基質(zhì)輔助激光解吸/電離飛行時(shí)間質(zhì)譜用于細(xì)菌鑒定和同源性分析能力的實(shí)驗(yàn)研究
發(fā)布時(shí)間:2021-05-21 17:48
目的:研究基質(zhì)輔助激光解吸/電離飛行時(shí)間質(zhì)譜儀(matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)對細(xì)菌鑒定和耐藥菌同源性分析方面在臨床實(shí)驗(yàn)室應(yīng)用的可行性。方法:收集2015年1月至2016年1月我院臨床標(biāo)本分離獲得的非重復(fù)樣本,共440株。首先,利用VITEK 2全自動微生物鑒定及藥敏系統(tǒng)(采用傳統(tǒng)生化反應(yīng)技術(shù))和VITEK MS全自動快速微生物質(zhì)譜儀(采用MALDI-TOF MS技術(shù))對這些株細(xì)菌進(jìn)行鑒定。然后,將上述方法鑒定結(jié)果不一致菌株再用細(xì)菌核糖體16S rRNA基因序列分析進(jìn)行鑒定;同時(shí),對基質(zhì)輔助激光解吸/電離飛行時(shí)間質(zhì)譜儀在檢測周轉(zhuǎn)時(shí)間(Turn-around time,TAT)方面的優(yōu)勢進(jìn)行評價(jià)。此外,收集2017年10月12月,經(jīng)改良Hodge實(shí)驗(yàn)(Modified Hodge test,MHT)篩選為陽性的肺炎克雷伯菌95株。利用多位點(diǎn)序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)、Mi...
【文章來源】:軍事科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:47 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
縮略語表
摘要
Abstract
前言
第一部分 儀器與試劑
1.1 菌株來源
1.1.1 MALDI-TOF MS鑒定所用菌株
1.1.2 MALDI-TOF MS對CRKP同源性分析所用菌株
1.1.3 VITEK MS全自動快速微生物質(zhì)譜檢測系統(tǒng)校準(zhǔn)菌株
1.1.4 實(shí)驗(yàn)質(zhì)控菌株
1.2 主要試劑配制方法
1.2.1 菌株保存培養(yǎng)基
1.2.2 70%甲酸溶液
1.2.3 標(biāo)準(zhǔn)溶劑
1.2.4 HCCA溶液
1.3 主要試劑
1.4 主要儀器
第二部分 MALDI-TOF MS用于鑒定常見細(xì)菌能力的研究
2.1 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及技術(shù)路線
2.2 VITEK2鑒定分析
2.2.1 主要操作步驟
2.2.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.3 MALDI-TOF MS鑒定分析
2.3.1 主要操作步驟
2.3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.4 16S rRNA基因分析方法對15株不一致菌株的鑒定分析
2.4.1 主要操作步驟
2.4.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.5 討論
第三部分 MALDI-TOF MS對CRKP同源性分析能力的研究
3.1 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及技術(shù)路線
3.2 改良Hodge實(shí)驗(yàn)(MHT)
3.2.1 主要步驟
3.3 多位點(diǎn)序列分型(MLST)
3.3.1 主要步驟
3.3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.4 MALDI-TOF MS同源性分析
3.4.1 主要操作步驟
3.4.2 95株CRKP鑒定得分
3.4.3 95株CRKP聚類分析結(jié)果
3.5 討論
第四章 結(jié)論與展望
參考文獻(xiàn)
附錄A 同源性分析質(zhì)譜靶板位點(diǎn)編號與樣本編號對應(yīng)表
附錄B 95株CRKP MALDI-TOF MS鑒定得分詳表
作者在學(xué)期間取得的學(xué)術(shù)成果
主要簡歷
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2013-2017年醫(yī)院感染現(xiàn)患率調(diào)查分析[J]. 余淑霞,許婷,馬鴻云. 中華醫(yī)院感染學(xué)雜志. 2018(08)
[2]2014-2017年某三級甲等綜合醫(yī)院醫(yī)院感染現(xiàn)患率的變化趨勢分析[J]. 李璐,索繼江,高巖,謝麗君,劉伯偉,姚宏武,劉運(yùn)喜. 中華醫(yī)院感染學(xué)雜志. 2018(08)
[3]某醫(yī)院2014年-2016年住院患者醫(yī)院感染綜合性監(jiān)測[J]. 孟冬梅,田立芝,李冠華,王聯(lián)群. 中華醫(yī)院感染學(xué)雜志. 2018(06)
[4]重癥監(jiān)護(hù)病房院內(nèi)獲得性感染的臨床分析[J]. 齊志麗,劉培,莊海舟,段美麗. 首都醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(01)
[5]社區(qū)及院內(nèi)耐甲氧西林金黃色葡萄球菌感染的臨床特征比較及耐藥性分析[J]. 弓清梅,張延軍,宋璐. 中國藥物與臨床. 2018(01)
[6]MALDI-TOF MS直接鑒定血培養(yǎng)陽性標(biāo)本中的病原菌[J]. 方毅,張景皓,趙虎. 老年醫(yī)學(xué)與保健. 2017(06)
[7]多重耐藥鮑曼不動桿菌的臨床流行特征[J]. 韓蕾,雷金娥,祁杰,徐紀(jì)茹,韓少山. 西安交通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2017(06)
[8]2016年中國CHINET細(xì)菌耐藥性監(jiān)測[J]. 胡付品,郭燕,朱德妹,汪復(fù),蔣曉飛,徐英春,張小江,張朝霞,季萍,謝軼,康梅,王傳清,王愛敏,徐元宏,沈繼錄,孫自鏞,陳中舉,倪語星,孫景勇,褚云卓,田素飛,胡志東,李金,俞云松,林潔,單斌,杜艷,郭素芳,魏蓮花,鄒鳳梅,張泓,王春,胡云建,艾效曼,卓超,蘇丹虹,汪瑞忠,房華,俞碧霞,趙勇,龔萍,郭大文,趙金英,劉文恩,李艷明,金炎,邵春紅,溫開鎮(zhèn),張貽榮,徐雪松,鄢超,喻華,黃湘寧,王山梅,楚亞菲,張利俠,馬娟,周樹平,周艷,朱鐳,孟晉華. 中國感染與化療雜志. 2017(05)
[9]3種鑒定系統(tǒng)在微生物室間質(zhì)量評價(jià)中的應(yīng)用和比較[J]. 陳蓉,居颺,劉戰(zhàn)民. 檢驗(yàn)醫(yī)學(xué). 2017(05)
[10]耐藥性細(xì)菌碳青霉烯酶檢測方法研究進(jìn)展[J]. 徐建民,陳水平,陳建魁. 標(biāo)記免疫分析與臨床. 2017(03)
碩士論文
[1]耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌的耐藥性及同源性研究[D]. 謝思.南方醫(yī)科大學(xué) 2017
本文編號:3200122
【文章來源】:軍事科學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:47 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
縮略語表
摘要
Abstract
前言
第一部分 儀器與試劑
1.1 菌株來源
1.1.1 MALDI-TOF MS鑒定所用菌株
1.1.2 MALDI-TOF MS對CRKP同源性分析所用菌株
1.1.3 VITEK MS全自動快速微生物質(zhì)譜檢測系統(tǒng)校準(zhǔn)菌株
1.1.4 實(shí)驗(yàn)質(zhì)控菌株
1.2 主要試劑配制方法
1.2.1 菌株保存培養(yǎng)基
1.2.2 70%甲酸溶液
1.2.3 標(biāo)準(zhǔn)溶劑
1.2.4 HCCA溶液
1.3 主要試劑
1.4 主要儀器
第二部分 MALDI-TOF MS用于鑒定常見細(xì)菌能力的研究
2.1 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及技術(shù)路線
2.2 VITEK2鑒定分析
2.2.1 主要操作步驟
2.2.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.3 MALDI-TOF MS鑒定分析
2.3.1 主要操作步驟
2.3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.4 16S rRNA基因分析方法對15株不一致菌株的鑒定分析
2.4.1 主要操作步驟
2.4.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.5 討論
第三部分 MALDI-TOF MS對CRKP同源性分析能力的研究
3.1 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及技術(shù)路線
3.2 改良Hodge實(shí)驗(yàn)(MHT)
3.2.1 主要步驟
3.3 多位點(diǎn)序列分型(MLST)
3.3.1 主要步驟
3.3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.4 MALDI-TOF MS同源性分析
3.4.1 主要操作步驟
3.4.2 95株CRKP鑒定得分
3.4.3 95株CRKP聚類分析結(jié)果
3.5 討論
第四章 結(jié)論與展望
參考文獻(xiàn)
附錄A 同源性分析質(zhì)譜靶板位點(diǎn)編號與樣本編號對應(yīng)表
附錄B 95株CRKP MALDI-TOF MS鑒定得分詳表
作者在學(xué)期間取得的學(xué)術(shù)成果
主要簡歷
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2013-2017年醫(yī)院感染現(xiàn)患率調(diào)查分析[J]. 余淑霞,許婷,馬鴻云. 中華醫(yī)院感染學(xué)雜志. 2018(08)
[2]2014-2017年某三級甲等綜合醫(yī)院醫(yī)院感染現(xiàn)患率的變化趨勢分析[J]. 李璐,索繼江,高巖,謝麗君,劉伯偉,姚宏武,劉運(yùn)喜. 中華醫(yī)院感染學(xué)雜志. 2018(08)
[3]某醫(yī)院2014年-2016年住院患者醫(yī)院感染綜合性監(jiān)測[J]. 孟冬梅,田立芝,李冠華,王聯(lián)群. 中華醫(yī)院感染學(xué)雜志. 2018(06)
[4]重癥監(jiān)護(hù)病房院內(nèi)獲得性感染的臨床分析[J]. 齊志麗,劉培,莊海舟,段美麗. 首都醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(01)
[5]社區(qū)及院內(nèi)耐甲氧西林金黃色葡萄球菌感染的臨床特征比較及耐藥性分析[J]. 弓清梅,張延軍,宋璐. 中國藥物與臨床. 2018(01)
[6]MALDI-TOF MS直接鑒定血培養(yǎng)陽性標(biāo)本中的病原菌[J]. 方毅,張景皓,趙虎. 老年醫(yī)學(xué)與保健. 2017(06)
[7]多重耐藥鮑曼不動桿菌的臨床流行特征[J]. 韓蕾,雷金娥,祁杰,徐紀(jì)茹,韓少山. 西安交通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2017(06)
[8]2016年中國CHINET細(xì)菌耐藥性監(jiān)測[J]. 胡付品,郭燕,朱德妹,汪復(fù),蔣曉飛,徐英春,張小江,張朝霞,季萍,謝軼,康梅,王傳清,王愛敏,徐元宏,沈繼錄,孫自鏞,陳中舉,倪語星,孫景勇,褚云卓,田素飛,胡志東,李金,俞云松,林潔,單斌,杜艷,郭素芳,魏蓮花,鄒鳳梅,張泓,王春,胡云建,艾效曼,卓超,蘇丹虹,汪瑞忠,房華,俞碧霞,趙勇,龔萍,郭大文,趙金英,劉文恩,李艷明,金炎,邵春紅,溫開鎮(zhèn),張貽榮,徐雪松,鄢超,喻華,黃湘寧,王山梅,楚亞菲,張利俠,馬娟,周樹平,周艷,朱鐳,孟晉華. 中國感染與化療雜志. 2017(05)
[9]3種鑒定系統(tǒng)在微生物室間質(zhì)量評價(jià)中的應(yīng)用和比較[J]. 陳蓉,居颺,劉戰(zhàn)民. 檢驗(yàn)醫(yī)學(xué). 2017(05)
[10]耐藥性細(xì)菌碳青霉烯酶檢測方法研究進(jìn)展[J]. 徐建民,陳水平,陳建魁. 標(biāo)記免疫分析與臨床. 2017(03)
碩士論文
[1]耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌的耐藥性及同源性研究[D]. 謝思.南方醫(yī)科大學(xué) 2017
本文編號:3200122
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