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高通量測序技術(shù)在感染病原檢測中的應(yīng)用與展望

發(fā)布時間:2020-12-05 12:36
  近年來,隨著高通量測序技術(shù),也稱新一代(或下一代)測序技術(shù)(NGS)的迅猛發(fā)展,在操作流程不斷簡化、檢測通量不斷增長的同時,檢測成本也大大降低,使其在感染病原檢測中呈現(xiàn)出一定的技術(shù)優(yōu)勢,并得到越來越廣泛的引用。采用NGS技術(shù)對臨床標(biāo)本直接進(jìn)行病原檢測的策略包括目標(biāo)擴(kuò)增子測序和基于宏基因組測序(mNGS),尤以后者應(yīng)用更廣。mNGS通過直接檢測臨床標(biāo)本中病原核酸,幫助明確標(biāo)本中微生物的種類和相對數(shù)量,無需對病原菌進(jìn)行培養(yǎng)即能夠幫助確定引起感染的病原。目前的檢測服務(wù)多由專業(yè)的測序公司提供。對檢測結(jié)果及其應(yīng)用價值的考察和評價應(yīng)從以下幾項技術(shù)指標(biāo)進(jìn)行:測序深度、序列數(shù)量、覆蓋度、置信度、相對豐度。此外,使用NGS數(shù)據(jù)對病原生物學(xué)特性(如藥物敏感性)也可進(jìn)行準(zhǔn)確分析,在結(jié)核桿菌等病原的檢測中已得到良好的應(yīng)用。未來,NGS在檢測技術(shù)、檢測流程、檢測性能、檢測結(jié)果應(yīng)用等方面的快速發(fā)展必將對臨床感染病原檢測帶來巨大的技術(shù)和應(yīng)用革新,同時也必將給相關(guān)從業(yè)者帶來巨大挑戰(zhàn)和發(fā)展機(jī)遇。 

【文章來源】:中華檢驗醫(yī)學(xué)雜志. 2020年05期 第533-539頁 北大核心

【文章頁數(shù)】:7 頁


本文編號:2899463

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