背景:人體腸道微生物與宿主的健康和疾病狀態(tài)息息相關(guān),近年來高通量測序和組學(xué)技術(shù)的發(fā)展將人們對腸道菌群的認(rèn)知和理解引領(lǐng)到一個新的高度。但同時,分離獲得更多的腸道細(xì)菌純培養(yǎng)物的局限性和重要性也日益彰顯。一方面,由于腸道菌群的高度多樣性和復(fù)雜性以及傳統(tǒng)培養(yǎng)方法的限制,目前得到的腸道細(xì)菌種類僅占腸道細(xì)菌總量的極少數(shù),且多數(shù)細(xì)菌的功能是未知的;另一方面,獲得更多的細(xì)菌純培養(yǎng)物并確定其分類和功能,是人體微生物組研究的物質(zhì)基礎(chǔ),對解析腸道菌群與宿主共生的機制具有重要意義。目的:1、分析不同培養(yǎng)條件下的菌群特征及腸道可培養(yǎng)細(xì)菌的初步探索;2、對分離得到的可疑新菌種用多相分類學(xué)方法進(jìn)行鑒定,確定其系統(tǒng)發(fā)育學(xué)地位;3、對分類錯誤的[Clostridium]hiranonis進(jìn)行重新分類,完善微生物分類學(xué)系統(tǒng)。方法及結(jié)果:本研究第一部分首先通過對不同培養(yǎng)條件下菌群數(shù)據(jù)的分析,說明不同培養(yǎng)條件對體外培養(yǎng)腸道菌群多樣性及結(jié)構(gòu)的影響;其次利用多重培養(yǎng)條件以及質(zhì)譜和16S rRNA基因測序等多種鑒定手段,從人體糞便樣本中分離培養(yǎng)出185種不同的腸道細(xì)菌。這些細(xì)菌分別來自厚壁菌門、變形菌門、擬桿菌門、放線菌門和梭桿菌... 

【文章來源】：南方醫(yī)科大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】：107 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖２－１腸道細(xì)菌分離培養(yǎng)的基本流程??Ｆｉｇ．?２－１?Ｔｅｃｈｎｉｃａｌ?ｒｏｕｔｅ?ｆｏｒ?ｉｓｏｌａｔｉｏｎ?ａｎｄ?ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?ｉｎｔｅｓｔｉｎａｌ?ｂａｃｔｅｒｉａ??

＿ｔｒｅｅ?和?Ｓｈａｎｎｏｎ?四??個指數(shù)均顯示個體Ｃ的ａ多樣性明顯高于個體Ａ和個體Ｂ的ｃｉ多樣性（圖２－３）；??且３個個體的３多樣中基于Ｕｎｗｅｉｇｈｔｅｄ＋ｕｎｉｆｒａｃ的ＰＣｏＡ圖顯示個體間菌群有??顯著差異（圖２－４）。這提示，個體來源不同的樣本在不同條件下培養(yǎng)后的菌群??仍存在個體差異。因此后續(xù)分析不同培養(yǎng)條件的腸道菌群特征時將Ａ、Ｂ、Ｃ?３個??個體的樣品分開分析。??ｐｖａｌｕｅ?＜０．００１?ｐｖａｌｕｅ?＜０?００１?ｐｖａｌｕｅ?＜０?００１?ｐｖａｌｕｅ?＜０．００１??｜?）?Ｋ〇ｉ?２２￡ｆ?１?Ｉ?????４００??Ａ?Ｂ?Ｃ?ＡＢＣ?ＡＢＣ?Ｂ?￣Ｃ??圖２－３來源不同個體的培養(yǎng)樣品的ａ多樣性比較??Ｆｉｇ．２－３?Ｃｏｍｐａｒｉｓｉｏｎ?ｏｆ?ａ－ｄｉｖｅｒｓｉｔ＼；?ｂｅｔｗｅｅｎ?ｃｕｌｔｕｒｅ?ｓａｍｐｌｅｓ?ｆｒｏｍ?ｄｉｆｌｅｒｅｎｌ?ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌｓ??注：Ａ、Ｂ、Ｃ分別表示來源三個不同個體的樣品??１９??

從基于Ｕｎｗｅｉｇｈｔｅｄ＋ｕｎｉｆｒａｃ距離的ＰＣｏＡ圖（圖２－６）可以看出，來源于同??一個體的樣品，經(jīng)過不同培養(yǎng)基培養(yǎng)后的菌群結(jié)構(gòu)存在顯著差異。篩選相對豐??度＞１％的細(xì)菌構(gòu)建菌群結(jié)構(gòu)堆積圖（圖２－７），可以看出，來源于同一個體的樣品??在不同培養(yǎng)基中培養(yǎng)后的菌群結(jié)構(gòu)不同，其中在缺乏碳源、氮源的營養(yǎng)缺乏的??ＰＢＳ和Ｓａｌｉｎｅ中，二者培養(yǎng)后的菌群組成結(jié)構(gòu)和各種細(xì)菌的相對比例較相似，??區(qū)分于其中四種培養(yǎng)基。??Ａ?＾?￥＝５?Ｂ?．?．￥０：４６?ｃ?￥?＝??？?．．．??？?＇?？?？?３」??＿＿，＿＿，?，＿＿，＿

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]role of the normal gut microbiota[J]. Sai Manasa Jandhyala,Rupjyoti Talukdar,Chivkula Subramanyam,Harish Vuyyuru,Mitnala Sasikala,D Nageshwar Reddy.  World Journal of Gastroenterology. 2015(29)



本文編號：3475160