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基于改進(jìn)Unet的腦腹部多模態(tài)影像分割

發(fā)布時(shí)間:2020-10-26 22:29
   深度學(xué)習(xí)是人工智能領(lǐng)域的基礎(chǔ),近幾年,在圖像處理中深度學(xué)習(xí)的應(yīng)用廣泛,基于圖像的任務(wù)有很多,比如圖像識(shí)別、目標(biāo)檢測(cè)、目標(biāo)分割等……,本文主要研究醫(yī)學(xué)影像分割。本文中我們的研究對(duì)象為核磁共振醫(yī)學(xué)影像(MRI)和正電子發(fā)射型計(jì)算機(jī)斷層掃描影像(PET),分別為低場(chǎng)強(qiáng)的腹部MRI影像和腦部MRI和PET多模態(tài)醫(yī)學(xué)影像。其中腹部MRI影像中的分割目標(biāo)是胃部區(qū)域,屬于人體自身器官,由于本文中腹部MRI影像主要輔助放療過程中放療儀聚焦,所以采用低場(chǎng)強(qiáng)MRI,使得影像質(zhì)量較差,對(duì)比度低,胃部邊緣模糊,不利于胃部分割,為得到良好的分割結(jié)果,本文提出了基于遷移自編碼網(wǎng)絡(luò)約束的全卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分割方法。腦部影像的分割目標(biāo)是癲癇病灶區(qū)域,屬于腦組織病變區(qū)域。腦部影像主要包含MRI影像和PET影像,針對(duì)腦部MRI/PET多模態(tài)影像,本文提出了多模態(tài)特征融合的全卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(Ynet),該網(wǎng)絡(luò)能夠同時(shí)利用MRI和PET影像對(duì)癲癇病灶進(jìn)行學(xué)習(xí),并結(jié)合了前景背景互補(bǔ)的分割思想。綜上,本文具體研究了以下三方面。(1)提出了一種基于胃部標(biāo)簽的自編碼網(wǎng)絡(luò)約束的全卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)遷移學(xué)習(xí)方法。采用全卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)U-net作為基本網(wǎng)絡(luò),并構(gòu)造一個(gè)自編碼網(wǎng)絡(luò)用于學(xué)習(xí)胃部區(qū)域標(biāo)簽的結(jié)構(gòu)信息,將訓(xùn)練好的自編碼網(wǎng)絡(luò)分別作用于腹部MRI影像的標(biāo)簽圖和U-net網(wǎng)絡(luò)對(duì)腹部MRI影像的分割結(jié)果圖,分別生成兩個(gè)重構(gòu)圖img1、img2,利用img1和img2構(gòu)造一個(gè)Dice損失來(lái)引導(dǎo)U-net基本網(wǎng)絡(luò)的優(yōu)化方向。U-net網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)是完全對(duì)稱的,網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單描述如下:四次下采樣層,下采樣層之間包含卷積核數(shù)目不同的卷積層,四次上采樣層,上采樣層之間同樣包含卷積核數(shù)目不同的卷積層,下采樣結(jié)構(gòu)層又稱作編碼層,上采樣結(jié)構(gòu)層又稱解碼層,在編碼層和解碼層之間有跳躍連接層,跳躍連接層用來(lái)將淺層卷積特征和深層卷積特征融合,聯(lián)合了高層語(yǔ)義和底層的細(xì)粒度表層信息,能夠很好的符合分割對(duì)高層語(yǔ)義信息和底層細(xì)粒度表層信息的依賴。用U-net網(wǎng)絡(luò)首先在高質(zhì)量的腹部MRI影像上學(xué)習(xí)胃部區(qū)域的紋理信息,并且使用低質(zhì)量影像的標(biāo)簽訓(xùn)練自編碼網(wǎng)絡(luò),以學(xué)習(xí)胃部區(qū)域的輪廓、形狀信息,再將學(xué)習(xí)好的網(wǎng)絡(luò)在低質(zhì)量的腹部影像上進(jìn)行fine-tuning。(2)提出了一種基于多模態(tài)特征融合的前背景互補(bǔ)癲癇病灶分割方法。該多模態(tài)網(wǎng)絡(luò)的兩個(gè)支網(wǎng)絡(luò)分別用于學(xué)習(xí)MRI影像特征和PET影像特征,支網(wǎng)絡(luò)的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)采用U-net的編碼解碼結(jié)構(gòu)。多模態(tài)網(wǎng)絡(luò)的深層結(jié)構(gòu)用于將支網(wǎng)絡(luò)提取的MRI影像特征和PET影像特征進(jìn)行特征融合,融合的方法我們采用了特征層疊加、特征層加權(quán)求和,實(shí)驗(yàn)表明特征疊加的方法更適用于癲癇病的多模態(tài)影像特征的融合和分割。另外,我們采用以上模型著重學(xué)習(xí)非癲癇病灶的背景區(qū)域,采用基于背景學(xué)習(xí)的模型和基于癲癇病灶的學(xué)習(xí)模型在決策級(jí)進(jìn)行分割結(jié)果融合,實(shí)驗(yàn)表明結(jié)合基于背景的分割方法能夠?qū)H基于前景分割的方法進(jìn)行一個(gè)補(bǔ)充和改善。(3)對(duì)于醫(yī)學(xué)影像數(shù)量少,不足以使網(wǎng)絡(luò)充分學(xué)習(xí)影像數(shù)據(jù)分布規(guī)律的問題,前兩個(gè)工作中我們采用了簡(jiǎn)單的圖像處理方法進(jìn)行圖像擴(kuò)充,這樣擴(kuò)充的數(shù)據(jù)與原始數(shù)據(jù)相似性較高。為了進(jìn)一步充分利用有限的影像數(shù)據(jù),我們提出了基于CycleGAN進(jìn)行影像模態(tài)轉(zhuǎn)換的癲癇病灶分割方法。首先利用CycleGAN訓(xùn)練學(xué)習(xí)MRI和PET影像之間的映射關(guān)系,從而能夠?qū)崿F(xiàn)兩種模態(tài)之間的相互轉(zhuǎn)換獲取更多的樣本。實(shí)驗(yàn)表明從MRI到PET的轉(zhuǎn)換更具有真實(shí)性,使用生成的PET影像能夠改善分割結(jié)果。
【學(xué)位單位】:西安電子科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:R445.2;TP391.41
【部分圖文】:

曲線圖,導(dǎo)函數(shù),曲線圖,函數(shù)


sigmoid函數(shù)及導(dǎo)函數(shù)曲線圖

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本文編號(hào):2857599

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