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常見藥用植物病毒病病原鑒定及基因組克隆

發(fā)布時間:2020-07-13 10:45
【摘要】:近年來藥用植物病毒病發(fā)生逐年加重,寄生性強、致病力大、傳染性高,已經(jīng)成為影響藥用植物生長的主要限制因子之一。但是藥用植物病毒病的研究還很不完善,發(fā)生情況不詳,病原不明,難以指導(dǎo)生產(chǎn)實踐。本研究旨在對常見藥用植物病毒病發(fā)生情況做初步調(diào)查和病原鑒定,為藥用植物病毒病的防治和進一步研究奠定基礎(chǔ)。采用RT-PCR方法結(jié)合生物學(xué)檢測和一代測序技術(shù),研究了人參、西洋參、羅漢果、菊花、白術(shù)、太子參、寧夏枸杞、薄荷、曼陀羅和牛蒡10種藥用植物的病毒病發(fā)生情況和病毒侵染情況。在地黃、羅漢果、菊花、太子參、薄荷和曼陀羅上檢測到病毒侵染,并將病原病毒鑒定到了種或?qū)�。另�?在檢測基礎(chǔ)上構(gòu)建完善了針對藥用植物病毒病的RT-PCR檢測體系,為后續(xù)大范圍開展藥用植物病毒病調(diào)查提供了技術(shù)支持。高通量測序發(fā)現(xiàn),表現(xiàn)矮化癥狀的菊花樣品中含有與Carlavirus屬病毒相似度較高的病毒。借助RT-PCR和RACE技術(shù),克隆了目的病毒的全基因組序列,確定其為Carlavirus屬的一種新病毒,命名為菊花R病毒(Chrysanthemum virus R,CVR)。CVR的基因組全長為8,874nt(不包括poly(A)尾),編碼6個開放閱讀框。田間調(diào)查數(shù)據(jù)表明,菊花栽培過程中接近半數(shù)的樣品被CVR侵染,其為害情況高于菊花常見病毒CVB。田間調(diào)查時發(fā)現(xiàn)有表現(xiàn)病毒花葉癥狀的菘藍植株,用RT-PCR方法檢測到其被黃瓜花葉病毒(Cucumbermosaicvirus,CMV)侵染。通過對CMV菘藍分離物CP基因序列的擴增和特征分析,明確了其屬于CMVⅠ亞組。這是首次用分子生物學(xué)方法確定CMV可以侵染菘藍,對菘藍花葉病綜合有效的防控具有重要意義。2016年秋季和2017年春季分別采集毛花洋地黃樣品,經(jīng)生物學(xué)檢測和RT-PCR分子生物學(xué)檢測,秋季樣品被CMV和甜菜西部黃化病毒(Beet Western Yellow Virus,BWYV)復(fù)合侵染,春季樣品被蠶豆萎蔫病毒2號(Broad bean wilt virus2,BBWV2)和油菜花葉病毒(Youcai mosaic virus,YoMV)復(fù)合侵染。設(shè)計特異引物進行RT-PCR克隆了 BWYV-毛花洋地黃分離物、BBWV2-毛花洋地黃分離物和YoMV-毛花洋地黃分離物的部分序列信息。這是首次用生物學(xué)和分子生物學(xué)方法,在毛花洋地黃病毒病樣品上分別檢測到了 CMV和BWYV及BBWV2和YoMV的復(fù)合侵染。
【學(xué)位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S435.67
【圖文】:

病毒病,菊花,癥狀,矮化


3.2.1.1檢測樣品逡逑2017年2月北京市植保站提供的4份菊花樣品,分別編號為JH-1?4,均表現(xiàn)逡逑矮化癥狀,JH-3同時表現(xiàn)矮化和黃化癥狀(圖3-1)。逡逑漏_逡逑JH-1邐JH-2逡逑mm逡逑JH邋-3邐JH-4逡逑圖3-1菊花病毒病癥狀圖逡逑Fig.邋3-1邋Symptoms邋of邋Chrysanthemum邋morifolium邋virus邋disease逡逑

電泳圖,菊花,電泳圖,樣品


RT-PCR邋檢測病毒:CMV、Pozyw-ms1、CSVd邋和邋CVB。逡逑RT-PCR檢測:采用TRNzol法(具體方法參照第二章)分別提取菊花樣品葉片逡逑總RNA,對樣品的總RNA電泳,從電泳圖(圖3-2)中可觀察到rRNA條帶,表明逡逑4個樣品的總RNA提取成功。逡逑1邐2邐3邐4邋M逡逑注:2,000邋RNA邋marker;邋1邋?4:菊花樣品邋1邋?4逡逑圖3-2菊花樣品總RNA電泳圖逡逑Fig.邋3-2邋Electrophoresis邋of邋RNA邋of邋Chrysanthemum邋morifolium邋samples逡逑RT-PCR結(jié)果顯示,CVB的特異檢測引物CVB-U/CVB-L在JH-4樣品中擴增逡逑到與陽性對照大小一致的條帶,CSVd特異檢測引物CSVd-208F/CSVd-207R在JH-逡逑1和JH-3樣品中擴增到與陽性對照大小一致的條帶(圖3-3)。逡逑邐CVB邐邋邐CVSd邐逡逑123456789邐10邋M逡逑750邋bp逡逑丨、'邐B^-500邋bp逡逑■?—250邋bp逡逑注:M:邋2,000DNAmarker;邋1、6:邋JH-1;邋2、7:邋JH-2;邋3、8:邋JH-3;邋4、9:邋JH_4;邋5、10:陰逡逑性對照;逡逑

電泳圖,病毒病,羅漢果,癥狀


RT-PCR邋檢測病毒:CMV、Pozyw-ms1、CSVd邋和邋CVB。逡逑RT-PCR檢測:采用TRNzol法(具體方法參照第二章)分別提取菊花樣品葉片逡逑總RNA,對樣品的總RNA電泳,從電泳圖(圖3-2)中可觀察到rRNA條帶,表明逡逑4個樣品的總RNA提取成功。逡逑1邐2邐3邐4邋M逡逑注:2,000邋RNA邋marker;邋1邋?4:菊花樣品邋1邋?4逡逑圖3-2菊花樣品總RNA電泳圖逡逑Fig.邋3-2邋Electrophoresis邋of邋RNA邋of邋Chrysanthemum邋morifolium邋samples逡逑RT-PCR結(jié)果顯示,CVB的特異檢測引物CVB-U/CVB-L在JH-4樣品中擴增逡逑到與陽性對照大小一致的條帶,CSVd特異檢測引物CSVd-208F/CSVd-207R在JH-逡逑1和JH-3樣品中擴增到與陽性對照大小一致的條帶(圖3-3)。逡逑邐CVB邐邋邐CVSd邐逡逑123456789邐10邋M逡逑750邋bp逡逑丨、'邐B^-500邋bp逡逑■?—250邋bp逡逑注:M:邋2,000DNAmarker;邋1、6:邋JH-1;邋2、7:邋JH-2;邋3、8:邋JH-3;邋4、9:邋JH_4;邋5、10:陰逡逑性對照;逡逑

【參考文獻】

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本文編號:2753360

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