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基質(zhì)輔助激光解吸/電離飛行時(shí)間質(zhì)譜用于細(xì)菌鑒定和同源性分析能力的實(shí)驗(yàn)研究

發(fā)布時(shí)間:2021-05-21 17:48
  目的:研究基質(zhì)輔助激光解吸/電離飛行時(shí)間質(zhì)譜儀(matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)對細(xì)菌鑒定和耐藥菌同源性分析方面在臨床實(shí)驗(yàn)室應(yīng)用的可行性。方法:收集2015年1月至2016年1月我院臨床標(biāo)本分離獲得的非重復(fù)樣本,共440株。首先,利用VITEK 2全自動微生物鑒定及藥敏系統(tǒng)(采用傳統(tǒng)生化反應(yīng)技術(shù))和VITEK MS全自動快速微生物質(zhì)譜儀(采用MALDI-TOF MS技術(shù))對這些株細(xì)菌進(jìn)行鑒定。然后,將上述方法鑒定結(jié)果不一致菌株再用細(xì)菌核糖體16S rRNA基因序列分析進(jìn)行鑒定;同時(shí),對基質(zhì)輔助激光解吸/電離飛行時(shí)間質(zhì)譜儀在檢測周轉(zhuǎn)時(shí)間(Turn-around time,TAT)方面的優(yōu)勢進(jìn)行評價(jià)。此外,收集2017年10月12月,經(jīng)改良Hodge實(shí)驗(yàn)(Modified Hodge test,MHT)篩選為陽性的肺炎克雷伯菌95株。利用多位點(diǎn)序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)、Mi... 

【文章來源】:軍事科學(xué)院北京市

【文章頁數(shù)】:47 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
縮略語表
摘要
Abstract
前言
第一部分 儀器與試劑
    1.1 菌株來源
        1.1.1 MALDI-TOF MS鑒定所用菌株
        1.1.2 MALDI-TOF MS對CRKP同源性分析所用菌株
        1.1.3 VITEK MS全自動快速微生物質(zhì)譜檢測系統(tǒng)校準(zhǔn)菌株
        1.1.4 實(shí)驗(yàn)質(zhì)控菌株
    1.2 主要試劑配制方法
        1.2.1 菌株保存培養(yǎng)基
        1.2.2 70%甲酸溶液
        1.2.3 標(biāo)準(zhǔn)溶劑
        1.2.4 HCCA溶液
    1.3 主要試劑
    1.4 主要儀器
第二部分 MALDI-TOF MS用于鑒定常見細(xì)菌能力的研究
    2.1 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及技術(shù)路線
    2.2 VITEK2鑒定分析
        2.2.1 主要操作步驟
        2.2.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
    2.3 MALDI-TOF MS鑒定分析
        2.3.1 主要操作步驟
        2.3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
    2.4 16S rRNA基因分析方法對15株不一致菌株的鑒定分析
        2.4.1 主要操作步驟
        2.4.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
    2.5 討論
第三部分 MALDI-TOF MS對CRKP同源性分析能力的研究
    3.1 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及技術(shù)路線
    3.2 改良Hodge實(shí)驗(yàn)(MHT)
        3.2.1 主要步驟
    3.3 多位點(diǎn)序列分型(MLST)
        3.3.1 主要步驟
        3.3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
    3.4 MALDI-TOF MS同源性分析
        3.4.1 主要操作步驟
        3.4.2 95株CRKP鑒定得分
        3.4.3 95株CRKP聚類分析結(jié)果
    3.5 討論
第四章 結(jié)論與展望
參考文獻(xiàn)
附錄A 同源性分析質(zhì)譜靶板位點(diǎn)編號與樣本編號對應(yīng)表
附錄B 95株CRKP MALDI-TOF MS鑒定得分詳表
作者在學(xué)期間取得的學(xué)術(shù)成果
主要簡歷
致謝


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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碩士論文
[1]耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌的耐藥性及同源性研究[D]. 謝思.南方醫(yī)科大學(xué) 2017



本文編號:3200122

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