發(fā)布時(shí)間：2018-01-27 07:26

  本文關(guān)鍵詞： 手足口病 基因型 VP基因 序列分析　出處：《現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué)》2017年15期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：目的了解2016年鹽城地區(qū)手足口病腸道病毒病原譜分布特征,并對鑒定為A組不同基因型腸道病毒VP1基因進(jìn)行分子進(jìn)化特征分析。方法通過實(shí)時(shí)熒光RT-PCR方法對2016年鹽城市疑似手足口病咽肛拭子標(biāo)本進(jìn)行非EV71非CVA16其他腸道病毒陽性標(biāo)本的篩選,對分子分型鑒定為A組不同基因型的腸道病毒,用RT-PCR擴(kuò)增各自VP1基因全長編碼區(qū)并測序,采用相應(yīng)的生物信息軟件進(jìn)行核苷酸及氨基酸序列比對及基因種系進(jìn)化特征分析。結(jié)果非EV71非CVA16腸道病毒基因定型結(jié)果顯示共有7個(gè)基因型CVA4、CVA6、CVA10、ECHO3、ECH09、ECHO13、CVB4。遺傳進(jìn)化樹顯示,鹽城地區(qū)EV71和CVA16代表株分屬于C4a、B1b進(jìn)化分支,CVA6型代表株分屬D1、D3進(jìn)化分支,CVA10型代表株屬于D1基因亞群的毒株,遠(yuǎn)離各自原型株。CVA4型代表株與近年國內(nèi)代表株親緣關(guān)系較遠(yuǎn),與原型株在同一進(jìn)化譜系。結(jié)論 2016年鹽城市手足病流行的病原譜呈現(xiàn)多樣性,有多種基因型的腸道病毒同時(shí)流行,CVA6是優(yōu)勢病原體,EV71和CVA16仍占有一定比例。
[Abstract]:Objective to investigate the distribution of enterovirus spectrum of hand, foot and mouth disease in Yancheng area in 2016. The molecular evolution characteristics of enterovirus VP1 gene identified as different genotypes of group A were analyzed by real-time fluorescence RT-PCR method. In 2016, the pharynx and anal swabs of suspected hand, foot and mouth disease in Yancheng city were collected from the swabs of pharynx and anal. Non EV71 non CVA16 positive specimens were screened. The full-length coding region of VP1 gene was amplified by RT-PCR and sequenced. The nucleotide and amino acid sequence alignment and phylogenetic characteristics were analyzed by using the corresponding bioinformatics software. Results the results of non-EV71 non-CVA16 enterovirus genotyping showed that there were 7 genotypes CV. A4. CVA6 / CVA10 / ECHO3 / ECH09 / ECHO13CVB4. genetic evolution tree shows that the representative strains of EV71 and CVA16 belong to C4a in Yancheng area. The representative strain of B1b evolutionary branch CVA6 belongs to the representative strain of D1D3 evolutionary branch CVA10 which belongs to the subgroup of D1 gene. The relationship between the representative strain of CVA4 and the representative strain in recent years is far away, and it is in the same phylogenetic pedigree with the prototype strain. Conclusion in 2016, the pathogenic spectrum of hand and foot disease in Yancheng City showed diversity. The enteroviruses with multiple genotypes still have a certain proportion of CVA16 and EV71, which are the dominant pathogens at the same time.
【作者單位】： 鹽城市疾病預(yù)防控制中心;鹽城市婦幼保健院;
【基金】：江蘇省衛(wèi)計(jì)委醫(yī)學(xué)青年科研課題(Q201513) 鹽城市醫(yī)學(xué)科技發(fā)展計(jì)劃項(xiàng)目(YK2015032)
【分類號】：R440;R725.1
【正文快照】： 手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)是一種常見腸道病毒感染的嬰幼兒急性傳染病[1-3]。根據(jù)國際病毒分類委員會(huì)(ICTV)分類,感染人的腸道病毒(Human Enterovirus,HEV)分為A、B、C、D四組,與手足口病有關(guān)的主要在A組,少部分在B組。目前,A組腸道病毒有17個(gè)血清型包括柯

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9 牛玉宏,楊英珍,虞勇,葛均波;腸道病毒基因?qū)崟r(shí)定量RT-PCR方法的建立[J];復(fù)旦學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)科學(xué)版);2001年06期

10 胡小云;朱冰;王長兵;鄺璐;肖密絲;;腸道病毒71型的快速純化及其鑒定[J];國際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志;2012年08期

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10 彭全英;;成年手足口病住院患者的護(hù)理[A];中華護(hù)理學(xué)會(huì)2009全國傳染病護(hù)理學(xué)術(shù)交流暨專題講座會(huì)議論文匯編[C];2009年

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本文編號：1467949