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江西省新型隱球菌遺傳型、居群遺傳變異和藥物敏感性的研究

發(fā)布時(shí)間:2020-05-19 15:47
【摘要】:目的:1.探討江西省新型隱球菌的基因型組成、分子流行病學(xué)特征和體外藥物敏感性,豐富我國(guó)隱球菌的流行病學(xué)數(shù)據(jù);2.了解本地區(qū)分離的新型隱球菌基因型在全球的分布情況,同時(shí)分析我國(guó)不同地區(qū)間新型隱球菌遺傳變異關(guān)系,追溯可能的傳播/突變起源。方法:收集2016年1月-2017年11月江西省多家醫(yī)院住院患者首次分離的新型隱球菌86株;采用基質(zhì)輔助激光解吸/電離飛行時(shí)間質(zhì)譜技術(shù)(MALDI-TOF MS)、特異性引物SOD1和刀豆氨酸-甘氨酸-溴麝香草酚藍(lán)(CGB)培養(yǎng)基對(duì)所有菌株進(jìn)行菌種鑒定;ATB~(TM)Fungus3試劑盒測(cè)定86株隱球菌對(duì)5種常用抗真菌藥物氟康唑(FCA)、5-氟胞嘧啶(5FC)、伊曲康唑(ITR)、伏立康唑(VRC)和兩性霉素B(AMB)的體外敏感性;聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴(kuò)增特異產(chǎn)物SOD1和STE20(STE20Aa、STE20Aα、STE20Da和STE20Dα)確定86株菌的基因型、血清型和交配型;多位點(diǎn)序列分型(MLST)對(duì)所有菌株進(jìn)行同源性分析,同時(shí)應(yīng)用eBURST軟件對(duì)分型結(jié)果進(jìn)行親緣關(guān)系分析;利用MEGA 7.0軟件對(duì)7個(gè)管家基因(CAP59、GPD1、IGS1、LAC1、PLB1、SOD1和URA5)的串聯(lián)序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析;GenAlEx 6.5軟件統(tǒng)計(jì)全國(guó)數(shù)據(jù),分析不同地區(qū)間新型隱球菌的遺傳變異關(guān)系。結(jié)果:共收集來自江西省14個(gè)地區(qū)的新型隱球菌86株,絕大多數(shù)(76.7%;66/86)來自免疫抑制/缺陷的患者,其中有35株(40.7%)來自HIV患者;所有菌株對(duì)5種抗真菌藥物均敏感,但在不同ST型菌株間,甚至在相同ST型菌株間,其最小抑菌濃度(MIC)值仍存在明顯差異;86株隱球菌均為血清型A,交配型α(MATα),基因型VNⅠ;MLST分型共檢出8種ST型,包括2個(gè)新的ST型(ST226和ST319),6個(gè)在我國(guó)其他地區(qū)/國(guó)外均有報(bào)道的ST型(ST5、ST31、ST32、ST139、ST186和ST359);種群結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn)這8種ST型屬于同一克隆群,其中ST5型是江西省主要的遺傳型(84.9%;73/86);MLST揭示的18個(gè)等位基因在江西省以外地區(qū)都有發(fā)現(xiàn),無(wú)特異性;系統(tǒng)發(fā)育分析顯示ST5、ST186、ST359、ST31和ST32在遺傳學(xué)上相似;居群遺傳關(guān)系分析猜測(cè)江西省發(fā)現(xiàn)的ST型可能是由中國(guó)內(nèi)外其他地區(qū)傳播而來或者由江西省其他ST型突變而來。結(jié)論:江西省大多數(shù)隱球菌病患者潛在的危險(xiǎn)因素與免疫力低下有關(guān);ST5是江西省和我國(guó)其他地區(qū)主要的遺傳型;在中國(guó)大多數(shù)地區(qū),可通過地理長(zhǎng)距離傳播的方式來形成獨(dú)特的ST型;持續(xù)的隱球菌監(jiān)測(cè)對(duì)了解隱球菌動(dòng)態(tài)變化很有必要。
【圖文】:

新型隱球菌,臨床資料,江西省


江西省86株新型隱球菌臨床資料

分布比


種ST型分布比例
【學(xué)位授予單位】:南昌大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R446.5

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本文編號(hào):2671116

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