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基于深度學習的出生缺陷關系抽取及知識圖譜的構建

發(fā)布時間:2021-02-09 07:47
  出生缺陷是指胎兒在形成發(fā)育時期形成的機體結構、代謝或功能異常等,它嚴重影響著出生人口質量和兒童的生命健康,使得患兒的生活質量得不到保障。此外,它還給患者家庭帶來了沉重的精神和經濟壓力。目前國內關于出生缺陷的相關統(tǒng)計信息較少,缺乏對出生缺陷疾病相關信息系統(tǒng)性地整合,這對出生缺陷的防預和治療非常不利。針對這個問題,本研究基于共現的方法,從PubMed歷年文獻中篩選出生缺陷與表型/癥狀、基因、致畸物/藥物等共同出現的句子。首先,本文對這些句子進行了假陽性處理,根據遠程監(jiān)督的思想,利用UMLS定義的關系,人工給句子中兩個實體標注關系,從而建立起出生缺陷相關的語料庫。然后,利用人工標注好的語料庫訓練了三種不同的深度學習關系抽取模型,分別為Bi-LSTM+Attention、PCNN+Attention和BERT+Softmax模型。本文依據這三種模型的預測結果,采用多數表決和高置信度的方法,生成最終的關系抽取預測模型以得到<實體,關系,實體>三元組。接下來將三元組相關信息存儲在圖數據庫Neo4j中,構建了出生缺陷領域的知識圖譜。最后,利用訓練好的預測模型對新句子進行預測從而推斷出句子... 

【文章來源】:華東師范大學上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數】:81 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于深度學習的出生缺陷關系抽取及知識圖譜的構建


知識圖譜構建流程圖

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Word2vec的兩種訓練模型

結構圖,單元,結構圖,畢業(yè)論文


華東師范大學碩士學位畢業(yè)論文25圖2-2LSTM單元結構圖LSTM單元組成的單層網絡結構如圖2-3所示:圖2-3LSTM網絡結構圖輸入門(InputGate)主要用來控制當前時刻的輸入,決定當前時刻的輸入有多少可以被保存到單元(Cell)狀態(tài)。遺忘門(ForgetGate)控制著上一時刻的單元狀態(tài)有多少“記憶”可以被保留至當前時刻。它使得神經網絡具有了選擇記憶

【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于BI-GRU-CRF模型的中文分詞法[J]. 車金立,唐力偉,鄧士杰,蘇續(xù)軍.  火力與指揮控制. 2019(09)
[2]知識圖譜技術綜述[J]. 徐增林,盛泳潘,賀麗榮,王雅芳.  電子科技大學學報. 2016(04)
[3]出生缺陷概況及產前篩查[J]. 吳怡,程蔚蔚.  中國計劃生育和婦產科. 2016(01)
[4]大型中醫(yī)藥知識圖譜構建研究[J]. 于彤,劉靜,賈李蓉,張竹綠,楊碩,劉麗紅,李敬華,于琦.  中國數字醫(yī)學. 2015(03)
[5]孕中期產前篩查/產前診斷在減少出生缺陷中的價值[J]. 張方芳,徐永蓮,張光艷,劉佳,侯麗娜,伍文霞,余沂菲.  中國婦幼保健. 2013(28)
[6]出生缺陷的相關因素及預防現狀分析[J]. 曾小玲.  現代診斷與治療. 2012(06)

碩士論文
[1]基于深度學習的中文文本實體關系抽取研究與實現[D]. 佘恒.北京郵電大學 2019
[2]融合上下文信息的漢語分詞方法研究[D]. 李質軒.北京交通大學 2018



本文編號:3025311

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