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河北省結(jié)核分枝桿菌臨床分離株二線抗結(jié)核藥物耐藥特征及相關(guān)基因分析

發(fā)布時(shí)間:2021-05-24 05:15
  目的 調(diào)查河北省結(jié)核分枝桿菌二線抗結(jié)核藥物耐藥表型及耐藥相關(guān)基因突變分布特征,分析耐二線抗結(jié)核藥物菌株基因分型特點(diǎn),探討耐二線抗結(jié)核藥物菌株表型、耐藥相關(guān)基因突變及基因分型三者之間的關(guān)系,為了解結(jié)核病的流行趨勢(shì)、制定預(yù)防控制措施、快速診斷耐藥結(jié)核病、優(yōu)化抗結(jié)核治療方案等提供科學(xué)依據(jù)。方法 對(duì)2014年112月在河北省收集的316株耐藥結(jié)核分枝桿菌(指至少對(duì)異煙肼、利福平、乙胺丁醇、鏈霉素中的一種抗結(jié)核藥物耐藥)和100株泛敏感結(jié)核分枝桿菌進(jìn)行傳代復(fù)蘇,將成功復(fù)蘇的菌株通過比例法羅氏固體藥敏試驗(yàn)對(duì)氟喹諾酮類藥物(氧氟沙星、左氧氟沙星)和二線注射類藥物(卷曲霉素、卡那霉素、阿米卡星)等共5種二線抗結(jié)核藥物進(jìn)行藥物敏感性試驗(yàn)檢測(cè)。運(yùn)用一代DNA測(cè)序技術(shù)對(duì)二線抗結(jié)核藥物耐藥相關(guān)基因gyrA、gyrB、rrs、eis啟動(dòng)子區(qū)、tlyA進(jìn)行序列分析。采用間隔區(qū)寡核苷酸分型(Spoligotyping)技術(shù)和分枝桿菌散在重復(fù)單位-數(shù)目可變串聯(lián)重復(fù)序列(Mycobacterial interspersed repetitive units-variable number tand... 

【文章來源】:華北理工大學(xué)河北省

【文章頁(yè)數(shù)】:69 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
abstract
英文縮略表
引言
第1章 結(jié)核分枝桿菌臨床分離株對(duì)二線抗結(jié)核藥物耐藥表型分析
    1.1 材料與方法
        1.1.1 主要材料
        1.1.2 菌株篩選
        1.1.3 菌株傳代復(fù)蘇
        1.1.4 比例法藥物敏感性試驗(yàn)
        1.1.5 本文中所涉及的相關(guān)定義
        1.1.6 數(shù)據(jù)管理與統(tǒng)計(jì)分析
    1.2 結(jié)果
        1.2.1 菌株傳代復(fù)蘇結(jié)果
        1.2.2 納入本研究結(jié)核病患者一般情況
        1.2.3 五種二線抗結(jié)核藥物(OFX、LVX、KAN、AMK和 CAP)菌株耐藥表型特征
        1.2.4 五種二線抗結(jié)核藥物(OFX、LVX、KAN、AMK和 CAP)菌株交叉耐藥特征
        1.2.5 初治與復(fù)治結(jié)核患者二線抗結(jié)核藥物耐藥特征分析
        1.2.6 二線抗結(jié)核藥物菌株耐藥表型與MDR-TB、Pre-XDR-TB及XDR-TB之間關(guān)聯(lián)性分析
    1.3 討論
    1.4 小結(jié)
    參考文獻(xiàn)
第2章 結(jié)核分枝桿菌臨床分離株對(duì)二線抗結(jié)核藥物耐藥相關(guān)基因分析
    2.1 材料與方法
        2.1.1 主要材料
        2.1.2 菌株來源
        2.1.3 基因組DNA提取
        2.1.4 引物設(shè)計(jì)與合成
        2.1.5 PCR反應(yīng)條件
        2.1.6 瓊脂糖凝膠電泳
        2.1.7 DNA測(cè)序與序列比對(duì)
        2.1.8 基因分型
        2.1.9 主要生物信息分析工具
        2.1.10 統(tǒng)計(jì)分析與計(jì)算公式
    2.2 結(jié)果
        2.2.1 耐FQs菌株與gyrA、gyrB基因突變
        2.2.2 耐SLIDs菌株與rrs、eis啟動(dòng)子區(qū)、tlyA基因突變
        2.2.3 表型耐藥與基因型耐藥的關(guān)系分析
        2.2.4 DNA測(cè)序技術(shù)在預(yù)測(cè)耐二線抗結(jié)核菌株表型耐藥的診斷價(jià)值
        2.2.5 五種二線抗結(jié)核藥物耐藥率、耐藥相關(guān)基因突變率與北京基因型的關(guān)系
        2.2.6 耐二線抗結(jié)核藥物菌株和XDR菌株的傳播模式分析
    2.3 討論
    2.4 小結(jié)
    參考文獻(xiàn)
第3章 綜述 結(jié)核分枝桿菌原發(fā)性和獲得性耐藥機(jī)制及診斷方法新進(jìn)展
    3.1 結(jié)核分枝桿菌耐藥機(jī)制
        3.1.1 原發(fā)性耐藥機(jī)制
        3.1.2 獲得性耐藥機(jī)制
    3.2 結(jié)核分枝桿菌耐藥性診斷方法
        3.1.1 表型試驗(yàn)
        3.1.2 Xpert MTB/RIF
        3.1.3 線性探針試驗(yàn)(LPAs)
        3.1.4 測(cè)序技術(shù)
    3.3 結(jié)語
    參考文獻(xiàn)
結(jié)論
附錄A 二線抗結(jié)核藥物耐藥相關(guān)基因特征性測(cè)序結(jié)果
致謝
導(dǎo)師簡(jiǎn)介
導(dǎo)師簡(jiǎn)介
作者簡(jiǎn)介
學(xué)位論文數(shù)據(jù)集


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):3203618

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