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人類白細(xì)胞抗原E基因全長(zhǎng)序列測(cè)定及兩個(gè)新等位基因的鑒定

發(fā)布時(shí)間:2018-02-24 16:30

  本文關(guān)鍵詞: HLA抗原 等位基因 組織工程 干細(xì)胞 移植 人類白細(xì)胞抗原E PCR-SBT 全基因序列測(cè)定 新等位基因 多態(tài)性 出處:《中國(guó)組織工程研究》2017年25期  論文類型:期刊論文


【摘要】:背景:人類白細(xì)胞抗原E是非經(jīng)典的人類白細(xì)胞抗原I類分子,目前的多態(tài)性分析研究主要針對(duì)其第3外顯子人類白細(xì)胞抗原E~*01:01及人類白細(xì)胞抗原E*01:03進(jìn)行區(qū)分,然而其全基因序列測(cè)定方法及新等位基因報(bào)道尚不多見(jiàn)。目的:利用中國(guó)深圳地區(qū)無(wú)償獻(xiàn)血正常個(gè)體建立人類白細(xì)胞抗原E基因全長(zhǎng)序列測(cè)序分型方法,鑒定人類白細(xì)胞抗原E基因全長(zhǎng)序列新的等位基因。方法:提取研究對(duì)象外周血DNA,根據(jù)IMGT/HLA數(shù)據(jù)庫(kù)中公布的人類白細(xì)胞抗原E基因序列,在保守區(qū)設(shè)計(jì)全基因擴(kuò)增及測(cè)序引物,利用高保真反應(yīng)體系對(duì)人類白細(xì)胞抗原E全長(zhǎng)序列進(jìn)行擴(kuò)增,隨后測(cè)序、拼接、序列確認(rèn)及基因定型。結(jié)果與結(jié)論:(1)成功建立了人類白細(xì)胞抗原E的全基因擴(kuò)增及測(cè)序分型方法,發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)人類白細(xì)胞抗原E新等位基因——人類白細(xì)胞抗原E~*01:01:01:06與人類白細(xì)胞抗原E~*01:01:01:07,獲得了WHO人類白細(xì)胞抗原命名因子委員會(huì)的命名;(2)人類白細(xì)胞抗原E~*01:01:01:06與其最接近的等位基因人類白細(xì)胞抗原E~*01:01:01:01相比,突變位點(diǎn)在5’-啟動(dòng)子區(qū)的NT-26(G-T),人類白細(xì)胞抗原E~*01:01:01:07與其最接近的等位基因人類白細(xì)胞抗原E~*01:01:01:01相比,突變位點(diǎn)在3’-非翻譯區(qū)的NT3345位(T-C);(3)結(jié)果提示,中國(guó)人群中人類白細(xì)胞抗原E全基因序列多態(tài)性數(shù)據(jù)有待填補(bǔ),試驗(yàn)建立的方法為該項(xiàng)研究提供了關(guān)鍵的技術(shù)。
[Abstract]:Background: human leukocyte antigen E is a nonclassical class I molecule of human leukocyte antigen. The present polymorphism analysis is mainly focused on the differentiation of human leukocyte antigen Et01: 01: 01 and human leukocyte antigen Et01: 03 at exon 3. However, the whole gene sequencing method and the new alleles have not been reported. Objective: to establish a full-length sequence sequencing method for human leukocyte antigen E gene from normal volunteers in Shenzhen area, China. Methods: a novel allele of human leukocyte antigen E gene was identified. Methods: the whole gene amplification and sequencing primers were designed according to the sequence of human leukocyte antigen E gene published in IMGT/HLA database. The full-length sequence of human leukocyte antigen E was amplified by high fidelity reaction system, then sequenced and spliced. Results and conclusion the whole gene amplification and sequencing of human leukocyte antigen E were successfully established. Two new alleles of human leucocyte antigen E were found: human leukocyte antigen E 01: 01: 01: 06 and human white blood cell antigen 01: 01: 01: 07. The name of the WHO Committee of Human Leukocyte Antigen nomenclature factors was obtained. The nearest allele, the human leukocyte antigen, was compared to 01: 01: 01: 01. The mutation locus is in the NT-26G-TN of the 5NT-promoter region, and the NT3345 position T-C3 of the human leukocyte antigen Et01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01: 01. The data of human leukocyte antigen E gene polymorphisms in Chinese population need to be filled. The experimental method provides a key technique for this study.
【作者單位】: 深圳市血液中心深圳市組織配型與免疫遺傳重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:廣東省醫(yī)學(xué)科研基金(A2016222)資助 深圳市科技研發(fā)資金(GJHZ20160229170608241)~~
【分類號(hào)】:R440

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本文編號(hào):1530931

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