本文選題：輪狀病毒 + 實(shí)時熒光定量PCR�。� 參考：《病毒學(xué)報(bào)》2017年02期

【摘要】：建立一種通用的檢測不同物種來源A組輪狀病毒的逆轉(zhuǎn)錄實(shí)時熒光定量PCR方法(RT-qPCR)。根據(jù)輪狀病毒保守的NSP5基因的保守序列設(shè)計(jì)引物和探針,建立并優(yōu)化RT-qPCR檢測體系;同時通過9份輪狀病毒毒株和96份臨床標(biāo)本的檢測對該方法和目前常用的基于NSP3基因的2種RT-qPCR方法進(jìn)行靈敏度和檢出率的比較。新建立的RT-qPCR方法特異性高,重復(fù)性好;與基于NSP3基因的方法相比:(1)在臨床標(biāo)本檢測中,檢出率無差異;(2)9株培養(yǎng)病毒檢測中,NSP5體系可全部檢出,兩個NSP3對照體系NSP3-1和NSP3-2的檢出率分別為78.78%(7/9)和88.89%(8/9);(3)NSP5體系與對照NSP3-1體系靈敏度相當(dāng),檢測下限比NSP3-2體系低100倍。本研究建立的基于NSP5的熒光定量PCR體系靈敏度高,可檢測毒株范圍廣,為檢測不同物種來源的A組輪狀病毒提供一種新的選擇。
[Abstract]:A universal RT-PCR real-time quantitative PCR method for detecting rotavirus group A from different species was established. According to the conserved sequence of NSP5 gene of rotavirus, primers and probes were designed to establish and optimize the detection system of RT-qPCR. At the same time, the sensitivity and detection rate of 9 rotavirus strains and 96 clinical specimens were compared with the two RT-qPCR methods based on NSP3 gene. Compared with the method based on NSP3 gene, the new RT-qPCR method has high specificity and good reproducibility. The detection rates of NSP3-1 and NSP3-2 in two NSP3 control systems were 78.78 / 7 / 9 and 88.89 / 8 / 9 respectively. The sensitivity of NSP5 system was similar to that of control NSP3-1 system, and the detection limit was 100 times lower than that of NSP3-2 system. The fluorescent quantitative PCR system based on NSP5 has high sensitivity and wide detection range, which provides a new choice for detecting group A rotavirus from different species.
【作者單位】： 廈門大學(xué)分子疫苗學(xué)與分子診斷學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室國家傳染病診斷試劑與疫苗工程技術(shù)研究中心生命科學(xué)學(xué)院;廈門大學(xué)分子疫苗學(xué)與分子診斷學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室國家傳染病診斷試劑與疫苗工程技術(shù)研究中心公共衛(wèi)生學(xué)院;重慶醫(yī)科大學(xué)附屬兒童醫(yī)院感染科;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(項(xiàng)目號:81501741),題目:輪狀病毒VP8與VP5抗原區(qū)相互作用及解離機(jī)制的研究
【分類號】：R440

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號：1819415