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閉環(huán)腦-機(jī)接口中大鼠海馬及皮層集群鋒電位實(shí)時(shí)解碼算法的研究

發(fā)布時(shí)間:2020-07-26 21:14
【摘要】:理解大腦的結(jié)構(gòu)與功能,是21世紀(jì)最具挑戰(zhàn)性的前沿科學(xué)問題,腦科學(xué)研究在世界范圍得到了廣泛關(guān)注和大量投入。腦-機(jī)接口(Brain-Machine Interface,BMI)通過在大腦與外部設(shè)備之間建立直接的通路,可以在不依賴于脊髓/外周圍神經(jīng)和肌肉系統(tǒng)的情況下實(shí)現(xiàn)大腦與外界的交互。傳統(tǒng)的開環(huán)腦-機(jī)接口在分析短暫的神經(jīng)活動(dòng)事件方面有所局限,而閉環(huán)腦-機(jī)接口則可以提供因果性的證據(jù)。通過實(shí)時(shí)解碼讀取或檢測(cè)到神經(jīng)活動(dòng)事件的發(fā)生是形成閉環(huán)反饋的前提,現(xiàn)代多電極記錄技術(shù)的進(jìn)步已經(jīng)實(shí)現(xiàn)了多腦區(qū)、上千路神經(jīng)信號(hào)通道的同時(shí)采集,擴(kuò)大可以實(shí)時(shí)解碼分析的數(shù)據(jù)規(guī)模和提高神經(jīng)信號(hào)解碼分析的速度已經(jīng)成為了神經(jīng)科學(xué)研究的新興主題。許多閉環(huán)反饋實(shí)驗(yàn)要求極低的檢測(cè)延時(shí),典型的場(chǎng)景包括依賴對(duì)神經(jīng)活動(dòng)中突變進(jìn)行檢測(cè)的應(yīng)用。針對(duì)大量數(shù)據(jù)采集通道下難以進(jìn)行實(shí)時(shí)解碼的問題,本文提出了一種利用GPU的并行處理能力進(jìn)行加速的算法,通過兩個(gè)內(nèi)核算法的設(shè)計(jì)和片上存儲(chǔ)的優(yōu)化,顯著提高了計(jì)算速度和可以實(shí)時(shí)計(jì)算的數(shù)據(jù)規(guī)模。利用加速算法對(duì)仿真數(shù)據(jù)和大鼠海馬體、皮層及丘腦實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行位置編碼的解碼,結(jié)果顯示相對(duì)于CPU上的解碼算法,本文中的算法實(shí)現(xiàn)了 20-50倍的加速效果。針對(duì)海馬體回放事件的在線分析鑒別問題,基于并行算法的實(shí)時(shí)解碼能力,本文通過有效的緩存和隨機(jī)索引策略,對(duì)利用大量隨機(jī)亂序數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)顯著性分析方法進(jìn)行了優(yōu)化,使用1000個(gè)亂序樣本時(shí)該方法的計(jì)算延遲在15毫秒以內(nèi),實(shí)現(xiàn)了對(duì)海馬體回放事件實(shí)的時(shí)在線顯著性評(píng)價(jià)。針對(duì)神經(jīng)活動(dòng)中的突變檢測(cè)問題,本文在泊松線性動(dòng)態(tài)系統(tǒng)模型的基礎(chǔ)上引入了非高斯動(dòng)態(tài)噪聲來建模隱變量空間的隨機(jī)跳變過程。為了在非高斯噪聲和非高斯似然函數(shù)的條件下有效估計(jì)隱變量的后驗(yàn)概率,本文提出了用于突變檢測(cè)問題的粒子濾波和平滑算法,并采用GPU加速了計(jì)算。對(duì)仿真數(shù)據(jù)和實(shí)驗(yàn)記錄的急性疼痛神經(jīng)鋒電位數(shù)據(jù)的分析表明了這一算法的有效性。在突變檢測(cè)算法的基礎(chǔ)上,本文還設(shè)計(jì)并實(shí)現(xiàn)了一個(gè)基于該算法的在線腦-機(jī)接口系統(tǒng),該系統(tǒng)采用多個(gè)線程管理采集、訓(xùn)練、解碼、顯示等任務(wù),在減少系統(tǒng)延遲的同時(shí)實(shí)現(xiàn)了靈活的配置和管理。
【學(xué)位授予單位】:浙江大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:R318;TN911.7
【圖文】:

波形,鋒電位,閉環(huán)


1.2.1.3基于鋒電位信號(hào)的閉環(huán)腦-機(jī)接口系統(tǒng)的組成逡逑基于鋒電位的閉環(huán)腦-機(jī)接口的組成主要包括神經(jīng)信號(hào)采集模塊、神經(jīng)信號(hào)解析模逡逑塊、外部裝置控制模塊和反饋模塊,如圖1.2所示。逡逑1)神經(jīng)信號(hào)采集模塊逡逑神經(jīng)信號(hào)采集模塊主要包含兩個(gè)部分:植入式微電極陣列和多通道信號(hào)采集系統(tǒng)。逡逑目前廣泛應(yīng)用的植入式微電極陣列主要包括金屬微絲電極(microwire)和硅襯底電極逡逑(silicon-based邋electrodes)。金屬烎絲電極是一段直徑約為數(shù)十至數(shù)百微米的金屬絲,由逡逑絕緣材料包裹,僅尖端裸露。每根電極采集到的鋒電位波形和幅度會(huì)因相對(duì)神經(jīng)元的逡逑距離和方向而不同,這為根據(jù)信號(hào)波形來分析每個(gè)鋒電位信號(hào)的來源,即鋒電位分類逡逑(spike邋sorting)提供了更多的信息,因此常見將每?jī)筛蛎克母姌O纏繞在一起進(jìn)行記逡逑錄,即兩管微電極(stereotrode)或四管微電極(tetrode),實(shí)際使用時(shí),每個(gè)植入的電極逡逑束通常包含16-64根微絲電極。圖1.3A顯示了一種金屬微絲電極陣列,放大圖像左側(cè)逡逑為兩管微電極,右側(cè)為四管微電極,圈內(nèi)線段表示100微米長(zhǎng)度|1()11。微絲電極在植入逡逑過程中容易彎曲而難以精確定位

模塊圖,微電極陣列,神經(jīng)信號(hào),模塊


公司的密歇根陣列微電極,放大圖顯示每個(gè)管腳上電極點(diǎn)的分布[17]。多通道信號(hào)采集逡逑系統(tǒng)對(duì)微電極陣列探測(cè)到的電信號(hào)進(jìn)行濾波放大等處理和緩存、記錄,以供后續(xù)分析逡逑使用。目前主流的商用采集系統(tǒng)如圖1.4所示,主要包括Plexon公司的OmniPlex(圖1.4逡逑A)、Blackrock邋microsystem邋公司的邋Cerebus?(圖邋1.4邋B)系統(tǒng)和邋NeuraLynx邋公司的邋Digital逡逑Lynx系統(tǒng)(圖1.4C)等,這些系統(tǒng)體積龐大,價(jià)格昂貴,因此越來越多的人也開始選逡逑擇來自開源項(xiàng)目OpenEphys?(圖1.4邋D)的硬件和軟件或是利用開源組件自己搭建采集逡逑系統(tǒng)。逡逑mm逡逑圖1.3植入式微電極陣列逡逑2)

多通道信號(hào),神經(jīng)信號(hào),制水,泵閥


公司的密歇根陣列微電極,放大圖顯示每個(gè)管腳上電極點(diǎn)的分布[17]。多通道信號(hào)采集逡逑系統(tǒng)對(duì)微電極陣列探測(cè)到的電信號(hào)進(jìn)行濾波放大等處理和緩存、記錄,以供后續(xù)分析逡逑使用。目前主流的商用采集系統(tǒng)如圖1.4所示,主要包括Plexon公司的OmniPlex(圖1.4逡逑A)、Blackrock邋microsystem邋公司的邋Cerebus?(圖邋1.4邋B)系統(tǒng)和邋NeuraLynx邋公司的邋Digital逡逑Lynx系統(tǒng)(圖1.4C)等,這些系統(tǒng)體積龐大,價(jià)格昂貴,因此越來越多的人也開始選逡逑擇來自開源項(xiàng)目OpenEphys?(圖1.4邋D)的硬件和軟件或是利用開源組件自己搭建采集逡逑系統(tǒng)。逡逑mm逡逑圖1.3植入式微電極陣列逡逑2)

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3 趙坤W

本文編號(hào):2771298


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