目的:采用整合生物信息學(xué)方法預(yù)測丹參治療心血管疾病的潛在機制。方法:從PubChem數(shù)據(jù)庫中搜索丹參靶標蛋白,從NCBI數(shù)據(jù)庫中搜索心血管疾病相關(guān)基因,利用IPA比較、分析搜索結(jié)果,預(yù)測丹參治療心血管疾病的交互作用分子網(wǎng)絡(luò)。結(jié)果:丹參治療心血管疾病的靶標蛋白主要有FASN、 PAFAH1B2、PLA2G7、PAFAH1B3和IL-1β,這些蛋白主要涉及LXR/RXR活化、動脈粥樣硬化、肝纖維化/肝星形細胞活化、急性反應(yīng)期信號、FXR/RXR活化等信號傳導(dǎo)通路;交互作用分子網(wǎng)絡(luò)主要涉及細胞運動、免疫細胞運輸、血液系統(tǒng)發(fā)育,參與DNA的復(fù)制、重組和修復(fù)等。結(jié)論:預(yù)測了丹參治療心血管疾病的幾個蛋白質(zhì)靶點以及參與的信號途徑;整合生物信息學(xué)方法可以用于分析小分子化學(xué)成分的作用機制。 

【文章來源】：鄭州大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2019,54(06)北大核心

【文章頁數(shù)】：4 頁

【部分圖文】：

生物信息學(xué)分析流程圖

個節(jié)點成為心血管疾病中丹參作用的直接靶點，包括FASN、PAFAH1B2、PLA2G7、PAFAH1B3和IL-1β(圖5)。圖2心血管疾病相關(guān)基因(左)及丹參靶標蛋白(右)涉及的信號通路圖3心血管疾病和丹參靶標蛋白共同涉及的信號通路左:網(wǎng)絡(luò)主要涉及細胞運動、免疫細胞運輸、血液系統(tǒng)發(fā)育、DNA的復(fù)制重組和修復(fù)等;右:網(wǎng)絡(luò)主要涉及脂代謝、小分子生物化學(xué)、血液系統(tǒng)發(fā)育等圖4兩個心血管疾病和丹參靶標蛋白共享的分子網(wǎng)絡(luò)圖5LXＲ/ＲXＲ活化(左)和動脈粥樣硬化(右)信號傳導(dǎo)通路的示意圖(深灰代表丹參靶點)3討論我們利用開放的與心血管疾病基因數(shù)據(jù)庫和已知或預(yù)測丹參作用的蛋白質(zhì)或蛋白質(zhì)片段數(shù)據(jù)庫，通過整合生物信息學(xué)分析方法，確定了一些與心血管疾病有關(guān)并受丹參調(diào)控的信號傳導(dǎo)通路和網(wǎng)絡(luò)，并且預(yù)測出與心血管疾病相關(guān)的幾個丹參作用的特異蛋白質(zhì)靶點，這為更詳細的機制研究提供了參考。我們的網(wǎng)絡(luò)分析結(jié)果提示，丹參治療心血管疾病的機制可能涉及細胞運動、免疫細胞運輸、血液系統(tǒng)發(fā)育，DNA的復(fù)制、重組和修復(fù)等。研究結(jié)果與體內(nèi)外若干研究的一致性提示丹參活性成分發(fā)揮心·008·鄭州大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版)2019年11月第54卷第6期

個節(jié)點成為心血管疾病中丹參作用的直接靶點，包括FASN、PAFAH1B2、PLA2G7、PAFAH1B3和IL-1β(圖5)。圖2心血管疾病相關(guān)基因(左)及丹參靶標蛋白(右)涉及的信號通路圖3心血管疾病和丹參靶標蛋白共同涉及的信號通路左:網(wǎng)絡(luò)主要涉及細胞運動、免疫細胞運輸、血液系統(tǒng)發(fā)育、DNA的復(fù)制重組和修復(fù)等;右:網(wǎng)絡(luò)主要涉及脂代謝、小分子生物化學(xué)、血液系統(tǒng)發(fā)育等圖4兩個心血管疾病和丹參靶標蛋白共享的分子網(wǎng)絡(luò)圖5LXＲ/ＲXＲ活化(左)和動脈粥樣硬化(右)信號傳導(dǎo)通路的示意圖(深灰代表丹參靶點)3討論我們利用開放的與心血管疾病基因數(shù)據(jù)庫和已知或預(yù)測丹參作用的蛋白質(zhì)或蛋白質(zhì)片段數(shù)據(jù)庫，通過整合生物信息學(xué)分析方法，確定了一些與心血管疾病有關(guān)并受丹參調(diào)控的信號傳導(dǎo)通路和網(wǎng)絡(luò)，并且預(yù)測出與心血管疾病相關(guān)的幾個丹參作用的特異蛋白質(zhì)靶點，這為更詳細的機制研究提供了參考。我們的網(wǎng)絡(luò)分析結(jié)果提示，丹參治療心血管疾病的機制可能涉及細胞運動、免疫細胞運輸、血液系統(tǒng)發(fā)育，DNA的復(fù)制、重組和修復(fù)等。研究結(jié)果與體內(nèi)外若干研究的一致性提示丹參活性成分發(fā)揮心·008·鄭州大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版)2019年11月第54卷第6期


本文編號：3143027