乳腺組織動態(tài)增強影像分解分析及其在分子亞型預(yù)測中的應(yīng)用
發(fā)布時間:2020-05-15 21:32
【摘要】:近年來乳腺癌的發(fā)病率逐年增長,影響患者健康乃至危害患者生命。臨床中經(jīng)活檢穿刺,用免疫組織化學(xué)法將乳腺癌鑒定為4種分子亞型,以指導(dǎo)個體化治療及預(yù)后分析。在探索無創(chuàng)傷、高效率的新型鑒定方法過程中,有研究表明影像特征是潛存的分子亞型標(biāo)記物。然而惡性腫瘤具有高度的異質(zhì)性,異質(zhì)性不僅僅體現(xiàn)于不同腫瘤之間,更多地隱含于同一腫瘤內(nèi)部,并且隨時間演化,它可能阻礙乳腺癌分子亞型的準(zhǔn)確鑒定。為解析瘤內(nèi)血流異質(zhì)性與分子亞型的關(guān)聯(lián)關(guān)系,本研究基于動力學(xué)房室模型對乳腺動態(tài)增強磁共振影像(dynamic contrast-enhanced magnetic resonance imaging,DCE-MRI)進行分解分析。動力學(xué)房室模型中有多種組織類型,各組織的血流活動混合構(gòu)成DCE-MRI信號。由于組織異質(zhì)性的影響和圖像分辨率的限制,在DCE-MRI中呈現(xiàn)的血流活動區(qū)既包含各組織獨立區(qū)域,也包含組織間共享區(qū)域,每一組織的獨立區(qū)與共享區(qū)共同構(gòu)成該組織血流活動完整區(qū)域。本研究將乳腺組織DCE-MRI混合信號分解為3個組織的血流活動子分量,各組織血流活動完整區(qū)域稱之為子分量主區(qū),獨立區(qū)域稱為子分量純凈區(qū),共享區(qū)域稱為子分量混疊區(qū)。與其它乳腺DCE-MRI聚類分區(qū)法對比,結(jié)果表明從子分量主區(qū)DCE-MRI序列中提取的影像特征與分子亞型關(guān)聯(lián)性最強,以其為屬性構(gòu)建的隨機森林預(yù)測模型效果最佳。本論文的具體研究內(nèi)容包括:(1)乳腺癌患者臨床信息與分子亞型的關(guān)聯(lián)性分析統(tǒng)計患者的臨床信息,包括患者年齡、癌癥種類、腫瘤最大徑及經(jīng)期狀態(tài)。根據(jù)分子亞型的不同將病例分成4組,利用χ2、Fisher、ANOVA等檢驗方法分析臨床信息的組間差異。該分析并未發(fā)現(xiàn)與分子亞型顯著相關(guān)的臨床先驗信息。(2)乳腺感興趣區(qū)DCE-MRI凸分析方法分解及其它方法聚類分區(qū)根據(jù)DCE-MRI成像特點,結(jié)合乳房斷層解剖結(jié)構(gòu),通過人-機結(jié)合的方式精細(xì)分割腫瘤及基質(zhì)區(qū)域后,用兩種方式對其進行分區(qū):1)依據(jù)動力學(xué)房室模型用凸分析方法對感興趣區(qū)域DCE-MRI進行分解,確定各組織DCE-MRI的子分量主區(qū)、純凈區(qū)及混疊區(qū)。2)依據(jù)時間-強度曲線(time-intensity curve,TIC)用其它方法對感興趣區(qū)域DCE-MRI進行聚類分區(qū),確定其子區(qū)域以供對比分析。(3)乳腺組織子分量區(qū)域影像特征與分子亞型的關(guān)聯(lián)性分析提取腫瘤及基質(zhì)子分量區(qū)域影像特征,包括DCE-MRI序列的統(tǒng)計特征及紋理特征。利用Logistic回歸分析單個影像特征與分子亞型的關(guān)聯(lián)性;根據(jù)子分量區(qū)域的高關(guān)聯(lián)影像特征數(shù),定量評價該區(qū)與分子亞型的關(guān)聯(lián)度,并與其它聚類分區(qū)進行對比。該分析結(jié)果表明乳腺腫瘤子分量主區(qū)與分子亞型的關(guān)聯(lián)性最強。(4)乳腺組織DCE-MRI子分量區(qū)域影像特征預(yù)測分子亞型基于隨機森林算法以乳腺組織不同子分量區(qū)的影像特征為屬性,構(gòu)建多種分子亞型預(yù)測模型,對模型預(yù)測效果進行評價與對比。結(jié)果表明腫瘤子分量主區(qū)對分子亞型預(yù)測效果最好,顯著高于未分解腫瘤整體區(qū)域及其它聚類分區(qū)法確定的子區(qū)域;腫瘤與基質(zhì)子分量主區(qū)的預(yù)測模型相融合,對分子亞型的預(yù)測性能顯著提高。通過對比實驗證明,異質(zhì)性乳腺組織DCE-MRI子分量主區(qū)影像特征與分子亞型的關(guān)聯(lián)性最強,以其為屬性構(gòu)建的隨機森林預(yù)測模型效果最佳。乳腺組織DCE-MRI分解分析方法能為臨床中鑒定分子亞型提供更有效的影像信息,是潛在的分子亞型影像標(biāo)記。
【圖文】:
探索新型分子亞型標(biāo)記物成為國內(nèi)外研究熱點。隨著醫(yī)學(xué)成像技術(shù)的不斷革新和影逡逑像分析方法的相繼進步,影像特征與分子亞型的關(guān)聯(lián)性研究受到國內(nèi)外學(xué)者的關(guān)注[31_37]。逡逑Maciej等[36]基于DCE-MRI研究了腫瘤及背景實質(zhì)組織的增強特征,揭示出DCE-MRI影像逡逑特征與Luminal邋B型乳腺癌存在關(guān)聯(lián)性。Shannon等[35]利用DCE-MRI影像特征設(shè)計/邋Basal-逡逑like乳腺癌識別模型,其方法對良性病變和Basal-like的識別能力最強,但從多種亞型乳腺癌逡逑中識別Basal-like的能力較低。MingFan等[32]提取了乳腺腫瘤DCE-MRI的紋理特征,研究了逡逑影像紋理特征與分子亞型標(biāo)記物Ki-67的關(guān)聯(lián)性,指出腫瘤內(nèi)異質(zhì)性紋理分析是潛在的乳腺逡逑癌臨床標(biāo)記物。逡逑乳腺影像特征與分子亞型的關(guān)聯(lián)性研究雖已有一定進展,但由于乳腺癌的異質(zhì)性和復(fù)雜逡逑性,目前研究設(shè)計的乳腺癌分子亞型預(yù)測模型仍不能達(dá)到實際臨床要求。逡逑1.4主要內(nèi)容及創(chuàng)新點逡逑為提高用影像特征分析方法預(yù)測乳腺癌分子亞型的能力,給乳腺癌的個體化診治提供科逡逑學(xué)依據(jù),本研究對乳腺組織動態(tài)增強影像進行分解及分析,并將其應(yīng)用于乳腺癌分子亞型的逡逑預(yù)測。課題獲得了國家自然基金重點項目及國家自然基金面上項目的經(jīng)費資助。逡逑邐
興趣區(qū)域包含的體素數(shù)量,,S等增強序列數(shù)(本數(shù)據(jù)中S=5)。依據(jù)式(2.1)算出感興趣區(qū)域DCE-逡逑MRI每一體素的TIC(i),感興趣區(qū)域中每個TIC(i)求和取平均即可得到感興趣區(qū)域的TIC。逡逑臨床診斷中常見的TIC模式有三種類型[28],見圖2.1(b)。I型:在整個造影動態(tài)檢測過程逡逑中磁共振信號緩慢持續(xù)增強;II型:造影早期磁共振信號明顯增強,達(dá)到峰值后信號強度在逡逑一段時間內(nèi)保持不變,動態(tài)檢測過程中呈現(xiàn)平臺曲線趨勢;III:造影早期磁共振信號快速增逡逑強,而達(dá)到峰值后信號強度相對降低,在動態(tài)檢測過程中呈現(xiàn)快速流入流出曲線趨勢。圖2.1(a)逡逑和2.1(b)為乳腺DCE-MRI序列中3個感興趣區(qū)域及其TIC模式示意圖:逡逑t邐(a)邐(b)逡逑三種邋TIC模式逡逑強度邐/、、邐—區(qū)域邋1逡逑極:福邐/邐\邐--區(qū)域2逡逑\邋'邐入邐一八邋—邐??邐\邐■邋■?區(qū)域3逡逑f邋邋邐邐—一時—間(!逡逑300\時間(s)邐0邋60邐120邐180邐240邐300逡逑圖2.1感興趣區(qū)域及其TIC模式示意圖逡逑2.3病例分子臨床信息統(tǒng)計分析逡逑2.3.1病例臨床信息統(tǒng)計逡逑本課題所用實驗數(shù)據(jù)來源于某省級三甲醫(yī)院,乳腺癌患者的敏感隱私信息己被移除。原逡逑始共采集了邋605例診治時間在2012年9月-2016年5月的乳腺癌患者。去除其中無免疫組化逡逑信息278例,DCE-MRI序列不全71例,腫瘤治療后進行DCE-MRI檢查20例,影像無明顯逡逑異;虿≡畈豢梢姡玻独,課題對剩下的210例乳腺癌患者進行了回顧性研宄。逡逑通過患者的病理報告發(fā)現(xiàn)
【學(xué)位授予單位】:杭州電子科技大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:R737.9;R445.2
本文編號:2665662
【圖文】:
探索新型分子亞型標(biāo)記物成為國內(nèi)外研究熱點。隨著醫(yī)學(xué)成像技術(shù)的不斷革新和影逡逑像分析方法的相繼進步,影像特征與分子亞型的關(guān)聯(lián)性研究受到國內(nèi)外學(xué)者的關(guān)注[31_37]。逡逑Maciej等[36]基于DCE-MRI研究了腫瘤及背景實質(zhì)組織的增強特征,揭示出DCE-MRI影像逡逑特征與Luminal邋B型乳腺癌存在關(guān)聯(lián)性。Shannon等[35]利用DCE-MRI影像特征設(shè)計/邋Basal-逡逑like乳腺癌識別模型,其方法對良性病變和Basal-like的識別能力最強,但從多種亞型乳腺癌逡逑中識別Basal-like的能力較低。MingFan等[32]提取了乳腺腫瘤DCE-MRI的紋理特征,研究了逡逑影像紋理特征與分子亞型標(biāo)記物Ki-67的關(guān)聯(lián)性,指出腫瘤內(nèi)異質(zhì)性紋理分析是潛在的乳腺逡逑癌臨床標(biāo)記物。逡逑乳腺影像特征與分子亞型的關(guān)聯(lián)性研究雖已有一定進展,但由于乳腺癌的異質(zhì)性和復(fù)雜逡逑性,目前研究設(shè)計的乳腺癌分子亞型預(yù)測模型仍不能達(dá)到實際臨床要求。逡逑1.4主要內(nèi)容及創(chuàng)新點逡逑為提高用影像特征分析方法預(yù)測乳腺癌分子亞型的能力,給乳腺癌的個體化診治提供科逡逑學(xué)依據(jù),本研究對乳腺組織動態(tài)增強影像進行分解及分析,并將其應(yīng)用于乳腺癌分子亞型的逡逑預(yù)測。課題獲得了國家自然基金重點項目及國家自然基金面上項目的經(jīng)費資助。逡逑邐
興趣區(qū)域包含的體素數(shù)量,,S等增強序列數(shù)(本數(shù)據(jù)中S=5)。依據(jù)式(2.1)算出感興趣區(qū)域DCE-逡逑MRI每一體素的TIC(i),感興趣區(qū)域中每個TIC(i)求和取平均即可得到感興趣區(qū)域的TIC。逡逑臨床診斷中常見的TIC模式有三種類型[28],見圖2.1(b)。I型:在整個造影動態(tài)檢測過程逡逑中磁共振信號緩慢持續(xù)增強;II型:造影早期磁共振信號明顯增強,達(dá)到峰值后信號強度在逡逑一段時間內(nèi)保持不變,動態(tài)檢測過程中呈現(xiàn)平臺曲線趨勢;III:造影早期磁共振信號快速增逡逑強,而達(dá)到峰值后信號強度相對降低,在動態(tài)檢測過程中呈現(xiàn)快速流入流出曲線趨勢。圖2.1(a)逡逑和2.1(b)為乳腺DCE-MRI序列中3個感興趣區(qū)域及其TIC模式示意圖:逡逑t邐(a)邐(b)逡逑三種邋TIC模式逡逑強度邐/、、邐—區(qū)域邋1逡逑極:福邐/邐\邐--區(qū)域2逡逑\邋'邐入邐一八邋—邐??邐\邐■邋■?區(qū)域3逡逑f邋邋邐邐—一時—間(!逡逑300\時間(s)邐0邋60邐120邐180邐240邐300逡逑圖2.1感興趣區(qū)域及其TIC模式示意圖逡逑2.3病例分子臨床信息統(tǒng)計分析逡逑2.3.1病例臨床信息統(tǒng)計逡逑本課題所用實驗數(shù)據(jù)來源于某省級三甲醫(yī)院,乳腺癌患者的敏感隱私信息己被移除。原逡逑始共采集了邋605例診治時間在2012年9月-2016年5月的乳腺癌患者。去除其中無免疫組化逡逑信息278例,DCE-MRI序列不全71例,腫瘤治療后進行DCE-MRI檢查20例,影像無明顯逡逑異;虿≡畈豢梢姡玻独,課題對剩下的210例乳腺癌患者進行了回顧性研宄。逡逑通過患者的病理報告發(fā)現(xiàn)
【學(xué)位授予單位】:杭州電子科技大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:R737.9;R445.2
【參考文獻(xiàn)】
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7 紀(jì)小龍,尹彤,李凌;異質(zhì)性在腫瘤基礎(chǔ)及臨床研究中的意義[J];中華腫瘤雜志;2000年04期
本文編號:2665662
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