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基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜在醋酸鈣-鮑曼不動桿菌復(fù)合菌鑒定及同源性分析中的應(yīng)用

發(fā)布時間:2018-11-20 20:16
【摘要】:目的評價基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜(MALDI-TOF MS)對我院血流感染樣本中醋酸鈣-鮑曼不動桿菌復(fù)合菌的鑒定及同源性分析中的應(yīng)用。方法收集2011年4月—2015年4月我院非重復(fù)血流感染標(biāo)本,對VITEK 2 Compact全自動微生物鑒定儀初步鑒定為醋酸鈣-鮑曼不動桿菌復(fù)合菌的菌株,開展基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜鑒定,用MALDIBiotyper軟件和ERIC-PCR進行同源性分析,并用16S r RNA及rec A基因測序技術(shù)進行驗證。結(jié)果基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜對20株VITEK 2無法鑒定到種的醋酸鈣-鮑曼不動桿菌復(fù)合菌展開了有效的鑒定,其中9株為醫(yī)院不動桿菌(Acinetobacter nosocominalis),11株為皮特不動桿菌(Acinetobacter pittii),兩種細(xì)菌的質(zhì)譜圖中均含有特異性的峰圖,能有效地將兩類細(xì)菌進行區(qū)分。同源性分析結(jié)果將菌株分為2大簇(I型11株,II型9株),II型又分為3小簇(IIa4株,IIb3株,IIc2株)。I型、II型分布在我院4個病區(qū)。結(jié)論基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜在醋酸鈣-鮑曼不動桿菌復(fù)合菌鑒定方面具有精準(zhǔn)、快速的優(yōu)點,可以鑒別出皮特不動桿菌和醫(yī)院不動桿菌,MALDI-Biotyper軟件進行同源性分析十分便捷。
[Abstract]:Objective to evaluate the application of matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) in identification and homology analysis of Acinetobacter baumannii complex in blood stream infection samples. Methods from April 2011 to April 2015, non-repeated blood stream infection samples were collected in our hospital. The VITEK 2 Compact automatic microbiological identification instrument was used to identify the strain of Acinetobacter Acetate-Baumann Acinetobacter Acetate. Matrix-assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry was carried out, homology analysis was performed by MALDIBiotyper software and ERIC-PCR, and was verified by 16s r RNA and rec A gene sequencing techniques. Results Matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry was used to identify 20 strains of Acinetobacter VITEK 2, 9 of which were (Acinetobacter nosocominalis),. 11 strains of Acinetobacter (Acinetobacter pittii), have specific peaks in the mass spectrogram, which can effectively distinguish the two kinds of bacteria. The results of homology analysis showed that the strains were divided into 2 clusters (11 strains of type I and 9 strains of II type), II) into 3 clusters (IIa4, IIb3,). I, II). Conclusion Matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry has the advantages of accuracy and rapidity in the identification of Acinetobacter Pitt and Acinetobacter hospitalis. MALDI-Biotyper software is very convenient for homology analysis.
【作者單位】: 浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第一醫(yī)院傳染病診治國家重點實驗室感染性疾病診治協(xié)同創(chuàng)新中心;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(No.81301461,No.81361138021) 國家重點研發(fā)計劃(No.2016YFD0501105)
【分類號】:R446.5

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本文編號:2345891

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