的生物學(xué)研究進(jìn)展及防治[J]. 余繼華,黃振東,張敏榮,張寧,李萍,盧璐,楊曉. 植物檢疫. 2018(05)
[2]柑橘黃龍病檢測(cè)技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 萬(wàn)爽,肖婉鈺,黃江華. 仲愷農(nóng)業(yè)工程學(xué)院學(xué)報(bào). 2018(01)
[3]革蘭陰性菌分泌系統(tǒng)及其分泌產(chǎn)物研究進(jìn)展[J]. 余樂(lè)正,柳鳳娟,鄢南南,程旭,李益洲,郭延芝. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2017(08)
[4]柑橘黃龍病研究概況[J]. 陳凱男,李充璧. 浙江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(07)
[5]細(xì)菌Ⅶ型分泌系統(tǒng)的研究進(jìn)展[J]. 于俊媛,姜北,張驍鵬,黎庶,胡曉梅. 微生物與感染. 2015(02)
[6]血清學(xué)方法在幾種豬病毒抗體檢測(cè)中的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 陳亮,于克江,張鵬宇,王志強(qiáng),李洪彬,劉力威. 農(nóng)業(yè)開(kāi)發(fā)與裝備. 2015(02)
[7]柑橘黃龍病LAMP快速檢測(cè)方法的建立及應(yīng)用[J]. 黃麗,蘇華楠,唐科志,黃愛(ài)軍,周常勇,李中安. 果樹(shù)學(xué)報(bào). 2012(06)
[8]幾種微生物表達(dá)系統(tǒng)的比較[J]. 陳明,陳文靜. 安徽農(nóng)學(xué)通報(bào)(上半月刊). 2011(03)
[9]動(dòng)物抗血清及其制備技術(shù)要點(diǎn)與應(yīng)用進(jìn)展[J]. 王占偉,邵國(guó)青,陳笑娟. 江西農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2009(07)
[10]柑橘黃龍病的傳播途徑及鑒定方法[J]. 莫元妹. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(05)
碩士論文
[1]洋蔥果膠甲酯酶基因AcPME的克隆、原核表達(dá)及亞細(xì)胞定位[D]. 孫亞玲.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]柑橘黃龍病PCR檢測(cè)引物比較及其外膜蛋白抗體的研制[D]. 高玉霞.贛南師范學(xué)院 2015
[3]柑橘黃龍病Serralysin蛋白的表達(dá)純化及兩種重要病原的分子檢測(cè)[D]. 侯衛(wèi)真.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號(hào):3024896
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