ADaM應(yīng)用于臨床試驗的研究與探討
本文選題:ADaM + SDTM ; 參考:《東南大學(xué)》2017年碩士論文
【摘要】:近些年來,臨床數(shù)據(jù)交換標準協(xié)會(Clinical Data Interchange Standards Consortium,CDISC)標準已經(jīng)獲得越來越多的關(guān)注,并且成功實施CDISC的公司在逐漸增加。據(jù)調(diào)查顯示,近一半的北美制藥公司在使用CDISC標準,并且這個比率隨著時間的推移,還在不斷升高。在國內(nèi),部分企業(yè)及組織已經(jīng)率先將CDSIC應(yīng)用于臨床試驗中,并積累了相當(dāng)?shù)慕?jīng)驗。研究數(shù)據(jù)制表模型(Study Data Tabulation Model,SDTM)是收集試驗數(shù)據(jù)的標準模型,而分析數(shù)據(jù)模型(CDISC Analysis Data Model,ADaM)則側(cè)重于提供標準的分析數(shù)據(jù)模型,在熟悉及應(yīng)用SDTM之后,如何實施ADaM變得不可避免。ADaM標準可有助于監(jiān)管部門,更好的理解統(tǒng)計分析數(shù)據(jù)及結(jié)果,并提高審閱效率。本文通過對比B公司數(shù)據(jù)集(Operational Acquisition Datasets,OAD)與SDTM數(shù)據(jù)集,總結(jié)其優(yōu)缺點,并通過比較實施ADaM的幾種方法,驗證基于OAD產(chǎn)生ADaM數(shù)據(jù)集的可行性。通過ADaM元數(shù)據(jù)定義和映射,呈現(xiàn)從OAD獲得ADaM數(shù)據(jù)集的過程。同時對ADaM域中各變量進行歸類總結(jié),分析實施ADaM過程中可能存在的優(yōu)化空間,通過具體實施這些優(yōu)化流程,結(jié)合一套成熟的宏系統(tǒng),快速高效地產(chǎn)生ADaM數(shù)據(jù)集。研究目的通過對比OAD和ADaM數(shù)據(jù)集,分析驗證混合法產(chǎn)生ADaM數(shù)據(jù)集的可行性,并探討其在臨床數(shù)據(jù)管理的應(yīng)用前景。通過分析并優(yōu)化創(chuàng)建ADaM數(shù)據(jù)集的過程,結(jié)合SAS宏系統(tǒng)來實現(xiàn)這種優(yōu)化,并對優(yōu)化結(jié)果進行驗證。旨為ADaM使用者提供基本思路和基礎(chǔ)保障,并提供一些更快更具效率的方法。研究方法通過學(xué)習(xí)和研究B公司在應(yīng)用CDISC標準方面的經(jīng)驗,在引入ADaM相關(guān)概念的同時,結(jié)合自身實際工作經(jīng)驗,對比應(yīng)用ADaM的四種方法,即平行法,回顧法,線性法和混合法,探討其優(yōu)缺點,并分析混合法應(yīng)用于ADaM的可行性。這四種方法的分類,是根據(jù)產(chǎn)生ADaM和SDTM數(shù)據(jù)集的先后順序決定的,線性法是CDSIC最標準的方法,即先產(chǎn)生SDTM數(shù)據(jù)集,再產(chǎn)生ADaM數(shù)據(jù)集。而由于企業(yè)數(shù)據(jù)標準的存在,一般公司會采用混合法作為折中的辦法。本文將基于混合法,通過研究ADaM中可自動提取變量的數(shù)目,觀察三個不同階段臨床試驗,其中三個試驗分別是Ⅰ期腫瘤、Ⅱ期腫瘤、Ⅲ期抗菌,以五個ADaM數(shù)據(jù)集(ADSL、ADAE、ADLB、ADEX、ADVS)中可自動提取變量占比率為參考指標,并歸納驗證優(yōu)化的必要性和推廣的可行性。最后結(jié)合一套成熟的宏程序,以創(chuàng)建ADaM數(shù)據(jù)集所需時間作為主要參考因子,檢驗本文提供優(yōu)化方案是否更加有效,并對其進行優(yōu)劣分析。研究結(jié)果及結(jié)論可根據(jù)使用者的不同情況,制定不同的應(yīng)用方案,混合法更能發(fā)揮企業(yè)自身和CDISC標準兩者的優(yōu)勢,是一種目前較為理想且合理的方法。OAD與SDTM數(shù)據(jù)集在結(jié)構(gòu)和內(nèi)容上非常相似,也從另一個側(cè)面驗證基于OAD產(chǎn)生ADaM數(shù)據(jù)集的可行性。OAD是SDTM+數(shù)據(jù)集中的一種,使用者可根據(jù)自身情況,在形成獨特的SDTM+數(shù)據(jù)集的同時運用混合法。三個階段不同臨床試驗中,可自動提取變量的占比率都非常高,在一定程度上支持了優(yōu)化的必要性,同時通過簡化流程,理論上可以更快地創(chuàng)建ADaM數(shù)據(jù)集。最后,本文提供的優(yōu)化方案在時間上具有一定的優(yōu)勢,理論上支持了這種推廣的可行性,但是對于一般的CRO公司,出于多方面的考慮,可能這種優(yōu)化方案并不是最好的選擇,不過這種優(yōu)化思路具有相當(dāng)?shù)慕梃b和參考價值。
[Abstract]:In recent years, the Clinical Data Interchange Standards Consortium (CDISC) standard has gained more and more attention, and the successful implementation of CDISC companies is increasing. According to the survey, nearly half of North American pharmaceutical companies are using CDISC standards, and the ratio has gone by over time. In China, some enterprises and organizations have taken the lead in applying CDSIC to clinical trials and accumulated considerable experience. The Study Data Tabulation Model (SDTM) is the standard model for the collection of experimental data, and the analytical data model (CDISC Analysis Data Model, ADaM) focuses on the provision of standard analysis. The data model, after familiarity and application of SDTM, how to implement ADaM to become inevitable.ADaM standards can help the regulatory authorities to better understand the statistical analysis data and results and improve the review efficiency. This paper sums up its advantages and disadvantages by comparing the B data set (Operational Acquisition Datasets, OAD) with the SDTM data set, and through comparison. Compare several methods of implementing ADaM to verify the feasibility of generating ADaM data sets based on OAD. Through the definition and mapping of ADaM metadata, the process of obtaining ADaM data sets from OAD is presented. At the same time, each variable in the ADaM domain is classified and summarized, the possible optimization space that may exist in the process of implementing ADaM is analyzed, and these optimization processes are implemented, and a combination of these optimization processes is combined. Set the mature macro system to produce ADaM data sets quickly and efficiently. By comparing OAD and ADaM data sets, the feasibility of producing ADaM data sets by mixing method is analyzed and verified, and the prospect of its application in clinical data management is discussed. By analyzing and optimizing the path of ADaM data set, this optimization is realized with SAS macro system. The optimization results are verified. The purpose is to provide basic ideas and basic guarantees for ADaM users and to provide some faster and more efficient methods. By studying and studying the experience of B companies in the application of CDISC standards, and by introducing the concepts of ADaM and combining their own practical experience, four methods of applying ADaM are compared. Parallel method, retrospective method, linear method and mixed method, discuss its advantages and disadvantages, and analyze the feasibility of applying mixed method to ADaM. The classification of these four methods is based on the order of generating ADaM and SDTM data sets. The linear method is the most standard method of CDSIC, that is, to generate the SDTM data set first, and then to produce the ADaM dataset. In this paper, we will observe three different stages of clinical trials by studying the number of variables that can be automatically extracted in ADaM, and three of them are stage I, stage II, and stage III, with five ADaM data sets (ADSL, ADAE, ADLB, ADEX, ADVS). The ratio of automatic extraction of variables is the reference index, and the necessity and feasibility of the optimization are verified and verified. Finally, a set of mature macro programs is used to establish the time required to create ADaM data set as the main reference factor. According to the different circumstances of the user, different applications are made, and the hybrid method can give full play to the advantages of both the enterprise itself and the CDISC standard. It is an ideal and reasonable method at present..OAD and SDTM data sets are very similar in structure and content, and the feasibility of.OAD to produce ADaM data sets based on OAD is also verified from another side, SDTM+ is SDTM+ One kind of data set, users can use the mixed method to form unique SDTM+ data sets at the same time according to their own conditions. In three different clinical trials, the proportion of automatic variables can be automatically extracted, which supports the necessity of optimization to a certain extent, and through the simplified process, the ADaM number can be created faster in theory. Finally, the optimization scheme provided in this paper has some advantages in time, and it supports the feasibility of this extension theoretically. But for the general CRO company, the optimization scheme may not be the best choice for many aspects, but this optimization idea has considerable reference and reference value.
【學(xué)位授予單位】:東南大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:R969.4;O213
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,本文編號:1902836
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