背景:膿毒癥是感染反應(yīng)失調(diào)引起的威脅生命的器官功能障礙,是一種由感染引起的生理、病理和生物化學(xué)異常綜合征,是公共衛(wèi)生領(lǐng)域的一個(gè)主要問題,膿毒癥被稱為隱藏的公共衛(wèi)生災(zāi)難。長鏈非編碼RNA是長度超過200 nt,無蛋白編碼能力的轉(zhuǎn)錄本。環(huán)狀RNA(circRNA)能夠形成共價(jià)閉合環(huán),是非編碼RNA的一種。與lncRNA相似,circRNA可以作為microRNA(miRNA)“海綿”來調(diào)控基因表達(dá)。到目前為止,還沒有對(duì)膿毒血癥中小鼠肝組織中的lncRNA和circRNA豐度和表達(dá)譜進(jìn)行系統(tǒng)的研究。目的:鑒定LPS誘導(dǎo)小鼠膿毒癥不同階段肝臟特異lncRNA,并初步探討其功能。方法:采用百邁客云對(duì)LPS(20mg/kg b.w)誘導(dǎo)小鼠膿毒癥不同時(shí)間點(diǎn)(Oh、2h、8h和24h)的肝臟polyA尾RNA富集轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)進(jìn)行polyA尾lncRNA挖掘分析,挑選在膿毒癥早期特異升高的lncRNA906,構(gòu)建其敲除小鼠,探討lncRNA 906對(duì)LPS致小鼠死亡的影響,并篩選其潛在靶基因。結(jié)果:1對(duì)LPS誘導(dǎo)小鼠膿毒癥不同時(shí)間點(diǎn)的肝臟轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行polyA尾lncRNA挖掘分析。鑒定得到3,056個(gè)lncRNA,其中差異表達(dá)lncRNA共499個(gè)。2 lncRNA906位于小鼠基因組第15號(hào)染色體103095188-103100906,基因組跨度為5719bp,由3個(gè)外顯子組成,轉(zhuǎn)錄本長度為2982 nt,二級(jí)結(jié)構(gòu)都比較復(fù)雜,且沒有編碼潛能。3 LPS刺激2h后,小鼠肝臟中l(wèi)ncRNA 906顯著升高。而在心、腎、大腸中l(wèi)ncRNA 906是下調(diào)的,腦、脾、胃、小腸、闌尾表達(dá)沒顯著變化。lncRNA 906在肺臟中無表達(dá)。4 LPS誘導(dǎo)lncRNA 906表達(dá)依賴于TLR4受體。5 成功構(gòu)建lncRNA906敲除(KO 906)小鼠。并驗(yàn)證lncRNA906敲除小鼠免疫系統(tǒng)發(fā)育正常。6 WT與KO 906小鼠腹腔注射LPS 4h肝臟全轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果:以變化倍數(shù)大于2倍,P小于0.05為標(biāo)準(zhǔn),和WT組對(duì)比,KO 906組差異表達(dá)的lncRNA上調(diào)的有3個(gè),下調(diào)的lncRNA有2個(gè);差異表達(dá)的mRNA上調(diào)有23個(gè),下調(diào)有20個(gè);差異表達(dá)的TUCP上調(diào)有5個(gè),下調(diào)有1個(gè)。差異表達(dá)circRNA上調(diào)28個(gè),下調(diào)16個(gè)。差異表達(dá)miRNA有2個(gè),均是下調(diào)的。7 lncRNA 906缺失可以降低內(nèi)毒素休克小鼠存活時(shí)間。結(jié)論:1 LPS誘導(dǎo)小鼠膿毒癥不同時(shí)間點(diǎn)的肝臟組織通過polyA尾RNA富集的方法也能夠分析得到差異表達(dá)的polyA尾lncRNA,但其差異的數(shù)量與表達(dá)豐度不如差異的mRNA。2鑒定了 LPS誘導(dǎo)小鼠膿毒癥早期特異高表達(dá)的lncRNA 906。在沒有LPS刺激的時(shí)候,lncRNA906幾乎檢測不到,當(dāng)給予LPS刺激后,細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中都有分布。其表達(dá)依賴于TLR4受體。3 lncRNA 906敲除對(duì)小鼠免疫系統(tǒng)發(fā)育沒有影響。4 lncRNA 906敲除對(duì)LPS誘導(dǎo)小鼠膿毒癥4h的肝臟轉(zhuǎn)錄組帶來了一定的影響,其中43個(gè)差異表達(dá)mRNA可能是lncRNA 906的潛在靶基因。5 lncRNA 906敲除減少了 LPS誘導(dǎo)小鼠膿毒癥的存活時(shí)間,提示lncRNA 906在膿毒癥早期的特異升高對(duì)內(nèi)毒素休克小鼠具有一定的保護(hù)效應(yīng)。
【學(xué)位單位】：南方醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位年份】：2018
【中圖分類】：R459.7
【部分圖文】：

ncRNA鑒定Figur

圖１－２各樣品ｍＲＮＡ?ＦＰＫＭ?

圖２－３?ＩｎｃＲＮＡ?９０６二級(jí)結(jié)構(gòu)分析??Ｆｉｇｕｒｅ２－３．?Ｓｅｃｏｎｄａｒｙ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ｌｎｃＲＮＡ９０６??Ａ．使用ＭＦＥ算法分析的ＩｎｃＲＮＡ?９０６二級(jí)結(jié)構(gòu)；Ｂ．使用Ｃｅｎｔｒｏｉｄ算法分析的ＩｎｃＲＮＡ??９０６二級(jí)結(jié)構(gòu)。??３７??
【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 寧永忠;趙敬煥;李祥;傅琪瑤;王俊文;;膿毒癥對(duì)患者生存健康的長期影響[J];中華臨床實(shí)驗(yàn)室管理電子雜志;2018年01期

2 王東東;吳彥青;王曉鵬;劉清泉;郭玉紅;;膿毒癥心肌損傷機(jī)制及中醫(yī)藥診療現(xiàn)狀[J];北京中醫(yī)藥;2018年02期

3 周翔;劉大為;;膿毒癥抗感染治療新5R原則[J];中國醫(yī)刊;2018年06期

4 徐坡;陸士奇;;膿毒癥中醫(yī)辨證及集束化治療的研究進(jìn)展[J];中國中醫(yī)急癥;2018年07期

5 李喜梅;蘇慶豐;;特利加壓素在難治性膿毒癥休克中的應(yīng)用[J];中國藥物與臨床;2018年07期

6 秦延軍;董士民;;膿毒癥的早期識(shí)別和早期干預(yù)[J];臨床薈萃;2018年07期

7 張衛(wèi)國;;本期專題導(dǎo)讀[J];臨床薈萃;2018年07期

8 王艷;盧曉娥;董道然;馬欣;宗媛;;左西孟旦對(duì)膿毒癥休克患者心肌損傷的保護(hù)作用探討[J];現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展;2018年19期

9 艾超;;參附注射液應(yīng)用于膿毒癥休克治療的臨床效果分析[J];現(xiàn)代診斷與治療;2016年20期

10 姜相明;游道峰;趙紅敏;楊芳;苑振云;陸鵬;田惠玉;;早期小劑量糖皮質(zhì)激素對(duì)膿毒癥休克患者血流動(dòng)力學(xué)及預(yù)后的影響[J];重慶醫(yī)學(xué);2017年07期

相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條

1 謝飛;脊髓小膠質(zhì)細(xì)胞TLR4/MyD88/NF-κB信號(hào)通路在膿毒癥致骨骼肌功能障礙和煙堿型乙酰膽堿受體異化重構(gòu)中的作用和機(jī)制[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2018年

2 陳玉紅;硫化氫對(duì)膿毒癥心臟功能障礙的保護(hù)作用及其機(jī)制研究[D];河北醫(yī)科大學(xué);2018年

3 張納婷;抗膿毒癥中藥血必凈注射液苯酞類成分藥代動(dòng)力學(xué)研究[D];中國科學(xué)院大學(xué)(中國科學(xué)院上海藥物研究所);2018年

4 魯俊;犀角地黃湯對(duì)膿毒癥巨噬細(xì)胞糖代謝重編程影響的基礎(chǔ)和臨床研究[D];南京中醫(yī)藥大學(xué);2018年

5 王杰艷;LPS誘導(dǎo)小鼠肝臟特異lncRNA鑒定及其功能研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2018年

6 龔園其;抑制糖酵解途徑同工酶PFKFB3在膿毒癥相關(guān)的急性肺損傷的作用研究[D];南昌大學(xué);2018年

7 李宛霞;谷氨酰胺經(jīng)Hsp90對(duì)膿毒癥大鼠心肌細(xì)胞凋亡的影響[D];南昌大學(xué);2018年

8 呂陽;Yes相關(guān)蛋白（YAP）在膿毒癥發(fā)病中的作用及其機(jī)制研究[D];南京醫(yī)科大學(xué);2018年

9 馮軍;治療嚴(yán)重膿毒癥創(chuàng)新藥物——活化C蛋白樣物質(zhì)的開發(fā)[D];上海醫(yī)藥工業(yè)研究院;2005年

10 單佑安;MD-2基因啟動(dòng)子區(qū)SNP分析及其與LPS反應(yīng)的關(guān)系[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2005年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 田徑;二甲雙胍對(duì)脂多糖誘導(dǎo)的膿毒癥小鼠的腦損傷的保護(hù)作用[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2018年

2 唐甜;線粒體DNA對(duì)膿毒癥急性肺損傷的影響及與TLR9/p38信號(hào)通路的相關(guān)研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2018年

3 林雪;白介素34在膿毒癥中的保護(hù)作用及潛在機(jī)制研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2018年

4 王亞平;鈉鉀鎂鈣葡萄糖注射液對(duì)膿毒癥休克患者液體復(fù)蘇后循環(huán)及預(yù)后的研究[D];青島大學(xué);2018年

5 張雄峰;亞甲藍(lán)對(duì)不同時(shí)期膿毒癥大鼠肝損傷的影響及機(jī)制研究[D];新疆醫(yī)科大學(xué);2018年

6 陳文博;UCP2過表達(dá)對(duì)心肌細(xì)胞線粒體炫的調(diào)控及內(nèi)毒素心肌損傷的保護(hù)研究[D];遵義醫(yī)學(xué)院;2018年

7 楊玉豪;高壓氧對(duì)膿毒癥小鼠腹腔巨噬細(xì)胞炎癥功能影響的研究[D];中國醫(yī)科大學(xué);2018年

8 周聰;烏司他丁治療膿毒癥心肌損傷的臨床療效[D];中國醫(yī)科大學(xué);2018年

9 彭可;心臟型脂肪酸結(jié)合蛋白及糖原磷酸化酶同工酶腦型與膿毒癥心肌損傷的相關(guān)性研究[D];中國醫(yī)科大學(xué);2018年

10 張榮;辛伐他汀對(duì)膿毒癥小鼠腸損傷的保護(hù)作用研究[D];中國醫(yī)科大學(xué);2018年

本文編號(hào)：2868308