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柑橘黃龍病快速檢測技術(shù)研制及應用

發(fā)布時間:2020-05-31 09:29
【摘要】:柑橘黃龍病(Citrus Huanglongbing,HLB)是世界柑橘生產(chǎn)上極具毀滅性的病害。我國至今尚無有效的藥劑可用于根治黃龍病,也未見報道選育出可靠的抗病品種和砧木,主要以挖除病樹、防控柑橘木虱、使用無病苗木的手段來防控黃龍病。因此,柑橘苗木帶病情況及大田植株感病情況的快速檢測對有效防控柑橘黃龍病尤為重要。柑橘黃龍病的檢測方法主要有常規(guī)PCR、巢式PCR、定量PCR、顯微鏡觀察、血清學診斷、光譜檢測等。由于柑橘黃龍病菌具有多樣性,前人報道的柑橘黃龍病病原菌抗體多數(shù)均只能與相似的抗原結(jié)合,不能廣泛地應用于不同區(qū)域、不同品種的柑橘黃龍病檢測。環(huán)介導等溫擴增(LAMP)技術(shù)相比于傳統(tǒng)的檢測方法,更省時省力,節(jié)約檢測成本。因此,本論文針對廣西柑橘黃龍病病原開展了多克隆抗體的研究,同時建立柑橘黃龍病可視化LAMP體系并對廣西部分地區(qū)的柑橘苗木和田間植株進行黃龍病檢測。主要研究結(jié)果如下:(1)根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫中多條柑橘黃龍病病原菌外膜蛋白omp基因,設(shè)計特異引物克隆目的片段并構(gòu)建原核表達載體pET32a-omp1,將其質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到大腸桿菌表達菌株BL21(DE3)中進行重組蛋白誘導表達。在優(yōu)化后的條件下(添加誘導劑IPTG0.6 mM,在37℃下誘導表達5 h)誘導得到大量以包涵體形式表達的重組蛋白。經(jīng)Western Blot驗證,成功獲得約55kDa的重組蛋白。將該重組蛋白進行純化(純度≥90%)后作為抗原,制備柑橘黃龍病病菌omp多克隆抗體,最終得到效價超過1:512 K的多克隆抗體(2)利用PrimerExplorer V5在線軟件在柑橘黃龍病病原菌16SrDNA序列保守區(qū)域的6個位點設(shè)計LAMP引物,對LAMP反應體系與反應條件進行優(yōu)化得到Mg2+6 mM,dNTP 1.2 mM,FIP/BIP 1.6 μM,F3/B3 0.2 μM,B.st DNA聚合酶大片段0.24 U/μL,1O×ThermoPol 2.5μL,0.2%Tween-20為最佳反應體系,65℃反應50 min,80℃滅活7 min為最優(yōu)反應條件,添加1μL10倍稀釋的SYBR Green I核酸染料顯色觀察反應結(jié)果。建立的LAMP體系僅對黃龍病基因進行擴增,特異性高。將感染柑橘黃龍病植株葉脈總DNA倍比稀釋后作為模板檢測靈敏度,LAMP檢測下限可達2.18ng/μL,高于常規(guī)PCR檢測100倍,與熒光定量PCR相當。應用常規(guī)PCR和建立的可視化LAMP檢測方法對廣西部分地區(qū)的不同品種柑橘苗木和田間植株進行黃龍病檢測。網(wǎng)室培育的25株香橙砧木和25株香橙砧金秋砂糖桔嫁接苗,均未檢測出柑橘黃龍病菌;田間植株155株,柑橘黃龍病LAMP檢測方法檢出的陽性率為13.6%,常規(guī)PCR檢測方法的陽性率為11.6%,常規(guī)PCR檢測結(jié)果為陽性的樣品在LAMP檢測結(jié)果中均為陽性,建立的LAMP體系可用于廣西柑橘黃龍病田間樣品與苗木的快速檢測。
【圖文】:

柑橘黃,黃化


A:正常葉;B:缺鋅狀黃化;C:葉脈黃化;D:均勾黃化;E:斑駁黃化;F:枝梢黃化;G:紅鼻逡逑子果;H:整株樹黃化逡逑Fig.邋1-1邋Symptoms邋of邋Citrus邋Huanglongbing逡逑A:邋Normal邋leaf;邋B:邋Zinc邋deficiency邋yellowing;邋C:邋Leaf邋vein邋yellowing;邋D:邋Uniform逡逑yellowing;邋E:邋Mottled邋yellowing;邋F:邋Shoot邋yellowing;邋G:邋Red邋nose邋fruit;邋H:邋The邋whole逡逑tree邋yellowing逡逑1.1.3柑橘黃龍病的傳播途徑逡逑柑橘黃龍病短距離傳播主要是通過采用感病的接穗或砧木進行嫁接以及柑Kuwayama)吸食感病植株的汁液后再去取食健康植株的汁播,柑橘木虱是目前報道黃龍病的唯一傳播蟲媒。此外,黃龍病還可以通過菟絲植株間傳播(柯穗等,1986)。長距離的傳播是通過將染病的苗木遠距離運輸域,再通過上述3種途徑進行大范圍的擴散。目前尚未見有柑橘黃龍病可通過的報道,也不會通過汁液摩擦和土壤傳播。逡逑

示意圖,引物設(shè)計,示意圖


等于2000年開發(fā)的一種高效、簡便、廉價的核酸恒溫擴增方法。該技術(shù)針對靶基因的6逡逑個特定區(qū)域(F3、F2、FI、B3、B2、B1)設(shè)計4條特異引物,包括兩條外引物(F3/B3)逡逑和兩條內(nèi)引物(FIB/BIP)(如圖1-2),借助具有鏈置換作用的Bst邋DNA聚合酶在恒逡逑溫條件下進行靶序列高效擴增。在LAMP反應的過程中析出大量的焦磷酸根離子與反應逡逑體系中的Mg2+結(jié)合,,形成焦磷酸鎂沉淀,因此,反應結(jié)束后可通過肉眼觀察把序列是逡逑否存在,或者借助濁度計檢測。也可以通過添加熒光顯色劑來觀察反應結(jié)果,常用的熒逡逑光染料有鈣黃綠素(Calcein)、羥基萘酚藍(HNB)、Dye63、SYBR邋Green邋I。LAMP逡逑的反應產(chǎn)物是一系列大小不一的DNA片段混合物,因此也可以通過瓊脂糖凝膠電泳檢逡逑測有無梯狀條帶來判定檢測結(jié)果。逡逑EE1逡逑f>ri,,lfr\邋F3C邋F2c邋Fir邋Tar?eC邋DNA邐R1邋B2邋B3逡逑fv=Ss邋邐S=K邋=1逡逑F3邋F2邋FI邐Bit邋B2c邋B3c邋邐逡逑S'邋nms'邋33逡逑B3邋Primer逡逑圖1-2邋LAMP引物設(shè)計示意圖逡逑Fig.邋1-2邋Design邋ofLAMPprimers逡逑(https://wenku.baidu.com/view/094df35aad5邋lfD邋ldc281邋fl邋aa.html)逡逑LAMP技術(shù)的基本原理是:當反應開始時,由于上游內(nèi)引物HP的Tm值和濃度均逡逑大于上游外引物F3
【學位授予單位】:廣西大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:S436.66

【參考文獻】

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本文編號:2689647

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