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基于基因組學(xué)的肺炎克雷伯菌噬菌體安全性評(píng)估

發(fā)布時(shí)間:2018-05-18 22:31

  本文選題:肺炎克雷伯菌 + 噬菌體 ; 參考:《基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)》2017年03期


【摘要】:泛耐藥肺炎克雷伯菌的流行,使得臨床面臨無(wú)藥可用,越來(lái)越多的肺炎克雷伯菌噬菌體近年來(lái)被報(bào)道,并在動(dòng)物模型中證明了它們用于防控細(xì)菌感染的有效性。然而,噬菌體作為病毒的一類,不同于傳統(tǒng)的抗菌藥物,在臨床應(yīng)用之前需要進(jìn)行更為全面的評(píng)估,本研究將基于基因組學(xué)對(duì)已報(bào)道的肺炎克雷伯菌噬菌體安全性進(jìn)行評(píng)估。通過(guò)生物信息學(xué)分析噬菌體基因組上是否含有肺炎克雷伯菌限制性內(nèi)切酶識(shí)別位點(diǎn)來(lái)評(píng)估其基因組穩(wěn)定性,并就其是否攜帶有害基因和是否屬于溶原性噬菌體等方面進(jìn)行分析研究。目前已報(bào)道22株肺炎克雷伯菌噬菌體的全基因組,7株屬于肌尾科,12株屬于短尾科,3株屬于長(zhǎng)尾科;而本研究基于噬菌體全基因組同源性分析結(jié)果將短尾科、長(zhǎng)尾科和肌尾科中的JD001歸為一類,定義為Kp_PhageⅠ;肌尾科分為Kp_phageⅡa和Kp_PhageⅡb兩類。噬菌體基因組上含有數(shù)目不等的肺炎克雷伯菌限制性內(nèi)切酶識(shí)別位點(diǎn),不攜帶有毒力基因和耐藥基因。5株屬于溫和噬菌體,17株屬于烈性噬菌體。研究顯示肺炎克雷伯菌噬菌體在基因組水平具有良好的安全性,但是基因組上較多的肺炎克雷伯菌限制性內(nèi)切酶識(shí)別位點(diǎn),使其抗菌譜可能較窄。在使用噬菌體用于防控細(xì)菌感染時(shí)部分溫和噬菌體需要謹(jǐn)慎排除。
[Abstract]:In this study , we have reported that there are 22 strains of Klebsiella pneumoniae phage genome , 7 strains belong to Mycoridae and 12 strains belong to short - tailed families .
【作者單位】: 上海交通大學(xué)附屬上海市第一人民醫(yī)院檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)科;上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)部免疫學(xué)與微生物學(xué)系;
【基金】:國(guó)家青年科學(xué)基金項(xiàng)目(No.31500154) 上海市科學(xué)技術(shù)委員會(huì)“揚(yáng)帆計(jì)劃”項(xiàng)目(No.15YF1409500) 上海市衛(wèi)生和計(jì)劃生育委員會(huì)課題(No.201440289) 上海市第一人民醫(yī)院“優(yōu)青前計(jì)劃”(No.06N1503012)共同資助
【分類號(hào)】:R440

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本文編號(hào):1907503

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