【摘要】：利用GLM模型對(duì)12個(gè)表達(dá)序列標(biāo)簽(expressed sequence tag,EST)標(biāo)記的基因型與鯉耐低溫性狀進(jìn)行相關(guān)性分析,然后使用OneMap軟件將這些EST標(biāo)記進(jìn)行連鎖定位研究,并通過(guò)Blast x搜索引擎對(duì)這些候選EST進(jìn)行注釋。結(jié)果顯示,EST標(biāo)記CC009(P0.05)和CC115(P0.01)與鯉魚(yú)耐低溫性狀顯著相關(guān);12個(gè)EST標(biāo)記中有8個(gè)標(biāo)記分別連鎖定位到6個(gè)連鎖群中,其中與耐低溫相關(guān)的CC009和CC115分別定位到鯉連鎖圖譜的第38號(hào)連鎖群和第2號(hào)連鎖群;蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)同源性比對(duì)發(fā)現(xiàn),CC009與斑馬魚(yú)(Danio rerio)尿嘧啶激酶1(uridine-cytidine kinaseI)的同源性高達(dá)94%;而CC115為原綠球藻(Prochlorococcus marinus str)的假定糖基轉(zhuǎn)移酶(putative glycosyl transferase)的同源性為56%。
[Abstract]:GLM model was used to analyze the correlation between the genotypes of 12 expression sequence tag (expressed sequence tag,EST) markers and the chilling tolerance traits of common carp, and then the linkage mapping of these EST markers was studied by OneMap software. These candidate EST are annotated by Blast x search engine. The results showed that EST markers CC009 (P0.05) and CC115 (P0.01) were significantly correlated with the low temperature tolerance of carp. Of the 12 EST markers, 8 were linked to 6 linkage groups, among which CC009 and CC115, which were related to low temperature tolerance, were located in the linkage group 38 and 2 of the linkage map of common carp respectively. The homology of CC009 and (Danio rerio) uropyrimidine kinase 1 (uridine-cytidine kinaseI) in protein database was as high as 94, while that of CC115 as the hypothetical glycosyltransferase (putative glycosyl transferase) of Chlorella (Prochlorococcus marinus str) was 56.5%.
【作者單位】： 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院黑龍江水產(chǎn)研究所;上海海洋大學(xué)水產(chǎn)與生命學(xué)院;
【基金】：國(guó)家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃“973”(2010CB126305) 農(nóng)業(yè)部水產(chǎn)生物技術(shù)重點(diǎn)開(kāi)放實(shí)驗(yàn)室(2009NYBZS-05) 中央級(jí)公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專(zhuān)項(xiàng)資金項(xiàng)目(2009HSYZX-SJ-05)
【分類(lèi)號(hào)】：S917.4;Q953

【參考文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 林娜;小麥新品種川農(nóng)16品質(zhì)性狀雜種優(yōu)勢(shì)研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2005年

2 方蕾;我國(guó)上市公司債務(wù)期限結(jié)構(gòu)的影響因素研究[D];武漢理工大學(xué);2007年

3 李廣周;重慶市產(chǎn)業(yè)集群與產(chǎn)業(yè)競(jìng)爭(zhēng)力關(guān)系研究[D];重慶大學(xué);2009年

4 孫增輝;企業(yè)生態(tài)倫理與營(yíng)銷(xiāo)績(jī)效的相關(guān)性研究[D];石家莊經(jīng)濟(jì)學(xué)院;2009年

5 張翔;基于BSC的商業(yè)銀行業(yè)務(wù)流程再造的執(zhí)行體系及實(shí)證研究[D];東華大學(xué);2005年

6 甄文棟;山東省城市酸沉降狀況及成因研究[D];山東大學(xué);2005年

7 安玉蓮;產(chǎn)業(yè)集群與區(qū)域競(jìng)爭(zhēng)力關(guān)系研究[D];中國(guó)海洋大學(xué);2005年

8 盧瑜佳;學(xué)習(xí)型組織維度及其對(duì)企業(yè)績(jī)效影響的研究[D];大連理工大學(xué);2006年

9 蔡振華;洪水頻率組合模型及工程應(yīng)用研究[D];武漢大學(xué);2005年

10 程艷萍;組織職業(yè)生涯管理對(duì)工作滿意度的影響研究[D];大連理工大學(xué);2006年

本文編號(hào)：2337957