中山市2007—2014年1型登革病毒E基因分子特征分析
發(fā)布時(shí)間:2018-04-12 16:04
本文選題:型登革病毒 + E基因; 參考:《南昌大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版)》2017年01期
【摘要】:目的分離、鑒定中山市2007—2014年1型登革病毒并獲得E基因序列,從分子水平分析其系統(tǒng)進(jìn)化和地域來(lái)源情況,了解該病毒各年份的流行性質(zhì)。方法收集中山市2007—2014年登革熱患者急性期血清,接種C6/36細(xì)胞分離登革病毒,應(yīng)用RT-PCR技術(shù)擴(kuò)增病毒的包膜蛋白E基因全長(zhǎng),并對(duì)序列進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化和同源性分析。結(jié)果共分離到登革1型病毒流行株25株,參考國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)株E基因序列將其分為GⅠ型和GⅤ型2個(gè)基因型。其中2007年3株,2012年3株,2013年3株,2014年7株聚集在GⅠ型中,2014年9株聚集在GⅤ型中。中山2014年登革病毒GⅠ型流行株與中山市2007年、2012年、2013年流行株E基因核苷酸(氨基酸)序列相似度分別為98.25%(99.40%)、98.18%(99.80%)、99.73%(100.00%),與珠三角2014年廣州、珠海輸入中山株的氨基酸序列相似度為100.00%;中山市2013年登革病毒GⅠ型流行株與廣州、佛山的2013年流行株E基因核苷酸(氨基酸)序列相似度分別為99.67%(100.00%)、99.74%(100.00%)。結(jié)論 2007—2014年中山市流行的登革1型病毒有2個(gè)基因型(GⅠ型和GⅤ型)。2014年GⅤ型可能由國(guó)外輸入,GⅠ型中2007年和2012年為國(guó)外輸入株,2013年及2014年流行株E基因序列相似度高,2014年的登革流行可能與2013年流行株本地化有關(guān)。
[Abstract]:Objective to isolate, identify and sequence the E gene of dengue virus type 1 from 2007 to 2014 in Zhongshan City, and analyze its phylogeny and geographical origin at molecular level.Methods Serum samples of dengue fever patients from 2007 to 2014 in Zhongshan City were collected and inoculated with C6 / 36 cells to isolate dengue virus. The full length of envelope protein E gene was amplified by RT-PCR technique and the sequence was systematically evolved and homologous analyzed.Results A total of 25 strains of dengue 1 virus were isolated and classified into two genotypes, G 鈪,
本文編號(hào):1740438
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