【摘要】：寨卡病毒(ZIKV)屬黃病毒屬,是一種通過節(jié)肢動物傳播的病毒(蟲媒病毒)。目前,ZIKV可以分為兩個主要譜系,包括非洲譜系、亞洲譜系。1947年,ZIKV首次在非洲的恒河猴中被發(fā)現(xiàn),接下來的數(shù)十年間,ZIKV 一直屬于“睡眠狀態(tài)”,只引起散在傳播,而且癥狀較輕,具有自限性。直至2015年,ZIKV在亞洲、非洲以外的巴西首次大面積爆發(fā)流行,并迅速向全球其他地區(qū)傳播。此次爆發(fā)的特點包括患者人數(shù)激增、傳播范圍擴大、出現(xiàn)嚴(yán)重并發(fā)癥(如GBS、新生兒小頭畸形等),ZIKV感染嚴(yán)重威脅到人類健康。在2016年ZIKV疫情爆發(fā)成為了國際關(guān)注的突發(fā)公共衛(wèi)生事件。根據(jù)流行毒株的系統(tǒng)發(fā)育分析得知,引起近年爆發(fā)流行的毒株均屬亞洲譜系。本研究建立了基于E基因的非洲型寨卡病毒實時熒光定量PCR檢測方法。通過針對ZIKV非洲型標(biāo)準(zhǔn)株MR766(AY632535.2)的E基因編碼區(qū)設(shè)計出上下游引物及探針,開展了相關(guān)的特異性、重復(fù)性、敏感性的實驗,利用本實驗室保存的1-4型登革病毒株、HCV-1b RNA、亞洲型寨卡病毒Z16006株、乙腦病毒疫苗株、基孔肯雅病毒驗證了本方法所設(shè)計引物的特異性;本研究的靈敏度測試結(jié)果表明,2.47×101 copies/μl與2.47×l00copies/μl的檢測尚不夠穩(wěn)定,2.47×100 copies/μl檢測結(jié)果陽性為概率事件,故不能作為絕對定量的依據(jù)。因此,本方法可應(yīng)用于臨床疑似標(biāo)本的檢測,能實現(xiàn)非洲型ZIKV的早期快速檢測、鑒別診斷及標(biāo)本中的病毒定量。ZIKV E蛋白通過與宿主細胞表面受體結(jié)合介導(dǎo)病毒進入宿主細胞,從而開始ZIKV的感染周期,是啟動ZIKV進入宿主細胞的關(guān)鍵因素,而且參與了病毒復(fù)制周期的全過程。通過對兩個譜系E蛋白氨基酸序列的位點進化方向進行分析,發(fā)現(xiàn)氨基酸位點的變化引起了非洲型ZIKV、亞洲型ZIKV E蛋白B細胞表位的改變,同時引起E蛋白結(jié)構(gòu)改變。本研究從寨卡病毒E基因生物信息學(xué)分析入手,建立非洲型ZIKV的實時熒光定量PCR檢測技術(shù);并針對了ZIKV兩個譜系的E蛋白進行了生物信息學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)了非洲型ZIKV與亞洲型ZIKV在E蛋白氨基酸序列上的差異位點,并分析了這些統(tǒng)一差異位點與B細胞差異性表位、E蛋白結(jié)構(gòu)之間的聯(lián)系。本研究有助于實現(xiàn)非洲型寨卡病毒的實驗室早期檢測,并為進一步開展ZIKV血清學(xué)相關(guān)檢測技術(shù)和疫苗的研究提供參考。
【圖文】：

圖１－２邋ＺＩＫＶ邋Ｅ蛋白的可溶性胞外域單體結(jié)構(gòu)逡逑Ｆｉｇ邋１－２邋Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ邋ｏｆ邋ａ邋ｍｏｎｏｍｅｒ邋ｏｆ邋ｔｈｅ邋ｓｏｌｕｂｌｅ邋ｅｃｔｏｄｏｍａｉｎ邋ｏｆ邋Ｅ邋ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ邋ｏｆ邋ＺＩＫＶ逡逑（Ｄ丨為紅色，Ｄ［Ｉ為黃色，Ｄｉｌｌ為藍色，Ｆｕｓｉｏｎ循環(huán)以綠色突出顯示）［［５ｎ逡逑１．２寨卡病毒病的傳染源及傳播途徑逡逑寨卡病毒本來存在于偏遠的非洲森林，但由于全球化及氣候變化，ＺＩＫＶ?jǐn)U逡逑散到了新的地區(qū)。ＺＩＫＶ的宿主可能主要是靈長類動物（包括人），當(dāng)ＺＩＫＶ疫逡逑情爆發(fā)時，人群對于該病毒普遍易感，人群中ＺＩＫＶ的隱性感染者也是重要的傳逡逑染源。ＺＩＫＶ在烏干達實現(xiàn)了宿主從猴子到人類的飛躍，，通過病毒血癥旅行者、逡逑２逡逑

逑ｑｉ邋｜邋５７２１６７４８邋６邋１邋ｇｂ邋｜邋ＫＦ２邋？，＿ｖ．．．．．．逡逑圖２－３圖為本研究所設(shè)計的上游引物逡逑Ｆｉｇ邋２－３邋Ｔｈｅ邋ｕｐｓｔｒｅａｍ邋ｐｒｉｍｅｒ邋ｏｆ邋ｔｈｉｓ邋ｓｔｕｄｙ逡逑１０逡逑
【學(xué)位授予單位】：南方醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2019
【分類號】：R511;R440

【相似文獻】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 沈興;潘博;周揮銘;劉玲娟;田杰;;mmu-miR-3475-3P在心臟發(fā)育中的生物信息學(xué)分析[J];重慶醫(yī)學(xué);2017年26期

2 李紀(jì)強;黃東蘭;孫瑤;姜茂竹;麥仲倫;曾融;張積仁;鄭燕芳;;2001—2010年結(jié)直腸癌易感基因的生物信息學(xué)分析[J];腫瘤防治研究;2013年11期

3 郭秀霞;程鵬;楊培培;王海防;劉麗娟;張崇星;王懷位;公茂慶;;淡色庫蚊氨肽酶N基因的克隆及生物信息學(xué)分析[J];中國人獸共患病學(xué)報;2016年03期

4 姚元枝;黎曉英;魏麟;伍賢進;劉勝貴;唐玉蓮;;魚腥草乙酰輔酶A酰基轉(zhuǎn)移酶基因克隆、表達及生物信息學(xué)分析[J];中草藥;2015年01期

5 黃江;胡旭初;黃艷;余新炳;包懷恩;郎書源;廖興江;;牛帶絳蟲亞洲亞種蘋果酸脫氫酶基因的生物信息學(xué)分析[J];中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志;2008年03期

6 成軍;李克;陸蔭英;王琳;劉妍;;丙型肝炎病毒核心蛋白結(jié)合蛋白6基因和蛋白的生物信息學(xué)分析[J];世界華人消化雜志;2003年04期

7 郭笑;陳冬雪;韓笑;魏景艷;孫晶波;徐廣宇;盛瑜;安麗萍;;人谷胱甘肽過氧化物酶的生物信息學(xué)分析[J];北華大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2016年06期

8 尹積榮;楊凱;白玉興;王邦康;;甲狀旁腺素的生物信息學(xué)分析[J];口腔醫(yī)學(xué)研究;2011年07期

9 謝超;郜盡;袁運生;俞雁;;蛋白質(zhì)相互作用及互作網(wǎng)絡(luò)的生物信息學(xué)分析[J];上海交通大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版);2009年04期

10 郭蓉;;沉默調(diào)節(jié)因子的生物信息學(xué)分析[J];黑龍江畜牧獸醫(yī);2017年09期

相關(guān)會議論文 前10條

1 閻曉菲;黃兵;韓紅玉;楊斌;岳城;趙其平;姜連連;董輝;;雞堆型艾美耳球蟲新基因的克隆與生物信息學(xué)分析[A];全國動物生理生化第七屆全國代表大會暨第十三次學(xué)術(shù)交流會論文摘要匯編[C];2014年

2 易樂飛;閻斌倫;王萍;滕亞娟;周向紅;;條斑紫菜HSP70基因克隆與生物信息學(xué)分析[A];慶祝中國藻類學(xué)會成立30周年暨第十五次學(xué)術(shù)討論會摘要集[C];2009年

3 曾松榮;柯野;伍嘉慧;李嘉盛;林映君;;土曲霉堿性蛋白酶基因的克隆及其生物信息學(xué)分析[A];第九屆中國酶工程學(xué)術(shù)研討會論文摘要集[C];2013年

4 陳玲;朱玲玲;史春梅;季晨博;郭錫熔;;miR-146b靶基因預(yù)測和生物信息學(xué)分析[A];2012年江浙滬兒科學(xué)術(shù)年會暨浙江省醫(yī)學(xué)會兒科學(xué)分會學(xué)術(shù)年會、兒內(nèi)科疾病診治新進展國家級學(xué)習(xí)班論文匯編[C];2012年

5 張林生;楊穎;;小麥類脫水素基因克隆及其生物信息學(xué)分析[A];2007中國植物生理學(xué)會全國學(xué)術(shù)會議論文摘要匯編[C];2007年

6 高歌;;Accurately annotate genetic variants: things we have to do to achieve precision medicine[A];中國生物工程學(xué)會第二屆青年科技論壇暨首屆青年工作委員會學(xué)術(shù)年會論文集[C];2017年

7 李偉忠;楊博;陳之鋒;黃宇;韓國旭;;通過生物信息學(xué)分析識別頭頸鱗狀細胞癌潛在的生物標(biāo)志物和其預(yù)后價值[A];2017全國口腔頜面——頭頸腫瘤外科學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2017年

8 張瑾;岳超;章元明;;基因表達譜數(shù)據(jù)聚類方法比較研究[A];第六屆全國動植物數(shù)量遺傳學(xué)學(xué)術(shù)研討會論文摘要集[C];2014年

9 李偉忠;楊博;陳之鋒;黃宇;韓國旭;;生物信息學(xué)分析識別頭頸鱗狀細胞癌潛在生物標(biāo)志物和其預(yù)后價值[A];第十二次全國口腔頜面-頭頸腫瘤內(nèi)科及脈管疾病學(xué)術(shù)會議暨第二次河南省抗癌協(xié)會口腔頜面腫瘤學(xué)會會議論文匯編[C];2018年

10 王小龍;宋金柱;;角毛殼菌葡聚糖酶基因的獲得及生物信息學(xué)分析[A];中國植物病理學(xué)會2012年學(xué)術(shù)年會論文集[C];2012年

相關(guān)重要報紙文章 前1條

1 本報記者 張佳星;基因檢測走向臨床還缺點啥[N];科技日報;2018年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條

1 潘登;SCA3小鼠的腦電研究和生物信息學(xué)分析[D];鄭州大學(xué);2017年

2 楊波;高通量數(shù)據(jù)的生物信息學(xué)分析和一致性排序算法研究[D];武漢大學(xué);2014年

3 IBUKUN AKINBAMBO AKINYEMI;[D];中國科學(xué)技術(shù)大學(xué);2018年

4 張亮;重金屬鎘致肝癌的生物信息學(xué)分析及候選基因的功能驗證[D];中國農(nóng)業(yè)大學(xué);2018年

5 馬永平;含質(zhì)粒人兩歧雙歧桿菌的分離、質(zhì)粒測序和生物信息學(xué)分析[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2005年

6 蘇志熙;幾種哺乳動物表達序列標(biāo)簽（EST）生物信息學(xué)分析[D];浙江大學(xué);2006年

7 韋博;基于芯片數(shù)據(jù)和文本挖掘的膠質(zhì)瘤生物信息學(xué)分析[D];吉林大學(xué);2015年

8 上官輝;肝癌易感相關(guān)基因及組織基因表達譜生物信息學(xué)分析[D];南方醫(yī)科大學(xué);2015年

9 許波;倭蜂猴糞便微生物多樣性研究及功能基因的生物信息學(xué)分析[D];云南師范大學(xué);2015年

10 唐欣;軟骨發(fā)生過程中基因表達譜的測定及生物信息學(xué)分析[D];華中科技大學(xué);2007年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 潘磊;華細辛cad基因生物信息學(xué)分析與原核表達[D];上海交通大學(xué);2017年

2 葉燁;廣西壯族地區(qū)孕婦AFB1內(nèi)暴露與AFB1對人肝細胞的生物信息學(xué)分析[D];廣西醫(yī)科大學(xué);2019年

3 陳嘉雯;基于E基因的非洲型寨卡病毒QPCR檢測方法的建立及生物信息學(xué)分析[D];南方醫(yī)科大學(xué);2019年

4 賴文杰;激素敏感與去勢抵抗性前列腺癌的生物信息學(xué)分析[D];南方醫(yī)科大學(xué);2018年

5 方娜;早期青光眼相關(guān)基因的生物信息學(xué)分析[D];蘇州大學(xué);2018年

6 余毛毛;男性先天性低促性腺激素性性腺功能減退的基因診斷研究[D];江蘇大學(xué);2018年

7 高營;UNC5D蛋白的生物信息學(xué)分析[D];中國醫(yī)科大學(xué);2018年

8 趙霞;小麥抗病分子標(biāo)記的生物信息學(xué)分析[D];山西大學(xué);2018年

9 黃穎;BDV-P和BDV-N與宿主相互作用的差異蛋白質(zhì)鑒定及生物信息學(xué)分析[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2018年

10 韓瑞鑫;綿羊肺炎支原體檢測方法的建立及全基因組生物信息學(xué)分析[D];內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué);2018年

本文編號：2643393