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CRKP的碳青霉烯酶基因檢測和同源性分析

發(fā)布時間:2020-05-20 13:10
【摘要】:目的:了解某三甲醫(yī)院耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)的臨床分布特點,檢測該醫(yī)院CRKP菌株攜帶的碳青霉烯酶基因類型,并對其進行同源性分析,判斷該醫(yī)院流行的優(yōu)勢克隆株,為預(yù)防和控制CRKP的院內(nèi)傳播提供實驗室依據(jù)。方法:(1)收集2017年01月至2017年12月間某大型三甲醫(yī)院分離自臨床各科室的22株CRKP,針對同一病患住院期間數(shù)次培養(yǎng)所得的相同菌株,僅納入第一次培養(yǎng)陽性的CRKP菌株,并收集相應(yīng)患者的診療資料,包括:實驗室編號,性別,年齡,住院史,CRKP前住院時間,基礎(chǔ)疾病,侵入性操作或治療,使用的抗菌藥物,是否使用激素,預(yù)后及分離科室,標本來源和對臨床常見抗菌藥耐藥情況。(2)通過VITEK 2 Compact分析系統(tǒng)鑒定菌株和藥物敏感性,其中革蘭氏陰性細菌鑒定卡即GN鑒定卡用于菌株生化鑒定,革蘭氏陰性細菌藥敏卡即AST-GN13藥敏卡用于細菌藥敏鑒定,分別用藥敏紙片擴散法和微量肉湯稀釋法對上述藥敏結(jié)果進行復(fù)核后采用改良Hodge試驗(Modified Hodge Testing,MHT)及Carba NP試驗兩種試驗方法檢測菌株是否產(chǎn)碳青霉烯酶,使用PCR技術(shù)擴增產(chǎn)酶菌株的常見碳青霉烯酶基因(包括:blaKPC、blaSME、blaIMI、blaNDM-1、blaIMP、blaSIM、blaVIM、blaOXA-48)并對PCR擴增陽性的產(chǎn)物進行雙向測定序列。(3)分別運用多位點序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)及腸桿菌科基因間一致重復(fù)序列聚合酶鏈反應(yīng)(Enterobacterial repetitive intergenic consensusPolymerase chain reaction,ERIC-PCR)這兩種方法分析22株CRKP間的親緣性關(guān)系,即同源性分析。結(jié)果:(1)22株CRKP中有7株分離自該院新生兒科,6株分離自該院重癥監(jiān)護病房(Intensive Care Unit,ICU),4株分離自該醫(yī)院腦血管外科,其余的5株CRKP菌株分別分離自該院呼吸內(nèi)科、胸外科、全科及血液內(nèi)科、腎內(nèi)科;在22株CRKP中,從痰標本中分離出13株,血樣中有5株,尿中有4株;對于以下兩種抗菌藥,22株CRKP保持60%的敏感率:阿米卡星及多粘菌素B,22株CRKP高度耐藥于臨床其他較常見的抗菌藥物。(2)22株CRKP對厄他培南(Ertapenem,ETP)、亞胺培南(Imipenem,IPM)及美羅培南(Meropenem,MEM)的耐藥率均為100%,22株CRKP中13株MHT陽性,14株Carba NP測試結(jié)果為陽性,PCR擴增后顯示14株產(chǎn)酶菌株KPC基因陽性,測序后證實均為KPC-2基因,其中K12菌株同時攜帶NDM-1基因。(3)22株CRKP同源性分析結(jié)果顯示:按MLST法分為四種序列型(Sequence type,ST),分別為ST11(14/22)、ST875(6/22)、ST1964(1/22)、ST571(1/22);按ERIC-PCR法分為三種型別,分別為A型(15/22)、B型(6/22)及C型(1/22)。結(jié)論:(1)CRKP主要分布于患者病情較重、免疫力低下及住院時間較長的新生兒科和ICU病房,其主要侵犯患者的呼吸系統(tǒng)且對臨床大多數(shù)抗菌藥物保持較高的耐藥性。(2)產(chǎn)碳青霉烯酶是CRKP最主要的耐藥機制,KPC-2基因是該院CRKP攜帶的最主要的耐藥基因,其次還有NDM-1基因。(3)該院2017年存在ST11型和ST875型CRKP的克隆流行,需加強醫(yī)院感染(Nosocomial infection,NI)的預(yù)防控制措施。
【圖文】:

陽性對照,圖表,試驗結(jié)果


C25922:陰性對照;160109043:陽性對照;171205332:圖 1 部分改良 Hodge 試驗陽性結(jié)果圖表 12 22 株 CRKP 改良 Hodge 試驗結(jié)果表驗號MHT陽性 陰K1 √K2 √K3 √K4 √K5 √K6 √K7 √K8 √K9 √10 √11 √12 √

碳青霉烯,深黃色,株產(chǎn),橘紅色


結(jié)果判斷標準參照2018版CLSI推薦的Carba NP 13 2018 版 CLSI 推薦 Carba NP 試驗結(jié)果判斷標準表b 管 色 橘紅色、紅色 色 黃色、深黃色、淺橘色 色 橘色 色、淺橘色、橘色 其他色 CRKP 中有 14 株細菌 Carba NP 試驗結(jié)果陽性,8 14 株產(chǎn)生碳青霉烯酶,,Carba NP 試驗的陽性結(jié)果ba NP 試驗的結(jié)果如表 14 所示。
【學(xué)位授予單位】:遵義醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:R446.5

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本文編號:2672669

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