膝關(guān)節(jié)骨性關(guān)節(jié)炎性別差異的蛋白質(zhì)組學(xué)研究
【學(xué)位授予單位】:廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R684.3;R446.1
【圖文】:
8圖 1 所示 iTRAQ 試劑的結(jié)構(gòu)以及質(zhì)譜鑒定的原理示意圖Figure 1. The structure of the iTRAQ reagent and the principle of mass spectrometryiTRAQ 試劑由三部分組成:報(bào)告基團(tuán)(reporter group),平衡基團(tuán)(balancegroup),以及肽反應(yīng)標(biāo)記試劑基團(tuán)(peptide reactive group)。其中,報(bào)告基團(tuán)在四標(biāo)iTRAQ試劑中的相對(duì)分子量分別為114Da,115Da,116 Da,117 Da,平衡基團(tuán)相對(duì)分子量分別為 31Da,30Da,29Da,28Da,八標(biāo) iTRAQ 試劑中報(bào)告基團(tuán)的相對(duì)分子質(zhì)量分別為 113Da,114Da,115Da,116Da,117Da,118Da,119Da,121 Da,平衡基團(tuán)的相對(duì)分子質(zhì)量分別為 192Da、191Da、190Da、189Da、188Da、187Da、186Da 和 184Da。在四標(biāo) iTRAQ 試劑中,
以上實(shí)驗(yàn)中涉及樣本的抽取均得到了患者或其家屬的知情同意書,血清樣本的使用已獲得廣西醫(yī)科大學(xué)第九附屬醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)同意對(duì)每位參與者抽取空腹外周靜脈血 4mL,室溫靜置 30min,4℃ 2000 g心 15min,吸取上層血清并分裝,凍于-80℃冰箱待用。2.2 實(shí)驗(yàn)技術(shù)路線實(shí)驗(yàn)技術(shù)路線如圖 2,主要包括以下五個(gè)部分:(1)等體積混合 K患者及對(duì)照組各 15 例血清樣本;(2)利用 ProteoMiner Large-Capacity K去除血清中的高豐度蛋白;(3)蛋白酶解及 iTRAQ 標(biāo)記;(4)通Nano-HPLC-MS/MS 鑒定 KOA 血清差異表達(dá)的蛋白,對(duì)差異蛋白進(jìn)行生信息學(xué)分析;(5)部分差異蛋白的表達(dá)驗(yàn)證。
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