研究目的在分子水平上初步探討我國大陸地區(qū)流行HAdV-4病毒株的基因特征與分子進化規(guī)律,為我國HAdV-4疫情的監(jiān)測、相關疾病的診斷與防控以及疫苗研究提供基礎數(shù)據(jù)。研究方法對2013～2015年間在發(fā)熱呼吸道癥候群監(jiān)測病例中鑒定為HAdV-4陽性的臨床標本進行病毒分離,對HAdV-4病毒分離株分別進行三個靶基因（Penton base、Hexon和Fiber）以及全基因組（Whole-genome sequences,WGS）序列擴增和測定,同時下載GenBank數(shù)據(jù)庫中所有我國及全球流行HAdV-4病毒株的上述基因序列,構建基因數(shù)據(jù)庫,并使用相關生物信息學分析軟件進行基因特征和分子進化分析。研究結果（1）從2013～2015年間的發(fā)熱呼吸道癥候群監(jiān)測病例獲得HAdV-4病毒分離株共計6株,分別來自陜西（2株）、云南（2株）、吉林（1株）和山東（1株）,覆蓋我國東北、華東、西北和西南部地區(qū);（2）基因親緣性關系分析結果顯示,全球流行HAdV-4病毒株可劃分為HAdV-4p和HAdV-4a兩個進化分支,我國大陸地區(qū)自2008年至今流行的HAdV4病毒株均屬于HAdV-4a進化分支,與全球... 

【文章來源】：安徽理工大學安徽省

【文章頁數(shù)】：71 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖３?ＨＡｄＶ?ＰＣＲ擴增產物的凝膠電泳鑒定結果??１：?Ｓｈａｎｄｏｎｇ２０１４－１６１４?標本的?ＰＣＲ?產物；２：?Ｙｕｎｎａｎ２０１４－２（）０８?標本的?ＰＣＲ?產物；３：陽??

７５０．?１０００?ａｎｄ?２０００；?５：?ＥＸ－ＮＣ：?６：ＮＣ??３．３．２斤：列測定結采??以標本Ｓｈａｎｄｏｎｇ２０１４－Ｉ６１４卜＿游引物Ａｄｉ測得的部分序列為例（圖４），所??Ｙｊ?ｖｌｊ株均獲得良好的堿基峰圖。??３．３．３?ＨＡｄＶ毒株的初步型別鑒定??將獲得的病毒株Ｌ〇〇Ｐ２基因片段原始核苷酸序列，經Ｓｅｑｕｅｎｃｈｅｒ?５．０軟件序??列整理后，與腺病毒Ａ？Ｇ?７個亞屬共３０種基因型代表株進行系統(tǒng)發(fā)育分析，共??鑒定出６株ＨＡｄＶ－４病毒株，用于本實驗的研究，初步基因定型鑒定結果見圖５。??－１５－??

ｂａｓｅ、Ｈｅｘｏｎ－１、Ｈｅｘｏｎ＿２?和?Ｆｉｂｅｒ?為例，長度分別為?２０７０ｂｐ、１６８９ｂｐ、１４４０?和??１７０６ｂｐ〇經１％瓊脂糖凝膠電泳鑒定后在相應大小范圍能看到清晰的陽性條帶，??如圖６所示。??■〇?麵：■囉｜：＿＿獨：：??誦…??７５０＾??ＳＯＯＢ＾＾ｊ?ａ?＇＂％＂?＇＾４．．；?ｆ－?＇?－ｆｔ??ｌ?〇〇?■■??圖６?ＨＡｄＶ?ＰＣＲ擴增三個靶基因產物的凝膠電泳鑒定結果（以標本川丨１１２０１４－３３７２擴增??結果為例）??１：?ＤＮＡ分子量對照（ＤＬ５０００）：陽性條帶自下往上分別為１００，?２５０，５００，?７５０，?１０００，??１５００．２０００．３０００?和?５０００；?２：?Ｊｉｌｉｎ２０１４－３３７２?標本的?ＰｅｎｔｏｎｂａｓｅＰＣＲ?產物；３：Ｊｉｌｉｎ２０１４－３３７２??標本的?Ｈｅｘｏｎ－１?ＰＣＲ?產物；４：?Ｊｉｌｉｎ２０１４－３３７２?標本的?Ｈｅｘｏｎ－２ＰＣＲ?產物；５：?Ｊｉｌｉｎ２０１４－３３７２??標本的ＲｂｅｒＰＣＲ產物；６：陰性對照??Ｆｉｇ?６?Ｔｈｅ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｔｉｃ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｒｅｓｕｌｔｓ?ｏｆ?ＨＡｄＶ?ＰＣＲ?ａｍｐｌｉｃｏｎｓ??１：?ＤＮＡ?Ｍａｒｋｅｒ（ＤＬ５０００）

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3122352