面向乳腺癌數(shù)據(jù)的單純復(fù)形建模方法及拓?fù)洳蛔兞糠治?/H1>

發(fā)布時間：2024-03-02 10:07

　　乳腺癌是一種常見癌癥,其預(yù)防和治療具有重要意義,miRNA能抑制蛋白質(zhì)編碼進(jìn)而影響乳腺癌的發(fā)展。通過miRNA表達(dá)水平數(shù)據(jù)能夠?qū)θ橄侔┻M(jìn)行早期診斷,篩選乳腺癌生物標(biāo)志物。單純復(fù)形是一種拓?fù)浞治龇椒?其中的Q分析方法能分析樣本間的拓?fù)溥B通性,該方法適用于miRNA間復(fù)雜交互作用的分析,通過離心率、單純形顯著性和單純形相似度等拓?fù)洳蛔兞?分析數(shù)據(jù)的內(nèi)部結(jié)構(gòu),進(jìn)而揭示miRNA與乳腺癌的聯(lián)系。本文基于乳腺癌組織的miRNA表達(dá)水平數(shù)據(jù)建立單純復(fù)形進(jìn)行Q分析,提出了三種Q分析分類算法和重要特征識別方法。為建立單純復(fù)形,對每個miRNA表達(dá)水平進(jìn)行核密度估計,實(shí)現(xiàn)在統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)下設(shè)定閾值并保留miRNA表達(dá)水平分布的多樣性,將多個分位數(shù)點(diǎn)作為閾值把數(shù)據(jù)矩陣轉(zhuǎn)化為多個鄰接矩陣,建立單純復(fù)形并進(jìn)行Q分析,使用多維數(shù)聚集熵和系統(tǒng)復(fù)雜度考察拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)變化。計算miRNA在同一組織中、不同閾值下的單純形顯著性、離心率等拓?fù)洳蛔兞?基于多個閾值形成拓?fù)洳蛔兞康姆植?在不同組織中保持拓?fù)洳蛔兞糠植家恢碌膍iRNA被認(rèn)為與乳腺癌無關(guān)并剔除出數(shù)據(jù)集�；谏鲜鰡渭儚�(fù)形構(gòu)造方法,來自共同受試者的203個樣本為訓(xùn)練集,以此建...

【文章頁數(shù)】：66 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖3-3單純復(fù)形示例

否則采用同樣的方式處理對于某個分矩陣后，再進(jìn)行單純復(fù)形的計算，本文涉及多次單純復(fù)形的生成，有必要在單純將介紹基于MATLAB的單純復(fù)形生成算法在矩陣，所以算法從一個關(guān)聯(lián)矩陣開始介紹，以下純形，a，b，c，d，e，f為單純形的屬性將成圖3-3的單純復(fù)形，圖3-4....

圖3-4單純形示例

34σt35σt36σt圖3-4單純形示例3.2.3構(gòu)造索引矩陣對（3-5）矩陣內(nèi)各行進(jìn)行比較，該矩陣為ijAa,矩陣的第i行記為iR，構(gòu)造索引矩陣ijMm，其中TijijmRR,即第i行和第j行間同時為....

圖3-6正常組織的HQ熵的熱力圖

圖3-5癌組織的HQ熵的熱力圖

哈爾濱工業(yè)大學(xué)理學(xué)碩士學(xué)位論文而H會發(fā)生變化，即H對拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)的變化更敏感同時，兩者存在qHHQ制關(guān)于單純復(fù)形的熵示意圖，圖3-5和圖3-6為癌組織和正常組織的HQ熵?zé)崃D，圖3-7和圖3-8為癌組織和正常組織的H熵對應(yīng)的熱力圖，橫軸為中用....

本文編號：3916714

suoshi

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