蘋果樹腐爛病菌效應(yīng)蛋白VmPxE1功能研究與互作靶標(biāo)鑒定
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:S436.611.11
【圖文】:
圖 1-1 ZIGZAG 模型(JonesAnd Dangl Nature,2006)Fig. 1-1 ZIGZAG modle (Jones And Dangl Nature, 2006)1.2.2 效應(yīng)蛋白的定義為了成功侵染植物,病原菌分泌的效應(yīng)蛋白進(jìn)入寄主植物并破壞它們的免疫反應(yīng)。雖然效應(yīng)蛋白的統(tǒng)一定義仍然難以捉摸,但是已經(jīng)鑒定出越來(lái)越多具有典型效應(yīng)特征的微生物相關(guān)分子,例如小RNA和其他小分泌分子(Lo Presti et al. 2015; Rovenich et al2014; Wang et al. 2016)。狹義上而言,效應(yīng)蛋白就是被某些分泌的蛋白質(zhì),通常被定義為含有不超過(guò)300個(gè)富含半胱氨酸殘基的氨基酸的小分子分泌蛋白質(zhì),通過(guò)二硫鍵穩(wěn)定其三級(jí)結(jié)構(gòu),可導(dǎo)致病原菌進(jìn)一步在植物體內(nèi)侵染和定殖(Duplessis et al. 2011; Mulleret al. 2008; Stergiopoulos et al. 2012)。1.2.3 真菌效應(yīng)蛋白的研究真菌病原菌有不同的生活方式,包括死體營(yíng)養(yǎng)型(necrotrophic)、活體營(yíng)養(yǎng)型(biotrophic)和半活體營(yíng)養(yǎng)型(hemibiotrophic)(Hurley et al. 2014)。死體營(yíng)養(yǎng)型病原真菌通過(guò)快速殺死寄主細(xì)胞并在其內(nèi)容物上存活(Stone 2001)。番茄織球殼菌萎蔫
圖 2-1 敲除片段構(gòu)建示意圖Fig. 2-1 Gene replacement strategy for effector gene以Double-joint PCR法構(gòu)建敲除片段(圖2-1),參考Yu的方法(Yu et al. 2004),分為四步:(1)常規(guī)PCR體系擴(kuò)增neo片段及基因VmPxE1上下游片段:以質(zhì)粒PFL2作為模板使用引物Neo-F/R擴(kuò)增neo片段。同時(shí)將野生型03-8基因組DNA作為模板,使用1F/2R、3F/4R引物擴(kuò)增目標(biāo)基因的上游片段和下游片段,膠回收目標(biāo)條帶。(2)Double-joint PCR擴(kuò)增第一步:把上游片段與下游片段以及neo基因片段混合構(gòu)建融合片段。配制反應(yīng)體系如下:反應(yīng)成分 體積5×Buffer 5 μLdNTPs 4 μL上游片段 1 μL下游片段 1 μLneo 片段 3 μLFastpfu 酶 0.3 μLddH2O 補(bǔ)至 25 μLPCR擴(kuò)增程序?yàn)椋?8℃ 5 min;98℃ 30 s;58℃ 4 min;72℃ 150 s;15個(gè)循環(huán);72℃10 min;16℃,forever。(3)Double-joint PCR擴(kuò)增第二步:以(2)中PCR產(chǎn)物作為反應(yīng)模板,使用引物1F/4R擴(kuò)增敲除片段,PCR 體系如下:反應(yīng)成分 體積5×Buffer 5 μL1F/4R 0.4 μL/0.4 μL
2.3.1 VmPxE1 抑制 Bax 誘導(dǎo)的 PCD 反應(yīng)將已經(jīng)構(gòu)建到PVX載體上的32個(gè)基因的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到農(nóng)桿菌GV3101,注射到煙草內(nèi),從而瞬時(shí)表達(dá)效應(yīng)基因。以eGFP為陰性對(duì)照,具體的注射方法如圖2-2A所示,在注射完eGFP和效應(yīng)基因后16 h時(shí),再次在同一位置注射含有BAX的農(nóng)桿菌菌液。5天后觀察BAX誘導(dǎo)的PCD反應(yīng),以明確候選基因是否具有抑制BAX誘導(dǎo)的PCD的功能。最終篩選得到一個(gè)能夠抑制BAX誘導(dǎo)的PCD。如圖所示注射含有BAX的農(nóng)桿菌菌液的位置,出現(xiàn)了壞死;注射eGFP不能引起壞死;VmPxE1不能引起細(xì)胞壞死,但是能抑制BAX誘導(dǎo)的PCD反應(yīng),且抑制效率達(dá)到了92%(46/50);接著由RT-PCR實(shí)驗(yàn),以本氏煙基因GAPDH為內(nèi)參基因
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