【摘要】：目的:探討三種不同分子分型方法脈沖場凝膠電泳(PFGE)、多位點(diǎn)序列分析(MLST)及核心基因組多位點(diǎn)序列分析(cgMLST)在碳青霉烯耐藥鮑曼不動桿菌(CRAB)溯源中的應(yīng)用,揭示其流行播散規(guī)律。方法:收集2016～2018年間來源于我國浙江省臺州地區(qū)三家醫(yī)院、并經(jīng)微量肉湯稀釋法復(fù)核藥敏結(jié)果的CRAB菌株,運(yùn)用PCR及測序方法驗(yàn)證常見的碳青霉烯酶基因(blaOXA-23、blaOXA-24和blaOXA-58)攜帶情況,運(yùn)用PFGE進(jìn)行同源性分析并挑選出同一 PFGE型的主要克隆菌株,運(yùn)用全基因組測序(WGS)技術(shù)對主要克隆菌株進(jìn)行測序;應(yīng)用測序結(jié)果分析研究菌株的耐藥基因攜帶情況、MLST型以及cgMLST型;結(jié)合不同cgMLST分型菌株間的差異和患者臨床資料,繪制臨床播散路徑圖。結(jié)果:研究期間共收集到149株CRAB菌株,其中146株(98%)攜帶blaOXA23、2株攜帶blaOXA-58、1株未檢測到這三種常見碳青霉烯酶耐藥基因,所有菌株均未檢測有攜帶blaOXA-24。PFGE將菌株分成15個脈沖型(A到O),A型共73株(49%),為主要克隆菌株。A型菌株全基因組測序分析結(jié)果顯示:所有菌攜帶blaOXA-23、blaADC-25、aph(6)-ld及strA,70%菌株攜帶 blaTEM-1、arm、aph(3')-Ia、msr(E)、mph(E)、tet(B)。MLST分型顯示這73株均為ST2型(Pasteur方案),根據(jù)Oxford方案,共有 6 個 ST 型:ST195、ST208、ST136、ST369、ST784、STnovel(新的ST型);cgMLST分型可將73株菌分成9個簇,其中最大簇占比46.6%(34/73)。結(jié)合臨床資料發(fā)現(xiàn)這73株菌株大部分患者存在轉(zhuǎn)床或者部分患者存在同一家醫(yī)院轉(zhuǎn)入的情況,有4個cgMLST簇分離自同一家醫(yī)院同一個科室。結(jié)論:cgMLST較PFGE及MLST具有更高的分辨率,在CRAB溯源研究方面具有更高的應(yīng)用價(jià)值。cgMLST結(jié)果揭示攜帶CRAB的患者在不同醫(yī)院或不同科室間的轉(zhuǎn)移為CRAB流行播散的重要危險(xiǎn)因素。
【圖文】：

浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文邐實(shí)驗(yàn)結(jié)果逡逑４實(shí)驗(yàn)結(jié)果逡逑４．１菌株基本情況及藥物敏感性逡逑４．１．１菌株來源及標(biāo)本類型逡逑本研究共收集２０１６年６月２１日至２０１８年３月４日從浙江省臺州地區(qū)三家醫(yī)逡逑院收集的非重復(fù)性碳青霉烯耐藥鮑曼不動桿菌（ＣＲＡＢ）邋１４９株，包括臺州醫(yī)院８５逡逑株，，臺州市立醫(yī)院４５株，溫嶺市第一人民醫(yī)院１９株。標(biāo)本類型可分為７種，痰逡逑液占絕大部分，具體見圖４．１�；颊吣挲g分布總體偏大，６０歲以上１１３例（７５．８％），逡逑４０歲以下僅７例（４．７％），見圖４．２。所有菌株來源于三家醫(yī)院１４個不同科室，各逡逑家醫(yī)院均以ＩＣＵ分離率最高，神經(jīng)外科其次，具體見圖４．３。逡逑

4研究菌株年齡分布圖
【學(xué)位授予單位】：浙江大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2019
【分類號】：R446.5

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本文編號：2618463