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區(qū)分HIV-1近期與長期感染間接ELISA法的建立與評價

發(fā)布時間:2020-07-19 06:44
【摘要】:研究背景人類免疫缺陷病毒(Human immunodeficiency virus,HIV)是引起獲得性免疫缺陷綜合征(Acquired immunodeficiency syndrome,AIDS,又稱為艾滋病)的病原體,HIV感染的潛伏期一般8-10年。傳統(tǒng)免疫學(xué)方法檢測抗HIV抗體,只能判斷是否感染HIV,不能區(qū)分HIV新發(fā)感染,難以準(zhǔn)確監(jiān)測HIV流行趨勢及評價干預(yù)措施的效果。基于橫斷面樣本估算HIV新發(fā)感染率的實驗室檢測方法在近年來有一定的研究進(jìn)展,但尚未有公認(rèn)的金標(biāo)準(zhǔn)。本課題組前期研究發(fā)現(xiàn)HIV-1跨膜糖蛋白gp41中57氨基酸多肽(gp41-p57)能夠區(qū)分HIV-1近期和長期感染,但具體的抗原決定簇氨基酸序列,以及HIV不同基因型氨基酸的差異對檢測結(jié)果的影響,尚需進(jìn)一步研究確定。研究目的研究gp41-p57多肽抗原在區(qū)分HIV-1近期和長期感染中起主要作用的抗原決定簇及其基因型特異性,初步建立基于我國流行的HIV-1基因亞型gp41抗原區(qū)分HIV近期和長期感染實驗室檢測方法,為HIV新發(fā)感染率的監(jiān)測、預(yù)防或治療措施的效果評價提供研究方法和工具。研究方法1.基于HIV gp41-p57序列,通過人工合成10條長短不一的系列短肽為檢測抗原,以間接ELISA法研究其與HIV-1近期和長期感染樣本的免疫反應(yīng)特征,分析gp41多肽的抗原決定簇。2.合成源自我國流行的CRF01_AE、B、CRF07_BC和CRF08_BC四種亞型的gp41-p57多肽,以間接ELISA法研究其與HIV-1不同基因亞型感染樣本的免疫反應(yīng)特征,分析gp41-p57基因型特異性。3.構(gòu)建原核表達(dá)載體,通過免疫印跡實驗和間接ELISA法分析所純化目的蛋白的免疫活性,獲得包含HIV-1 CRF01_AE、B、CRF07_BC和CRF08_BC亞型gp41_p57的融合蛋白MP4。4.以融合蛋白MP4為檢測抗原,建立區(qū)分HIV-1近期和長期感染的間接ELISA法,通過與商品化試劑盒LAg-Avidity EIA檢測結(jié)果比較,評價所建立方法的靈敏度、特異度以及陽性預(yù)測值和陰性預(yù)測值。研究結(jié)果1.確定了HIV gp41-p57多肽中QKFLG和GKIIC序列是區(qū)分HIV-1近期感染和長期感染中起主要作用的抗原決定簇。p57多肽兩端序列EAQQHLLQLT和WNSSWSN可能影響抗原抗體的識別或結(jié)合;趐57多肽建立的方法與商業(yè)化試劑盒檢測結(jié)果的一致率為0.923,約登指數(shù)為0.923,受試者工作曲線下面積為0.987。說明HIV-1 gp41-p57多肽可作為區(qū)分HIV-1近期感染和長期感染方法的檢測抗原。2.HIV不同基因型的gp41_p57多肽序列存在差異,影響檢測結(jié)果的靈敏度。將來自HIV-1優(yōu)勢基因型的gP41-p57多肽混合后作為檢測抗原,可以提高檢測方法靈敏度。3.與商業(yè)化試劑盒比較,基于融合蛋白MP4的檢測方法對37份縱向樣本和159份橫斷面樣本的檢測結(jié)果的一致率分別為0.890和0.730,靈敏度分別為90.91%和96.85%,特異度分別為100.00%和71.88%,近期感染預(yù)測值分別為88.24%和85.19%,長期感染預(yù)測值分別100.00%和85.19%;谌诤系鞍譓P4的檢測方法對159份樣本重復(fù)檢測三次,僅7份樣本(4.40%)結(jié)果不完全一致,檢測方法的可靠性為95.60%。研究結(jié)論本研究確定了區(qū)分HIV-1近期和長期感染的gp41多肽抗原決定簇及其基因型特異性。基于我國HIV主要基因亞型gp41抗原的融合蛋白MP4,初步建立了區(qū)分HIV-1近期感染和長期感染的間接ELISA法。
【學(xué)位授予單位】:南方醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:R512.91;R446.6
【圖文】:

路線圖,路線圖,方案,治療措施


邐第一章前言邐逡逑進(jìn)行干預(yù),有利于改善預(yù)后和減少HIV的傳播,為HIV新發(fā)感染率的監(jiān)測及預(yù)防逡逑或治療措施的效果評價提供方法和工具。逡逑本研究基本技術(shù)路線如下圖:逡逑1+10

曲線,抗原決定簇,反應(yīng)強(qiáng)度,樣本


構(gòu)而影響抗原抗體的結(jié)合,對近期感染階段的影響或更大。逡逑將基于多肽P57和pl-p7間接ELISA法檢測53份HIV-1近期與長期感染樣逡逑本的結(jié)果繪制ROC曲線(圖3-2),各檢測方法的截斷值見表3-2,其曲線下面逡逑積均大于0.8,提示各檢測方法具有較高的診斷價值。逡逑表3-1樣本的基本信息逡逑Table邋3-1邋Characteristics邋of邋individuals邋and邋samples邋used邋in邋the邋study逡逑HIV-1感染分期逡逑組別邐基因分型樣本量近期感染,長期感染,邋p逡逑邐樣本量(%)樣本量(%)邐逡逑縱向樣本邐NT*邐37邐15(40.5)邐22(59.5)邋NT逡逑感染天數(shù)邐40-602邐40-120邐128-602邐NT逡逑平均感染天數(shù)邐241±178邐74±27邐355±141邐<0.05b逡逑橫斷面樣本逡逑門診病人邐NT邐16邐8邋(50.0)邐8邋(50.0)邋NT逡逑MSM邋人群和邋IDU邋人群邋CRF01_AE邐56邐14(25.0)邐42(75.0)邐0.107c逡逑CRF07_BC邐49邐11(22.4)邐38(77.6)逡逑CRF08_BC邐29邐1(3.4)邐28(96.6)逡逑Subtype邋B邐12邐2(16.7)邐10(83.3)逡逑Others邐15邐5(33.3)邐10(66.7)逡逑邐Total邐161邐33(20.5)邐128(79.5)邐逡逑aNT,未檢測或未計算。逡逑bp,Mann-Whitoey檢驗。逡逑CP邋

多肽,樣本,抗原決定簇,反應(yīng)強(qiáng)度


逡逑圖3-1邋HIV-1邋gp41抗原決定簇分析逡逑Figure邋3-1邋Analysis邋of邋the邋immunodominant邋epitopes邋of邋HIV-1邋gp41逡逑(A)各多肽與HIV-l近期感染(R,空心圓形)和長期感染樣本(L,實心方形)反應(yīng)強(qiáng)度的逡逑比較。各組樣本的平均0D值用短橫線表示,各多肽上方數(shù)值為長期感染樣本平均0D值與逡逑近期感染樣本平均0D值的比值。(B)邋30份長期感染樣本對各氨基酸殘基的反應(yīng)性。逡逑30逡逑

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本文編號:2762070

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