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馬鈴薯瘡痂病的分離和檢測體系構建

發(fā)布時間:2020-04-30 03:10
【摘要】:馬鈴薯是繼水稻、小麥和玉米之后的世界第四大糧食作物,也是我國農民增收的重要途徑和糧食安全的重要保障。馬鈴薯瘡痂病是鏈霉菌引起的一種表皮性病害,多發(fā)生在北方,近年來,瘡痂病在我國一些南方馬鈴薯產(chǎn)區(qū)也頻繁發(fā)生,嚴重影響塊莖的外觀品質。本研究收集了廣東和湖北兩省的瘡痂病塊莖,進行了瘡痂病的分離鑒定,在此基礎上建立了瘡痂病的相關檢測體系,為瘡痂病的防控奠定了基礎,主要結果如下:1.收集了廣東、湖北兩省五個地區(qū)的瘡痂病塊莖102個,觀察分析了它們的癥狀類型,及在培養(yǎng)基上鏈霉菌的培養(yǎng)特征,孢子鏈形態(tài),并從湖北襄陽的瘡痂癥狀塊莖中分離得到XY-12菌株;2.通過表型和顯微觀察、16S rDNA測序,初步鑒定襄陽瘡痂病分離菌株XY-12為Streptomyces bottropensis,進一步的盆栽接種鑒定表明,該分離菌株在接種濃度1.68×10~3 CFU/mL以上能夠導致馬鈴薯中薯5號產(chǎn)生瘡痂病癥狀;3.在收集Streptomyces scabies、S.acidiscabies、S.bottropensis、S.stelliscabiei、S.europeascabiei五種致病菌的66條txtA基因序列的基礎上,設計了txtA的特異PCR引物CS-67s/379a,并對退火溫度以及模板、引物濃度進行了優(yōu)化;通過對田間樣品的檢測,表明該方法能特異檢測瘡痂病,能夠靈敏的檢測到10~(-6) ng瘡痂病菌的DNA;4.進一步基于txtA基因設計了5對RPA引物,經(jīng)檢測效果良好,選取其中的一對引物CS-RPA126s/395a分別進行PCR和RPA分析,RPA能夠檢測10~(-4)ng瘡痂病DNA,低于PCR的靈敏度10倍,但RPA技術可以不依賴復雜的儀器就實現(xiàn)等溫擴增,且與PCR引物CS-67s/379a的檢測結果有高度的一致性。
【圖文】:

馬鈴薯瘡痂病,癥狀,細節(jié),瘡痂


將各地的病薯采集后發(fā)現(xiàn),不同地區(qū)瘡癡病薯的癥狀有很大差異,同區(qū)的病薯癥狀變化也較大,具有凹陷型、凸起型和平狀瘡痂中的其中兩種癥狀。如圖 3.1(下頁),1-4 號分別為廣東惠東地區(qū)(稔山、鐵涌、平海)及廣東市塊莖樣品,其主要有平狀和凹陷型瘡痂;5-8 號為湖北武漢華中農業(yè)大學馬鈴驗基地收集的塊莖樣品,其主要有凸起和平狀瘡痂;9-12 號為湖北襄陽地區(qū)塊品,其主要有凹陷和平狀瘡痂;13-16 號為湖北云夢地區(qū)塊莖樣品,其主要有凹平狀瘡痂。圖 3.2 展示了不同的馬鈴薯瘡痂病癥狀的細節(jié)圖,由圖可以看到,病斑形狀角星狀(圖 3.2-2,3.2-3)、橢圓形(圖 3.2-6)、不規(guī)則形(圖 3.2-4,3.2-5斑面積大小差異較大,有的單個病斑面積小且密集(圖 3.2-1,3.2-6),有的面且連成一片(圖 3.2-2,3.2-4,3.2-5)、凹陷深度差異較大,有凹陷較大(圖 3.2-入塊莖內部、有的在表層(圖 3.2-1,3.2-6)不深入塊莖內部。說明馬鈴薯瘡痂癥狀表現(xiàn)多樣。

湖北,襄陽,馬鈴薯,癥狀


15圖 3.1 不同地區(qū)馬鈴薯瘡癡病的癥狀Fig.3.1 The symptoms of potato scab from different areas in China廣東病薯(1-4),湖北華農病薯(5-8),湖北襄陽病薯(9-12),,湖北云夢病薯(13-16)tuber from Guangdong province(1-4); tuber from HZAU(5-8);tuber from Xiangyang of Hubeiprovince(9-12);tuber from Yunmeng of Hubei province(13-16)
【學位授予單位】:華中農業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:S435.32

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