【摘要】：了解江蘇省南京市和無錫市兩地夏秋季急性胃腸炎人星狀病毒(HastV)的基因亞型。收集2015~2016年6~11月江蘇省南京市和無錫市兩地夏秋季急性胃腸炎患者糞便標本,采用real-time RT-PCR法檢測糞便中HAstV的病毒核酸,對陽性標本ORF2區(qū)進行RT-PCR擴增及測序,與GenBank公開的序列進行比對,分析基因亞型情況。江蘇省南京市和無錫市兩地夏秋季急性胃腸炎HAstV感染的比例為15.26%,其中50%為合并其它急性胃腸炎病毒感染,HAstV感染以秋季流行為主,包含HAstV-1a(group 2)亞型和HAstV-4c基因亞型,并且這2個亞型在兩地均有分布。HastV在嬰幼兒人群中感染率較高;HAstV-1a亞型為在江蘇省南京市和無錫市兩地首次發(fā)現(xiàn)及報道的亞型,可能為歐美輸入性毒株,本研究為進一步了解國內(nèi)HAstV分子流行特征提供依據(jù)。
[Abstract]:To investigate the gene subtype of human stellate virus (HastV) of acute gastroenteritis in Nanjing and Wuxi in summer and autumn. The fecal samples of patients with acute gastroenteritis in summer and autumn in Nanjing and Wuxi, Jiangsu Province from June to November, 2015-2016 were collected. The viral nucleic acid of HAstV in feces was detected by real-time RT-PCR, and the ORF2 region of positive samples was amplified by RT-PCR and sequenced. The results were compared with the published sequences of GenBank and analyzed the subtypes of the genes. The HAstV infection rate of acute gastroenteritis in summer and autumn was 15.26% in Nanjing City and Wuxi City, Jiangsu Province, and 50% of them were associated with other acute gastroenteritis virus infection. The prevalence of HAstV infection was mainly in autumn. HastV contains HAstV-1a (group 2) subtype and HAstV-4c gene subtype, and these two subtypes are distributed in both places. HastV infection rate is higher in infants and young children. HAstV-1a subtype was found and reported for the first time in Nanjing and Wuxi, Jiangsu Province, and may be imported from Europe and the United States. This study provides a basis for further understanding the epidemic characteristics of HAstV molecules in China.
【作者單位】： 無錫市第五人民醫(yī)院;南京市婦幼保健院;
【基金】：無錫市衛(wèi)生計生委重大項目(項目號:z201603);題目:傳染病臨床生物樣本庫及大數(shù)據(jù)分析平臺建設(shè)~~
【分類號】：R440;R512.5

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本文編號：2434781