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引起甘肅省一起病毒性腦炎疫情的ECHO30全基因組序列分析

發(fā)布時間:2018-01-10 08:39

  本文關鍵詞:引起甘肅省一起病毒性腦炎疫情的ECHO30全基因組序列分析 出處:《病毒學報》2017年04期  論文類型:期刊論文


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【摘要】:為了解引起2015年甘肅省酒泉市瓜州縣病毒性腦炎疫情的ECHO30的基因特點,分析其重組變異和進化規(guī)律,對從患者腦脊液標本中分離到的3株ECHO30進行全基因序列測定和分析,采用Simplot3.5.1軟件進行重組分析,并利用MEGA6.0軟件構建系統(tǒng)進化樹。結果表明,本次疫情中分離到的ECHO30與E30/SD/2010/CHN株的相似度最高(92%~99%)。重組分析表明甘肅ECHO30株在非結構蛋白區(qū)P2區(qū)和P3區(qū)出現(xiàn)了多處重組現(xiàn)象。由于對當?shù)亓餍械哪c道病毒譜不清楚,雖然發(fā)現(xiàn)此次流行的病毒存在重組,但是對重組片段的來源尚不明確,因此需要加強對甘肅省流行腸道病毒的本底調(diào)查工作和遺傳背景的研究工作。
[Abstract]:In order to understand the gene characteristics of viral encephalitis caused by viral encephalitis in Guazhou County of Jiuquan City Gansu Province in 2015 the recombination variation and evolution were analyzed. Three strains of ECHO30 isolated from cerebrospinal fluid (CSF) were sequenced and analyzed by Simplot3.5.1 software. The phylogenetic tree is constructed by using MEGA6.0 software. The results show that. The ECHO30 isolated from the epidemic had the highest similarity with E30 / SDR / 2010 / CHN strain. Recombination analysis showed that there were many recombination phenomena in P2 and P3 regions of non-structural protein region of Gansu ECHO30 strain. Although the recombination was found in this epidemic virus, the source of the recombinant fragment is still unclear. Therefore, it is necessary to strengthen the background investigation and genetic background study of the epidemic enterovirus in Gansu province.
【作者單位】: 甘肅省疾病預防控制中心;中國疾病預防控制中心病毒病預防控制所衛(wèi)生部醫(yī)學病毒和病毒病重點實驗室;瓜州縣疾病預防控制中心;
【基金】:國家“十二五”艾滋病和病毒性肝炎等重大傳染病防治科技重大專項(項目號:2012ZX10004-208),題目:甘肅及周邊省區(qū)傳染病病原譜流行規(guī)律研究 2014年甘肅省衛(wèi)生行業(yè)科研計劃管理項目(項目號:GWGL2014-75),題目:甘肅省手足口病病原變異變遷研究~~
【分類號】:R440;R512.3
【正文快照】: 病毒性腦炎(Virus encephalitis,VE)是一種常見的中樞神經(jīng)系統(tǒng)感染性疾病,該病重癥病死率高,易造成不同程度的神經(jīng)系統(tǒng)后遺癥[1],是嚴重影響世界公共衛(wèi)生的主要疾病之一。引起病毒性腦炎的病毒種類較多,根據(jù)之前的國內(nèi)外報道有130多種病毒可引起腦炎病變[1,2]。其中人類腸道病

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