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基于質(zhì)譜的常見呼吸道病原體高通量檢測方法的建立與應用

發(fā)布時間:2022-02-13 08:31
  呼吸道感染給人類造成了嚴重的疾病負擔,特別是對于兒童的生命健康構成了極大的威脅。能夠?qū)е氯祟惡粑栏腥镜牟≡w種類繁多,超過80%的病例由病毒感染引起,而重癥及死亡病例則主要歸因于細菌的感染。準確掌握呼吸道感染的病原譜,可以為制訂相關傳染病的防控策略提供依據(jù);臨床上及早明確病原體,進行針對性的抗感染治療則是控制感染的關鍵環(huán)節(jié)。目前常規(guī)使用的病原體鑒定方法:如病原體培養(yǎng)、血清學檢測、免疫學檢測等存在著耗費時間長、靈敏度低等缺點。以PCR技術為代表的分子檢測方法靈敏快速,但大多無法兼顧病原體覆蓋廣度和樣本檢測通量這兩個關鍵因素。同時,一些較為先進的檢測技術卻因昂貴的檢測費用而難以廣泛應用。鑒于此,本課題的目標是建立一種高效、廉價的呼吸道病原體檢測方法。在本課題中,我們使用MassARRAY系統(tǒng)作為檢測平臺,利用多重PCR與MALDI-TOF質(zhì)譜技術聯(lián)用來鑒定目標病原體。通過對呼吸道病原體流行病學、檢測方法的指南和文獻進行綜述,我們選擇在呼吸道感染中常見、并且與疾病發(fā)生相關的病原體納入檢測范圍。對于每一種目標病原體,選擇種間特異且種內(nèi)保守的基因作為檢測靶基因。根據(jù)不同的病原體類別,其序列的收... 

【文章來源】:北京協(xié)和醫(yī)學院北京市211工程院校985工程院校

【文章頁數(shù)】:114 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

基于質(zhì)譜的常見呼吸道病原體高通量檢測方法的建立與應用


R自,sA}RA}系統(tǒng)的檢狽J原理

亞型,反應濃度,梯度


圖13:人偏肺病毒A、B亞型,人呼吸道合胞病毒A、B亞型、人博卡病毒1型、??2型特異度評價結(jié)果。每個目標病原的一組質(zhì)譜圖中,上圖為陰性樣本的檢測結(jié)果,??下圖為陽性樣本的檢測結(jié)果。??4.3.2?RV-MS靈敏度的評價??我們將RV-MS的每一個檢測靶基因克隆進入載體,根據(jù)定量結(jié)果進行稀釋,??制備十倍質(zhì)粒梯度,用RV-MS測試1拷貝每反應,至10000拷貝每反應,五個濃??度梯度,每個梯度進行三次重復實驗。對于RV-MS,在100拷貝每反應濃度,所有??的目標病原體三次重復都能檢測得到陽性結(jié)果,在10拷貝每反應濃度,部分重復??實驗可以觀察到陽性結(jié)果。據(jù)此我們估計,RV-MS的檢出限大約在10-100拷貝每??68??

靈敏度,實驗結(jié)果,博士學位論文,檢出限


北京協(xié)和醫(yī)學院中國醫(yī)學科學院?博士學位論文??4.4.2?RB-MS靈敏度的評價??評價方法與實驗流程同4.3.2節(jié)RV-MS靈敏度評價。評價的結(jié)果與RV-MS?—??致,RB-MS的檢出限大約在10-100拷貝每反應之間。圖16是部分RB-MS靈敏度??評價的實驗結(jié)果。??(A)?Hoemophilvs?influenzae?(B)?Neisseria?meningitidis??20t?1?20f?<.?->??


本文編號:3622863

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