吸煙與飲酒多效基因遺傳位點的鑒定
本文關(guān)鍵詞:吸煙與飲酒多效基因遺傳位點的鑒定
更多相關(guān)文章: 吸煙行為 飲酒行為 條件錯誤發(fā)現(xiàn)率 多效基因
【摘要】:持續(xù)吸煙和過度飲酒是現(xiàn)今世界上主要的公共衛(wèi)生問題。酒精依賴和尼古丁依賴是促成發(fā)病和死亡的兩大主要因素,屬于受環(huán)境因素和遺傳影響的復(fù)雜疾病,兩者表現(xiàn)出高度的共患病現(xiàn)象。流行病學(xué)研究表明吸煙和飲酒之間的關(guān)聯(lián)性,但是他們的關(guān)聯(lián)本質(zhì)還不清楚。盡管傳統(tǒng)全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)已經(jīng)鑒定了一些與酒精和尼古丁依賴相關(guān)聯(lián)的單核苷酸多態(tài)性(SNPs),但是這些SNPs僅僅只解釋了部分估計的遺傳力。在本項研究中,我們運用最新的遺傳基因多效性統(tǒng)計方法分析現(xiàn)有的GWAS數(shù)據(jù),用來系統(tǒng)的探索吸煙行為(吸煙開始,吸煙開始年齡,每天吸煙數(shù)量)與飲酒行為(飲酒,酒精消耗)之間共享的遺傳多效位點。首先,使用分層Q-Q圖來表現(xiàn)飲酒行為和吸煙行為的多效基因富集情況。飲酒和吸煙行為各表型的分層Q-Q圖曲線表示飲酒和吸煙數(shù)量、吸煙開始存在顯著多效富集,飲酒和吸煙開始年齡多效富集不明顯。酒精消耗和吸煙行為各表型的分層Q-Q圖曲線表示酒精消耗和吸煙開始之間存在部分多效富集情況,與吸煙數(shù)量之間有少許的多效富集,但是與吸煙開始年齡之間表現(xiàn)出不存在富集。運用條件錯誤發(fā)現(xiàn)率(cFDR)方法,結(jié)合獨立的吸煙行為各表型和飲酒行為各表型的GWAS樣本,我們鑒定了17個位點與吸煙行為有關(guān),36個位點與飲酒行為有關(guān),閾值為condFDR≤0.05。共發(fā)現(xiàn)有14個位點與吸煙和飲酒兩者同時相關(guān)(conjFDR≤0.05),其中4個SNPs(rs6265,rs11783438,rs1564499,rs11784248)分別位于BDNF基因、CSMD1基因、ADAMTS7基因和SGCZ基因區(qū)域。這四個基因上的一些變異位點曾在大樣本全基因組關(guān)聯(lián)研究中被報道分別與吸煙行為各表型表現(xiàn)出邊緣顯著性。我們的研究充分驗證了這些邊緣顯著結(jié)果,還發(fā)現(xiàn)這些基因同時可能與飲酒行為有關(guān),可能對煙堿依賴和酒依賴共患病的了解有重要意義。剩余的10個多效基因位點均被鑒定與吸煙行為和飲酒行為可能相關(guān)。發(fā)現(xiàn)的這些基因位點可能不一定反映真實的遺傳多效性,但是,這些共享位點可能是尼古丁依賴與酒依賴潛在的共同基礎(chǔ),需要在更大更詳細(xì)的表型樣本中進(jìn)行探索以及進(jìn)一步的實驗工作來闡明這些發(fā)現(xiàn)的生物學(xué)基礎(chǔ)。總之,我們的研究使用最新的遺傳多效基因發(fā)現(xiàn)方法鑒定了一些與吸煙行為和飲酒行為相關(guān)的新的常見基因變異,而這些新的位點在傳統(tǒng)GWAS方法分析中沒有被發(fā)現(xiàn)。鑒定的多效基因位點表明尼古丁依賴和酒依賴之間潛在的共同病理機(jī)制,對尼古丁依賴和酒依賴的治療有重要意義。
【關(guān)鍵詞】:吸煙行為 飲酒行為 條件錯誤發(fā)現(xiàn)率 多效基因
【學(xué)位授予單位】:湖南師范大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R749.6;R440
【目錄】:
- 中文摘要3-5
- ABSTRACT5-10
- 第一章 研究綜述10-20
- 1.1 吸煙行為10-15
- 1.1.1 吸煙行為的流行病學(xué)研究10-11
- 1.1.2 尼古丁依賴的神經(jīng)生物學(xué)基礎(chǔ)11
- 1.1.3 尼古丁乙酰膽堿受體11-13
- 1.1.4 尼古丁依賴的神經(jīng)遞質(zhì)基礎(chǔ)13-14
- 1.1.5 尼古丁的代謝14-15
- 1.2 飲酒行為的流行病學(xué)研究15
- 1.3 尼古丁依賴與酒依賴共病15-19
- 1.3.1 尼古丁依賴與酒依賴共病的流行病學(xué)15-16
- 1.3.2 尼古丁依賴與酒依賴共病的遺傳學(xué)基礎(chǔ)16-18
- 1.3.3 與尼古丁依賴和酒依賴共病相關(guān)的基因18-19
- 1.4 本學(xué)位論文的創(chuàng)新性及意義19-20
- 第二章 吸煙行為與飲酒行為多效基因研究20-44
- 2.1 研究背景20-21
- 2.2 材料和方法21-26
- 2.2.1 樣本21-22
- 2.2.2 統(tǒng)計分析22-26
- 2.3 結(jié)果26-39
- 2.3.1 飲酒與吸煙行為各表型的分層Q-Q圖26-27
- 2.3.2 酒精消耗與吸煙行為各表型的分層Q-Q圖27-30
- 2.3.3 吸煙行為各表型基因位點30-32
- 2.3.4 飲酒行為各表型基因位點32-35
- 2.3.5 吸煙行為和飲酒行為的多效基因位點35-39
- 2.4 討論39-44
- 參考文獻(xiàn)44-54
- 后記54-55
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本文編號:840845
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