天堂国产午夜亚洲专区-少妇人妻综合久久蜜臀-国产成人户外露出视频在线-国产91传媒一区二区三区

基于單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)研究慢性移植物抗宿主病患者的免疫圖譜

發(fā)布時(shí)間:2020-06-16 12:34
【摘要】:研究背景:慢性移植物抗宿主病(chronic graft-versus-host disease,cGVHD)是引起異基因造血干細(xì)胞移植(allogeneic hematopoietic stem cell transplantation,allo-HSCT)患者無(wú)復(fù)發(fā)死亡最常見(jiàn)并發(fā)癥,可累及全身各個(gè)組織和器官,并且嚴(yán)重影響allo-HSCT長(zhǎng)期存活患者的生存質(zhì)量和重返社會(huì)的能力[1,33]。約30%-70%的allo-HSCT患者會(huì)發(fā)生cGVHD[2,15]。目前,由于cGVHD的免疫細(xì)胞和分子機(jī)制尚不明確,因此對(duì)cGVHD的有效預(yù)防與治療進(jìn)展緩慢。既往,對(duì)于參與cGVHD病理過(guò)程的免疫細(xì)胞的研究一般采用流式細(xì)胞技術(shù)。傳統(tǒng)流式細(xì)胞儀,是基于熒光發(fā)射的檢測(cè)系統(tǒng),不同的熒光基團(tuán)發(fā)射光譜存在重疊現(xiàn)象,因此,目前可同時(shí)檢測(cè)的熒光信號(hào)標(biāo)記一般少于15個(gè),同時(shí)信號(hào)標(biāo)記之間容易互相干擾,這在一定程度上影響了實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性。目前新興的質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)(cytometry by time-of-flight,CyTOF)),以在細(xì)胞中含量極低的鑭系金屬代替?zhèn)鹘y(tǒng)的熒光蛋白來(lái)標(biāo)記抗體,由于無(wú)需校正光譜的重疊干擾,可以同時(shí)檢測(cè)單個(gè)細(xì)胞的最多100個(gè)標(biāo)記,因此成為研究復(fù)雜免疫系統(tǒng)的有效手段。通過(guò)質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù),我們能夠從廣度、深度研究參與cGVHD病理生理過(guò)程的免疫細(xì)胞亞群及其相應(yīng)特征,為進(jìn)一步揭示慢性移植物抗宿主病的發(fā)病機(jī)制提供新思路。目的:本研究為明確cGVHD患者的免疫細(xì)胞圖譜,通過(guò)質(zhì)譜流式技術(shù)深入分析免疫細(xì)胞亞群失衡在慢性移植物抗宿主病發(fā)生發(fā)展中的作用,從而進(jìn)一步探索靶向特定免疫機(jī)制的慢性移植物抗宿主病治療新策略。方法:(1)確定單細(xì)胞質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)實(shí)驗(yàn)所需的42種免疫標(biāo)記,初步構(gòu)建上機(jī)方案,前期采集檢測(cè)樣本,單細(xì)胞質(zhì)譜流式細(xì)胞儀進(jìn)行分析,檢測(cè)抗體質(zhì)量,質(zhì)檢通過(guò)后正式構(gòu)建慢性移植物抗宿主病CyTOF檢測(cè)人體免疫試劑盒(包含42種CyTOF抗體,包括T細(xì)胞、B細(xì)胞、NK細(xì)胞、NKT細(xì)胞、DC細(xì)胞、漿細(xì)胞和粒細(xì)胞、髓系細(xì)胞等細(xì)胞亞群標(biāo)記);(2)接受allo-HSCT患者按照NIH診斷及分型標(biāo)準(zhǔn)分為無(wú)cGVHD患者組、中度cGVHD患者組、重度cGVHD患者組,同時(shí)按照病人cGVHD累及器官分為以皮膚cGVHD癥狀為主患者組和以肺部cGVHD癥狀為主患者組;(3)臨床上收集異基因造血干細(xì)胞移植術(shù)后患者外周血標(biāo)本31例,記錄詳細(xì)病程信息,同時(shí)收集健康捐獻(xiàn)者外周血標(biāo)本5例,所有參與研究者均需排除感染情況和自身免疫性疾病,空腹抽取靜脈血10ml,EDTA抗凝,24小時(shí)內(nèi)密度梯度離心法分離外周血單個(gè)核細(xì)胞,每個(gè)待檢測(cè)樣本選取3×106個(gè)外周血單個(gè)核細(xì)胞染色質(zhì)譜流式上機(jī)檢測(cè),剩余細(xì)胞-80攝氏度冰箱冷凍24小時(shí)后轉(zhuǎn)入液氮中保存;(4)上機(jī)檢測(cè)所得數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析,進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。生物信息學(xué)方法:(1)原始數(shù)據(jù)預(yù)處理及質(zhì)量控制:對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化預(yù)處理,并去除批次等噪音影響,得到單個(gè)、活的、免疫細(xì)胞的有效數(shù)據(jù)進(jìn)行下一步分析;(2)聚類(lèi)分析:選擇上機(jī)方案中指定的信號(hào)標(biāo)記,采用xshift聚類(lèi)算法進(jìn)行分析;當(dāng)單個(gè)文件細(xì)胞數(shù)量過(guò)大時(shí),對(duì)數(shù)據(jù)采用隨機(jī)降采樣的方法以減少細(xì)胞數(shù)并同時(shí)不加入人為操作偏差。通過(guò)高性能的聚類(lèi)算法獲得對(duì)樣本的免疫細(xì)胞亞群的分類(lèi)(cluster);(3)聚類(lèi)結(jié)果統(tǒng)計(jì)學(xué)分析及可視化展示:采用基于t分布隨機(jī)領(lǐng)域嵌入(t-distributed stochastic neighbor embedding,t-SNE)的降維可視化方法對(duì)所獲得的聚類(lèi)結(jié)果進(jìn)行可視化,并獲得可視化隨機(jī)網(wǎng)絡(luò)嵌入(visual stochastic network embedding,viSNE)、熱圖(heatmap)等可視化展示;同時(shí),對(duì)各樣本中每個(gè)亞群的百分比(Frequency)進(jìn)行差異性分析,根據(jù)病人臨床信息,對(duì)樣本進(jìn)行分組,采用雙邊t檢驗(yàn)的方法確認(rèn)不同組別之差異性表達(dá)的特征免疫亞群。結(jié)果:(1)自2017年11月-2018年12月共收集31例異基因造血干細(xì)胞移植后患者外周血樣,其中12例患者未發(fā)生cGVHD,7例患者發(fā)生中度cGVHD,12例患者發(fā)生重度cGVHD。在19例發(fā)生中度-重度cGVHD患者中,10例患者以皮膚cGVHD癥狀為主要臨床表現(xiàn),6例患者主要表現(xiàn)為肺部cGVHD癥狀,3例患者同時(shí)出現(xiàn)皮膚與肺部cGVHD癥狀;(2)通過(guò)質(zhì)譜流式檢測(cè)各分組患者外周血單個(gè)核細(xì)胞的細(xì)胞亞群組成和免疫表型,我們發(fā)現(xiàn),中-重度cGVHD患者組與無(wú)cGVHD患者組相比,具有不同的細(xì)胞亞群分布圖譜;(3)以肺部癥狀為主cGVHD患者組與無(wú)cGVHD患者組相比,具有不同的細(xì)胞亞群分布圖譜;(4)以皮膚癥狀為主cGVHD患者組與無(wú)cGVHD患者組相比,具有不同的細(xì)胞亞群分布圖譜;(5)中度cGVHD患者的外周血中骨髓來(lái)源抑制細(xì)胞的比例高于無(wú)cGVHD患者組,重度cGVHD患者的外周血中單核吞噬細(xì)胞的比例高于無(wú)cGVHD患者組;(6)以肺部癥狀為主cGVHD患者的外周血中兩群特異的T細(xì)胞亞群(C5,C21)的比例高于無(wú)cGVHD患者組和以皮膚癥狀為主cGVHD患者組;(7)小鼠異基因骨髓移植模型構(gòu)建后流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)移植嵌合度,得到H2-Kb陽(yáng)性細(xì)胞所占百分比超過(guò)90%,檢測(cè)結(jié)果為完全嵌合,小鼠異基因骨髓移植模型建立成功;(8)小鼠cGVHD模型流式檢測(cè)發(fā)現(xiàn)cGVHD嚴(yán)重程度與外周血CD11b+髓系細(xì)胞群的比例成正相關(guān)關(guān)系。結(jié)論:(1)骨髓來(lái)源抑制細(xì)胞與單核吞噬細(xì)胞可能與cGVHD的病理機(jī)制有關(guān);(2)兩群T細(xì)胞亞群可能參與肺部cGVHD的病理過(guò)程;(3)小鼠cGVHD模型證實(shí)CD11b+髓系細(xì)胞群可能與cGVHD的病理機(jī)制有關(guān)。
【學(xué)位授予單位】:南方醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類(lèi)號(hào)】:R457.7
【圖文】:

患者,肺部,癥狀,聚類(lèi)分析


cGVHD患者組相比具有不同的細(xì)胞亞群分布圖譜逡逑通過(guò)CyTOF檢測(cè)發(fā)現(xiàn)6例以肺部癥狀為主cGVHD患者與12例無(wú)cGVHD逡逑患者相比,外周血單個(gè)核細(xì)胞具有不同的細(xì)胞亞群分布圖譜(圖2)。逡逑ABC逡逑圖2,無(wú)cGVHD患者組與以肺部癥狀為主cGVHD患者組聚類(lèi)分析后viSNE對(duì)比。圖A為逡逑無(wú)cGVHD患者組聚類(lèi)分析后viSNE圖,圖B為以肺部癥狀為主cGVHD患者組聚類(lèi)分析逡逑后viSNE圖,圖C為無(wú)cGVHD患者組與以肺部癥狀為主cGVHD患者組聚類(lèi)分析后viSNE逡逑對(duì)比圖?赏ㄟ^(guò)對(duì)比發(fā)現(xiàn)部分差異細(xì)胞亞群。逡逑Figure2

患者,聚類(lèi)分析


逡逑cGVHD患者相比,外周血單個(gè)核細(xì)胞具有不同的細(xì)胞亞群分布圖譜(圖3)。逡逑ABC逡逑圖3,無(wú)cGVHD患者組與以皮膚癥狀為主cGVHD患者組聚類(lèi)分析后viSNE對(duì)比。圖A為逡逑無(wú)cGVHD患者組聚類(lèi)分析后viSNE圖,圖B為以皮膚癥狀為主cGVHD患者組聚類(lèi)分析逡逑后viSNE圖,圖C為無(wú)cGVHD患者組與以皮膚癥狀為主cGVHD患者組聚類(lèi)分析后viSNE逡逑對(duì)比圖?赏ㄟ^(guò)對(duì)比發(fā)現(xiàn)部分差異細(xì)胞亞群。逡逑Figure3

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 濮全龍;何錫堯;;質(zhì)譜應(yīng)用于天然藥物研究的國(guó)內(nèi)外概況(續(xù))[J];中草藥;1981年07期

2 琦;;用氦氣的等離子炬[J];化學(xué)通報(bào);1987年11期

3 趙善楷;;在第39屆匹茲堡會(huì)議上有關(guān)質(zhì)譜儀和質(zhì)譜技術(shù)方面的見(jiàn)聞[J];國(guó)外科學(xué)儀器;1988年02期

4 林壬子;;質(zhì)譜/質(zhì)譜技術(shù)[J];國(guó)外油氣勘探;1988年06期

5 王忠寧,陶良;一種質(zhì)譜數(shù)據(jù)處理方法的擴(kuò)充及程序化[J];核技術(shù);1988年07期

6 梁曉天;質(zhì)譜在天然產(chǎn)物研究中的應(yīng)用舉例[J];分析測(cè)試通報(bào);1988年06期

7 顏家駿;加速器質(zhì)譜技術(shù)的崛起[J];核物理動(dòng)態(tài);1988年02期

8 李銘岫;陳佐勤;;快速原子轟擊質(zhì)譜技術(shù)[J];分析儀器;1989年02期

9 杜愛(ài)書(shū);;質(zhì)譜技術(shù)及其在臨床檢驗(yàn)中的應(yīng)用初探[J];大家健康(學(xué)術(shù)版);2015年19期

10 萬(wàn)茜淋;劉淑瑩;;質(zhì)譜技術(shù)在類(lèi)風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎診斷中的應(yīng)用進(jìn)展[J];健康之路;2015年10期

相關(guān)會(huì)議論文 前10條

1 劉志強(qiáng);;質(zhì)譜技術(shù)在中藥創(chuàng)新研究中的應(yīng)用[A];中國(guó)化學(xué)會(huì)首屆全國(guó)質(zhì)譜分析學(xué)術(shù)研討會(huì)會(huì)議論文集[C];2014年

2 張欣怡;;全方位探索嶄新領(lǐng)域——MALDI TOF質(zhì)譜技術(shù)高端應(yīng)用簡(jiǎn)介[A];BCEIA2007分析儀器應(yīng)用技術(shù)報(bào)告會(huì)論文集[C];2007年

3 劉淑瑩;劉寧;白玉;黎根;劉志強(qiáng);Przybylski;;質(zhì)譜技術(shù)在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析中的應(yīng)用[A];中國(guó)蛋白質(zhì)組學(xué)第三屆學(xué)術(shù)大會(huì)論文摘要[C];2005年

4 梁峰;;液相色譜/質(zhì)譜技術(shù)在農(nóng)藥及獸藥檢測(cè)中的應(yīng)用獸藥檢測(cè)中的應(yīng)用[A];BCEIA2005分析儀器應(yīng)用技術(shù)報(bào)告會(huì)論文集[C];2005年

5 楊們?cè)?;中高端質(zhì)譜的關(guān)鍵技術(shù)和儀器國(guó)產(chǎn)化[A];第三屆全國(guó)質(zhì)譜分析學(xué)術(shù)報(bào)告會(huì)摘要集[C];2017年

6 石世學(xué);潘勤;劉志青;;現(xiàn)代質(zhì)譜技術(shù)在天然藥物結(jié)構(gòu)和藥物代謝物研究中的應(yīng)用概述[A];2004年全國(guó)有機(jī)質(zhì)譜學(xué)術(shù)交流會(huì)論文集[C];2004年

7 殷志斌;程肖玲;劉蓉;李曉萍;杭緯;;近場(chǎng)激光電離質(zhì)譜儀研制及形貌-質(zhì)譜共成像應(yīng)用[A];第三屆全國(guó)質(zhì)譜分析學(xué)術(shù)報(bào)告會(huì)摘要集[C];2017年

8 任一平;;質(zhì)譜技術(shù)在定性和定量食品中微量蛋白質(zhì)的應(yīng)用[A];第二十屆全國(guó)色譜學(xué)術(shù)報(bào)告會(huì)及儀器展覽會(huì)論文集(第一分冊(cè))[C];2015年

9 姜山;;加速器質(zhì)譜技術(shù)新進(jìn)展[A];中國(guó)化學(xué)會(huì)第二屆全國(guó)質(zhì)譜分析學(xué)術(shù)報(bào)告會(huì)會(huì)議摘要集[C];2015年

10 聶洪港;白燕平;花鎮(zhèn)東;白玉;劉虎威;;基于色譜和質(zhì)譜技術(shù)的新精神活性物質(zhì)檢測(cè)方法研究[A];第二十屆全國(guó)色譜學(xué)術(shù)報(bào)告會(huì)及儀器展覽會(huì)論文集(第二分冊(cè))[C];2015年

相關(guān)重要報(bào)紙文章 前6條

1 陳捷 本報(bào)記者 操秀英;專(zhuān)注應(yīng)用 走向國(guó)際[N];科技日?qǐng)?bào);2017年

2 記者 朱文彬;禾信儀器:懷揣質(zhì)樸心 打造“質(zhì)譜芯”[N];上海證券報(bào);2019年

3 傅利 楊琪;政策支持下的臨床質(zhì)譜技術(shù)創(chuàng)新之路[N];科技日?qǐng)?bào);2016年

4 實(shí)習(xí)生相海珠;質(zhì)譜技術(shù),開(kāi)啟生命科學(xué)嶄新時(shí)代[N];浙江日?qǐng)?bào);2002年

5 源坤鑒酒技術(shù)團(tuán)隊(duì)(四川省食品藥品檢驗(yàn)檢測(cè)院);穩(wěn)定同位素比質(zhì)譜技術(shù)在酒行業(yè)的應(yīng)用(下)[N];華夏酒報(bào);2015年

6 源坤鑒酒技術(shù)團(tuán)隊(duì)(四川省食品藥品檢驗(yàn)檢測(cè)院);穩(wěn)定同位素比質(zhì)譜技術(shù)在酒行業(yè)的應(yīng)用(上)[N];華夏酒報(bào);2015年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前5條

1 翁國(guó)鋒;基于質(zhì)譜技術(shù)的寡核苷酸分離分析方法研究[D];浙江大學(xué);2019年

2 金米聰;若干天然產(chǎn)物和痕量環(huán)境有機(jī)污染物的液/質(zhì)聯(lián)用法檢測(cè)研究[D];浙江大學(xué);2007年

3 李明;串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)的應(yīng)用研究[D];吉林大學(xué);2007年

4 劉輝;一串紅耐熱性與外源基因轉(zhuǎn)化體系構(gòu)建研究[D];浙江大學(xué);2012年

5 趙遠(yuǎn);家蠶抗核型多角體病毒病的微衛(wèi)星分子標(biāo)記篩選、定位及其病毒侵染家蠶中腸組織的差異蛋白質(zhì)表達(dá)圖譜研究[D];江蘇大學(xué);2007年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 高陽(yáng);基于單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)研究慢性移植物抗宿主病患者的免疫圖譜[D];南方醫(yī)科大學(xué);2019年

2 宋雯雯;液質(zhì)及紙噴霧質(zhì)譜快速檢測(cè)藥物雜質(zhì)及化妝品中的甲醛[D];浙江大學(xué);2019年

3 高幫鵬;串聯(lián)質(zhì)譜中肽碎片離子強(qiáng)度建模[D];山東理工大學(xué);2018年

4 王震;基于質(zhì)譜DIA數(shù)據(jù)處理算法軟件評(píng)估與肽段定量信號(hào)提取算法研究[D];國(guó)防科學(xué)技術(shù)大學(xué);2016年

5 趙盼盼;有效提高鑒定可信度和序列覆蓋度的新策略[D];暨南大學(xué);2018年

6 劉學(xué);基于深度信念網(wǎng)絡(luò)的理論質(zhì)譜預(yù)測(cè)[D];山東理工大學(xué);2017年

7 魏來(lái);肽段質(zhì)譜響應(yīng)曲線(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)的建立和應(yīng)用[D];中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2017年

8 周丹;高覆蓋的脂類(lèi)分子質(zhì)譜成像研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2017年

9 周亞飛;幾種常壓快速質(zhì)譜技術(shù)及其應(yīng)用研究[D];東華理工大學(xué);2014年

10 鄢飛燕;新型常壓質(zhì)譜技術(shù)及其在生物樣品分析中的應(yīng)用[D];東華理工大學(xué);2012年



本文編號(hào):2716049

資料下載
論文發(fā)表

本文鏈接:http://sikaile.net/linchuangyixuelunwen/2716049.html


Copyright(c)文論論文網(wǎng)All Rights Reserved | 網(wǎng)站地圖 |

版權(quán)申明:資料由用戶(hù)b0259***提供,本站僅收錄摘要或目錄,作者需要?jiǎng)h除請(qǐng)E-mail郵箱bigeng88@qq.com