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基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜在醋酸鈣-鮑曼不動(dòng)桿菌復(fù)合菌鑒定及同源性分析中的應(yīng)用

發(fā)布時(shí)間:2018-11-20 20:16
【摘要】:目的評(píng)價(jià)基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOF MS)對(duì)我院血流感染樣本中醋酸鈣-鮑曼不動(dòng)桿菌復(fù)合菌的鑒定及同源性分析中的應(yīng)用。方法收集2011年4月—2015年4月我院非重復(fù)血流感染標(biāo)本,對(duì)VITEK 2 Compact全自動(dòng)微生物鑒定儀初步鑒定為醋酸鈣-鮑曼不動(dòng)桿菌復(fù)合菌的菌株,開展基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜鑒定,用MALDIBiotyper軟件和ERIC-PCR進(jìn)行同源性分析,并用16S r RNA及rec A基因測(cè)序技術(shù)進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜對(duì)20株VITEK 2無(wú)法鑒定到種的醋酸鈣-鮑曼不動(dòng)桿菌復(fù)合菌展開了有效的鑒定,其中9株為醫(yī)院不動(dòng)桿菌(Acinetobacter nosocominalis),11株為皮特不動(dòng)桿菌(Acinetobacter pittii),兩種細(xì)菌的質(zhì)譜圖中均含有特異性的峰圖,能有效地將兩類細(xì)菌進(jìn)行區(qū)分。同源性分析結(jié)果將菌株分為2大簇(I型11株,II型9株),II型又分為3小簇(IIa4株,IIb3株,IIc2株)。I型、II型分布在我院4個(gè)病區(qū)。結(jié)論基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜在醋酸鈣-鮑曼不動(dòng)桿菌復(fù)合菌鑒定方面具有精準(zhǔn)、快速的優(yōu)點(diǎn),可以鑒別出皮特不動(dòng)桿菌和醫(yī)院不動(dòng)桿菌,MALDI-Biotyper軟件進(jìn)行同源性分析十分便捷。
[Abstract]:Objective to evaluate the application of matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) in identification and homology analysis of Acinetobacter baumannii complex in blood stream infection samples. Methods from April 2011 to April 2015, non-repeated blood stream infection samples were collected in our hospital. The VITEK 2 Compact automatic microbiological identification instrument was used to identify the strain of Acinetobacter Acetate-Baumann Acinetobacter Acetate. Matrix-assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry was carried out, homology analysis was performed by MALDIBiotyper software and ERIC-PCR, and was verified by 16s r RNA and rec A gene sequencing techniques. Results Matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry was used to identify 20 strains of Acinetobacter VITEK 2, 9 of which were (Acinetobacter nosocominalis),. 11 strains of Acinetobacter (Acinetobacter pittii), have specific peaks in the mass spectrogram, which can effectively distinguish the two kinds of bacteria. The results of homology analysis showed that the strains were divided into 2 clusters (11 strains of type I and 9 strains of II type), II) into 3 clusters (IIa4, IIb3,). I, II). Conclusion Matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry has the advantages of accuracy and rapidity in the identification of Acinetobacter Pitt and Acinetobacter hospitalis. MALDI-Biotyper software is very convenient for homology analysis.
【作者單位】: 浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第一醫(yī)院傳染病診治國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室感染性疾病診治協(xié)同創(chuàng)新中心;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(No.81301461,No.81361138021) 國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃(No.2016YFD0501105)
【分類號(hào)】:R446.5

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本文編號(hào):2345891

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