長鏈非編碼RNA的表達(dá)情況和許多疾病病理過程的發(fā)生密切相關(guān)。它們可能是診斷、預(yù)后和治療這些疾病的重要生物標(biāo)志物。推斷潛在的lncRNA-疾病關(guān)聯(lián)性對于揭示疾病的發(fā)病機(jī)制、開發(fā)新的藥物以及優(yōu)化個(gè)性化治療至關(guān)重要。然而,驗(yàn)證lncRNA-疾病相關(guān)性的生物學(xué)實(shí)驗(yàn)是非常耗時(shí)和昂貴的,開發(fā)有效的計(jì)算模型預(yù)測lncRNA-疾病關(guān)聯(lián)性已成為計(jì)算生物學(xué)的重要研究課題。本文基于網(wǎng)絡(luò)間隨機(jī)游走算法,提出了一種新的基于網(wǎng)絡(luò)的方法預(yù)測潛在的lncRNA-疾病關(guān)聯(lián)。首先,計(jì)算疾病語義相似性、lncRNA功能相似性和基因功能相似性用于構(gòu)造疾病相似性網(wǎng)絡(luò)、lncRNA相似性網(wǎng)絡(luò)和基因相似性網(wǎng)絡(luò)。接著在3個(gè)網(wǎng)絡(luò)中融入lncRNA-疾病、lncRNA-基因和基因-疾病關(guān)聯(lián)信息。最后,在3個(gè)網(wǎng)絡(luò)中進(jìn)行若干個(gè)隨機(jī)游走步驟,從而推斷疾病與相應(yīng)網(wǎng)絡(luò)中l(wèi)ncRNA之間的關(guān)系。應(yīng)用該模型到LncRNADisease2.0數(shù)據(jù)庫中的lncRNA-疾病、lncRNA-基因以及CREEDS數(shù)據(jù)庫中的基因-疾病的關(guān)聯(lián)信息數(shù)據(jù),利用10倍交叉驗(yàn)證法和受試者工作特征曲線下面積的大小評估該模型的預(yù)測效果。研究結(jié)果表明,與其他算法相比,該算法有更...

【文章頁數(shù)】：50 頁

【學(xué)位級別】：碩士

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圖２．１胃癌的本體圖??最新的ＤＯ版本包含９０６９個(gè)Ｄ０１Ｄ疾病術(shù)語，其中６２％的術(shù)語有文本定義

浙江理工大學(xué)碩士學(xué)位論文?基于網(wǎng)絡(luò)間隨機(jī)游走算法預(yù)測ＩｎｃＲＮＡ－疾病關(guān)聯(lián)性??／??１２５３??＼?／??ＪＥＩＳｉ??＇?．?．?４??：?’圓圓細(xì)??／??”一?ｒ??＼??＼??圖２．１胃癌的本體圖??最新的ＤＯ版本包含９０６９個(gè)Ｄ０１Ｄ疾病術(shù)語，其中６２％的術(shù)語有文本定....

圖４．１網(wǎng)絡(luò)隨機(jī)游走算法結(jié)構(gòu)框架??

浙江理工大學(xué)碩士學(xué)位論文?基于網(wǎng)絡(luò)間隨機(jī)游走算法預(yù)測ＩｎｃＲＮＡ－疾病關(guān)聯(lián)性??疾病語義相似性網(wǎng)絡(luò)?ＩｎｃＲＮＡ功能相似性網(wǎng)絡(luò)??圈！麵??職ｒ：???Ｉ??基Ｗｉ５義相似性Ｈ絡(luò)??一?＿預(yù)》的ｌｎｄＭ－ｆｆｅ病關(guān)聯(lián)??圖４．１網(wǎng)絡(luò)隨機(jī)游走算法結(jié)構(gòu)框架??４．２計(jì)算疾病語義相似性....

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