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水稻材料MR183-2的稻曲病抗性QTL定位

發(fā)布時(shí)間:2020-08-06 16:42
【摘要】:水稻是重要的糧食作物,其產(chǎn)量影響著世界的糧食安全。稻曲病是繼稻瘟病、紋枯病、白葉枯病水稻三大病害之后的又一個(gè)發(fā)病面積較廣,產(chǎn)量影響嚴(yán)重的水稻病害,起初為次要病害,而隨著全球變暖和栽培措施的改變,逐漸上升為主要病害。防治稻曲病最有效的辦法為選育抗病品種,而由于稻曲病研究起步較晚,目前抗稻曲病的種質(zhì)資源還較少。MR183-2是早期種質(zhì)資源鑒定時(shí)一個(gè)高抗稻曲病的水稻材料,多用來(lái)創(chuàng)制抗稻曲病的優(yōu)質(zhì)恢復(fù)系新材料,而其抗性來(lái)源尚不清楚,國(guó)內(nèi)外對(duì)于水稻抗稻曲病基因更是鮮有報(bào)道。本研究以MR183-2和高感稻曲病材料08R2394為親本構(gòu)建的重組自交系為材料,通過(guò)田間抗性鑒定、基因芯片多態(tài)性檢測(cè)、單標(biāo)記分析等方法,定位MR183-2內(nèi)的稻曲病抗性QTL,為水稻資源的合理利用奠定基礎(chǔ)。通過(guò)研究,取得了以下結(jié)果:1.通過(guò)對(duì)MR183-2和08R2394的正反交試驗(yàn)探究其稻曲病抗性的遺傳模式,得到F1代群體病穗率為35.42%和21.43%,表現(xiàn)為感病,平均表現(xiàn)更接近08R2394;F1進(jìn)一步自交,得到的F2植株共343株,田間調(diào)查抗病單株76株,感病單株267株,分離比為1:3.51,經(jīng)X~2檢驗(yàn),與理論值1:3一致,則MR183-2稻曲病抗性為隱性性狀,受一對(duì)基因控制。2.通過(guò)基因芯片和SSR分子標(biāo)記相結(jié)合的方法,共定位4個(gè)QTL,其中2號(hào)染色體兩個(gè),命名為qFsr2-1、qFsr2-2,關(guān)聯(lián)標(biāo)記分別為RM71-HEX和KYgmC02B-TAM;3號(hào)染色體一個(gè),命名為qFsr3-1,關(guān)聯(lián)標(biāo)記為W068C03C-FAM,3個(gè)QTL增效等位基因均來(lái)源于MR183-2。8號(hào)染色體一個(gè),命名為qFsr8-1與關(guān)聯(lián)標(biāo)記連鎖RM5556-FAM最為緊密,其抗性來(lái)源于08R2394。3.由于已經(jīng)報(bào)道和克隆的主效數(shù)量性狀基因Ghd8和SSR標(biāo)記RM5556-FAM相距僅0.2Mb,將Ghd8作為候選基因,通過(guò)農(nóng)藝性狀評(píng)價(jià)和測(cè)序分析對(duì)位于8號(hào)染色體QTL進(jìn)行功能驗(yàn)證。對(duì)最抗基因型、中抗基因型和最感基因型的總粒數(shù)、著粒密度、分蘗數(shù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì),中抗與最感在2號(hào)、3號(hào)染色體上QTL基因型不同,中抗為供體基因型,最感為受體基因型,中抗3個(gè)指標(biāo)下降,說(shuō)明抗性與產(chǎn)量性狀存在一定的拮抗;最抗和中抗在8號(hào)染色體QTL基因型不同,最抗為受體基因型,中抗為供體基因型,最抗3個(gè)指標(biāo)下降偏多,說(shuō)明8號(hào)染色體QTL與產(chǎn)量性狀聯(lián)系密切。擴(kuò)增親本的Ghd8基因,進(jìn)行測(cè)序分析。8號(hào)染色體上為受體基因型的08R2394在323bp處缺失一個(gè)堿基,而為供體基因型的MR183-2正常,該位置處于CBFD NFYB HMF功能結(jié)構(gòu)域,出現(xiàn)移碼突變,使其功能改變或喪失,說(shuō)明MR183-2的Ghd8相關(guān)功能正常表達(dá),調(diào)控產(chǎn)量性狀。推測(cè)定位于8號(hào)染色體上的QTL極有可能就是Ghd8。
【學(xué)位授予單位】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S435.111.4
【圖文】:

病穗率,正反交,F1代


親本通過(guò)正反交試驗(yàn),統(tǒng)計(jì) F1和 F2代的表型可判斷性狀的顯驗(yàn)對(duì)抗感性狀的遺傳模式進(jìn)行了探究,親本和 F1代病穗率情況8R2394 病穗率高達(dá) 35.34%,而 MR183-2 只有 0.55%,基本不顯,而正反交所得 F1代病穗率分別為 35.42%和 21.43%。F1代親本的平均反應(yīng)相似,但正反交 F1群體表現(xiàn)存在差異,不能細(xì)胞質(zhì)遺傳。結(jié)合 F2 代的抗感分離情況(見(jiàn)表 5),抗感比為理46<X20.05(1)=3.84,與理論一致,則說(shuō)明 MR183-2 稻曲病抗性隱性核遺傳。

區(qū)段,病級(jí),常規(guī)稻,基因型差異


圖 2 RIL 群體病級(jí)分布Fig.2 Distribution of resistance level from RIL population片定位候選區(qū)段K 基因芯片對(duì)親本基因型差異進(jìn)行鑒定,結(jié)果見(jiàn)圖 3?瞻诪槎鄳B(tài)性區(qū)段,12 條染色體上均有分布,以 1 號(hào)、2 號(hào)染色體最因型,而親本為多年自交常規(guī)稻,基因型理論上為純合,推測(cè)

雜合,基因型鑒定,隱性,區(qū)間


相同基因芯片對(duì)抗感池基因型鑒定,結(jié)果見(jiàn)圖 4,多個(gè)抗感池檢測(cè)得到,2 號(hào)體中部,抗池基因型標(biāo)記密度多于感池,抗池雜合顯性,感池純合隱性;3 號(hào)染末端,抗池純合隱性,感池雜合顯性;6 號(hào)染色體中部,抗池雜合顯性,感池純性;8 號(hào)染色體起始位置,抗池雜合顯性,感池純合隱性;9 號(hào)染色體起始位置池純合隱性,感池為雜合顯性?钩 1 感池 1

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