目的:miRNA在急性髓系白血病(AML)的發(fā)生發(fā)展過程中發(fā)揮重要作用。目前有關(guān)miRNA的分子生物學(xué)研究中已取得了一定進(jìn)展,但miRNA在AML中的作用仍有待挖掘。本文旨在利用GEO數(shù)據(jù)庫篩選在復(fù)發(fā)難治性正常核型急性髓系白血病(NK-AML)中差異表達(dá)的miRNAs(Differentially Expressed miRNAs,DE miRNAs),并分析DE miRNAs在NK-AML中的作用。方法:1.利用在線數(shù)據(jù)庫GEO下載NK-AML骨髓或外周血組織的miRNA表達(dá)譜數(shù)據(jù),將數(shù)據(jù)分為復(fù)發(fā)難治組與無復(fù)發(fā)組,借助R軟件獲得兩組樣本中差異表達(dá)明顯的miRNAs,利用GraphPad Prism7軟件進(jìn)行生存分析,繪制生存曲線。2.通過在線預(yù)測網(wǎng)站預(yù)測DE miRNAs的靶基因,對靶基因進(jìn)行GO功能富集分析,KEGG通路富集分析,利用STRING數(shù)據(jù)庫和Cytoscape軟件構(gòu)建靶基因的蛋白-蛋白互作網(wǎng)絡(luò)(Protein-protein interaction network,PPI network),并找出其關(guān)鍵基因。3.利用GEO下載NK-AML外周血組織的基因表達(dá)譜數(shù)據(jù),分為...

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【學(xué)位級別】：碩士

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圖1miR-202-3p生存曲線

中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文63結(jié)果3.1差異miRNA的篩選從NCBI-GEO數(shù)據(jù)庫中下載GSE55770微陣列數(shù)據(jù)，此數(shù)據(jù)集比較特殊，我們只找到30個miRNA。使用校正后的P<0.1和|log2FC|>0.4作為篩選條件，我們獲得了兩個下調(diào)的差異miRNA：miR-202-3p....

圖2miR-15b-5p生存曲線

中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文7圖2miR-15b-5p生存曲線3.3靶基因預(yù)測結(jié)果對miR-202-3p、miR-15b-5p進(jìn)行靶基因預(yù)測，通過TargetScan和miRTarBase在線預(yù)測數(shù)據(jù)庫預(yù)測靶基因。預(yù)測到miR-202-3p靶基因數(shù)目分別為2915、206個，利用在線....

圖3無復(fù)發(fā)與復(fù)發(fā)難治性NK-AML差異miRNAs的靶基因預(yù)測

中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文7圖2miR-15b-5p生存曲線3.3靶基因預(yù)測結(jié)果對miR-202-3p、miR-15b-5p進(jìn)行靶基因預(yù)測，通過TargetScan和miRTarBase在線預(yù)測數(shù)據(jù)庫預(yù)測靶基因。預(yù)測到miR-202-3p靶基因數(shù)目分別為2915、206個，利用在線....

圖4miR-202-3p靶基因GO及KEGG富集分析

中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文10圖4miR-202-3p靶基因GO及KEGG富集分析

本文編號：3932934