【摘要】：目的:初步探究碳青霉烯耐藥腸桿菌科細(xì)菌(Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae,CRE)感染的危險(xiǎn)因素、分子流行病學(xué)及主要耐藥機(jī)制,為臨床制定治療CRE感染的方案提供理論依據(jù)。方法:收集2015年1月至2016年12月重慶市19家區(qū)縣醫(yī)院分離的85株CRE菌株。采用脈沖場(chǎng)凝膠電泳(Pulsed Field Gel Electrophoresis,PFGE)和多位點(diǎn)序列分型(Multiple Locus Sequence Typing,MLST)兩種經(jīng)典的流行病學(xué)研究方法對(duì)實(shí)驗(yàn)菌株進(jìn)行同源性分析;對(duì)碳青霉烯酶相關(guān)耐藥基因、超廣譜β-內(nèi)酰胺酶(Extended spectrum β-lactamases,ESBLs)相關(guān)耐藥基因、喹諾酮類相關(guān)耐藥基因、氨基糖苷類相關(guān)基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并對(duì)陽性產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序檢測(cè)以確定基因型別。此外,回顧性分析39株廣泛耐藥肺炎克雷伯菌(extensively drug-resistant Klebsiella pneumoniae,XDR-KP)感染患者的病例資料以進(jìn)行感染危險(xiǎn)因素研究。結(jié)果:1、體外藥敏結(jié)果顯示:85株CRE菌株對(duì)厄他培南(ETP)的均表現(xiàn)為耐藥;對(duì)亞胺培南(IPM)的總體耐藥率為82.3%;對(duì)美羅培南(MEM)的總體耐藥率為89.4%;對(duì)三、四代頭孢菌素耐藥率分別為95.2%和61.2%;對(duì)喹諾酮類和氨基糖苷類抗生素的總體耐藥率相對(duì)低于β-內(nèi)酰胺類抗生素,分別為58.8%和52.9%。2、對(duì)相關(guān)耐藥基因進(jìn)行檢測(cè)發(fā)現(xiàn):85株CRE菌株中80株(94.1%)菌株攜帶碳青霉烯酶基因,其中32株攜帶blaNDM-1基因、13株攜帶blaNDM-5基因、1株攜帶blaIMP-8基因、5株攜帶blaIMP-4基因、38株攜帶blaKPC-2基因;76株(89.4%)菌株攜帶ESBLs基因,其中42株攜帶blaTEM基因、43株攜帶blaSHV基因、58株攜帶blaCTX-M基因;另外,有73株(85.9%)攜帶QRDs基因;有68株(80.0%)菌株攜帶ARDs基因。3、PFGE結(jié)果顯示:48號(hào)、49號(hào)和50號(hào)菌株為相同克隆型別,且均來源于同一家醫(yī)院,提示可能出現(xiàn)醫(yī)院內(nèi)感染的爆發(fā)流行。MLST結(jié)果顯示:49株肺炎克雷伯菌分屬10個(gè)ST型別,其中以ST11(73.4%)型別為主;16株陰溝腸桿菌分屬8個(gè)ST型別,其中以ST51(37.5%)型別為主;15株大腸埃希菌分屬8個(gè)ST型別,其中以ST167(40%)型別為主,其余ST型別較為分散。4、多因素logistic回歸分析顯示:入住ICU(OR:3.01,95%CI:1.12-8.07,P=0.029)、內(nèi)置引流管(OR:3.24,95%CI:1.11-9.45,P=0.032)和碳青霉烯類抗生素使用(OR:5.08,95%CI:1.42-18.16,P=0.012)是導(dǎo)致XDR-KP感染的獨(dú)立危險(xiǎn)因素。結(jié)論:1、此次收集的重慶市CRE菌株整體呈現(xiàn)高水平耐藥,部分菌株同時(shí)對(duì)多種不同類型的抗生素呈現(xiàn)耐藥;2、此次收集的重慶市CRE菌株中有94.1%的菌株攜帶了具有水解碳青霉烯類抗生素能力的碳青酶烯酶耐藥基因,推測(cè)產(chǎn)碳青酶烯酶可能為重慶市區(qū)縣CRE菌株的主要耐藥機(jī)制。另外,本次研究首次發(fā)現(xiàn)一株同時(shí)攜帶blaNDM-1、blaKPC-2和blaIMP-4三種耐藥基因共表達(dá)的菌株;3、流行病學(xué)分析顯示:重慶市產(chǎn)KPC-2酶的肺炎克雷伯菌主要以ST11型別流行為主;部分醫(yī)院內(nèi)部出現(xiàn)同源菌株克隆傳播的現(xiàn)象,但并未發(fā)現(xiàn)跨區(qū)縣爆發(fā)流行的同源菌株。4、目前XDR-KP感染形勢(shì)嚴(yán)峻,加強(qiáng)ICU病房的監(jiān)管和防控,減少相關(guān)侵入性操作及合理使用抗菌藥物是防止廣泛耐藥菌株的產(chǎn)生與流行的有效措施。
【學(xué)位授予單位】：重慶醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號(hào)】：R446.5
【圖文】：

３．１菌株分布特征逡逑本次收集的重慶市ＣＲＥ菌株有８５株，其中以肺炎克雷伯菌、陰溝腸桿菌和逡逑大腸埃希菌為主。詳見圖１。逡逑匕邋｜邐：逡逑３０邋＾逡逑陰構(gòu)腸桿ａ邐大腸埃希ａ邋Ｉ肺炎克雷伯菌｜弗氏檸檬酸桿菌沃氏檸檬酸桿菌邐產(chǎn)氣腸桿菌逡逑｜邋■菌株數(shù)邐１６邐１５邐Ｉ邐４９邐｜邐３邐１邐１逡逑圖１邋８５株ＣＲＥ菌株種類分布特征逡逑Ｆｉｇ．邋１邋Ｓｐｅｃｉｍｅｎ邋ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ邋ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ邋ｏｆ邋ｔｈｅ邋８５邋ＣＲＥ邋ｓｔｒａｉｎｓ逡逑３．２菌株體外藥物敏感性特點(diǎn)逡逑體外藥敏結(jié)果顯示，８５株ＣＲＥ菌株對(duì)ＥＴＰ均表現(xiàn)為耐藥，耐藥率達(dá)１００％，逡逑對(duì)ＩＰＭ的總體耐藥率為８２．３％，對(duì)ＭＥＭ的總體耐藥率為８９．４％；通過Ｖｉｔｅｋ２逡逑ｃｏｍｐａｃｔ藥敏檢測(cè)系統(tǒng)對(duì)相關(guān)抗菌藥物進(jìn)行檢測(cè)，結(jié)果顯示：８５株ＣＲＥ菌株中共逡逑有８０株（９４．１％）菌株對(duì)三代頭孢菌素（ＣＡＺ和ＣＲＯ）耐藥，耐藥率非常高。同逡逑時(shí)，四代頭孢菌素（ＦＥＰ）的耐藥率為６１．２％。另外，分別有５４株（６３．６％）和４６逡逑株（５４．１％）菌株對(duì)ＣＩＰ、ＬＥＶ耐藥。有５６株（６５．８％）和３４邋（４０％）株菌對(duì)逡逑ＧＭ和ＴＯＢ表現(xiàn)為耐藥，耐藥率相對(duì)較低。另外，７６．５％的菌株表現(xiàn)為多重耐藥逡逑（ＭＤＲ，對(duì)三種及以上不同類型的抗生素耐藥），詳見表１。逡逑１１逡逑

３．３攜帶不同耐藥基因的ＣＲＥ空間分布逡逑攜帶不同耐藥基因的ＣＲＥ菌株的地區(qū)分布有所不同，多種耐藥基因合并表達(dá)逡逑的比例也較高，且地區(qū)分布情況差異較大，詳見圖２。逡逑Ｉ逡逑重慶市ＣＲＥ對(duì)藥基因分布圖逡逑ｉｉ

號(hào)和５０號(hào)菌株為相同克隆型別，菌株均來自相同的醫(yī)院，提示可能出現(xiàn)醫(yī)院內(nèi)感逡逑染的爆發(fā)流行。其余菌株克隆型別較為分散，提示各地區(qū)間未出現(xiàn)感染暴發(fā)現(xiàn)象，逡逑詳見圖３。逡逑■逡逑２７逡逑

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本文編號(hào)：2755027