運(yùn)用計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)尋找黃連抗腫瘤生物堿成分.以"黃連"為關(guān)鍵詞,在TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)中搜索生物堿類化學(xué)成分,從Pubchem數(shù)據(jù)庫(kù)下載相應(yīng)化合物結(jié)構(gòu);再?gòu)牡鞍踪|(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)中下載與抗腫瘤作用明確的17個(gè)靶點(diǎn)蛋白,采用Sybyl軟件中蛋白質(zhì)預(yù)處理工具確定活性區(qū)域,應(yīng)用Surflex-dock模塊對(duì)小分子與靶蛋白進(jìn)行分子對(duì)接,通過(guò)Total Score打分函數(shù)篩選出活性成分,采用Discovery Studio軟件分析結(jié)合最好的蛋白復(fù)合體的相互作用力.篩選出具有較好結(jié)合活性的化合物9個(gè),其中非洲防己堿、巴馬亭、N-反式-阿魏酰酪胺具有多靶標(biāo)活性;蛋白復(fù)合體的分析結(jié)果顯示氫鍵、疏水作用力在對(duì)接中發(fā)揮著重要作用. 

【文章來(lái)源】：中南民族大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,39(02)

【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)

【部分圖文】：

小檗堿與組蛋白去乙�；阜肿訉�(duì)接效果圖

非洲防己堿與17個(gè)靶蛋白進(jìn)行分子對(duì)接后,與環(huán)氧合酶-2結(jié)合最好,Total score為7.5269(圖2). 從圖2c可以看出,疏水相互作用力在此對(duì)接中起重要作用;同時(shí)非洲防己堿與GLN192、PHE518、SER530形成了氫鍵,與SER353和GLN192形成C—H鍵.2.3.3 表小檗堿與3-磷酸肌醇依賴性蛋白激酶1相互作用

N-反式-阿魏酰酪胺與17個(gè)靶蛋白進(jìn)行分子對(duì)接后,與環(huán)氧合酶-2結(jié)合最好,Total score為8.7050;其對(duì)接效果見圖7. 從圖6c可以看出,疏水相互作用力在此對(duì)接中起重要作用;同時(shí)N-反式-阿魏酰酪胺與GLN192、PHE518、SER530形成氫鍵.圖4 黃柏堿與Polo樣激酶-2分子對(duì)接效果圖

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于虛擬篩選的熱毒寧抗HRV 3C蛋白酶抑制劑作用的研究[J]. 林子峰,黃新安,徐培平,符林春.  中藥藥理與臨床. 2017(04)
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[4]黃連的藥理研究及現(xiàn)代應(yīng)用[J]. 王秀杰.  中國(guó)藥師. 2003(06)
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碩士論文
[1]黃連生物堿抗結(jié)腸癌作用實(shí)驗(yàn)及其分子機(jī)制研究[D]. 吳柯.重慶醫(yī)科大學(xué) 2007



本文編號(hào)：3277342